{"id":100887,"date":"2018-03-11T10:22:30","date_gmt":"2018-03-11T10:22:30","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/desarrollo-de-un-microarray-para-la-identificacion-de-genes-de-resistencia-a-patogenos-de-interes-industrial-en-rodaballo-scophthalmus-maximus\/"},"modified":"2018-03-11T10:22:30","modified_gmt":"2018-03-11T10:22:30","slug":"desarrollo-de-un-microarray-para-la-identificacion-de-genes-de-resistencia-a-patogenos-de-interes-industrial-en-rodaballo-scophthalmus-maximus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/santiago-de-compostela\/desarrollo-de-un-microarray-para-la-identificacion-de-genes-de-resistencia-a-patogenos-de-interes-industrial-en-rodaballo-scophthalmus-maximus\/","title":{"rendered":"Desarrollo de un microarray para la identificaci\u00f3n de genes de resistencia a pat\u00f3genos de inter\u00e9s industrial en rodaballo (scophthalmus maximus)"},"content":{"rendered":"

Tesis doctoral de Adri\u00e1n Mill\u00e1n P\u00e9rez <\/strong><\/h2>\n

El rodaballo (scophthalmus maximus; scophthalmidae; pleuronectiformes) es un pez plano de gran importancia para la acuicultura en europa, y especialmente en galicia. Las enfermedades infecciosas en los peces cultivados constituyen uno de los factores limitantes del \u00e9xito y viabilidad de la acuicultura en todas las etapas de la producci\u00f3n. Aeromonas salmonicida y philasterides dicentrarchi son dos de los pat\u00f3genos que causan mayores p\u00e9rdidas en la producci\u00f3n del rodaballo, pero poco se sabe acerca de la interacci\u00f3n hospedador-pat\u00f3geno y los mecanismos moleculares que puedan conferir resistencia a estas enfermedades. En el presente estudio se ha analizado la respuesta inmune del rodaballo frente a estos dos pat\u00f3genos de inter\u00e9s industrial mediante una estrategia de gen\u00f3mica funcional, que incluy\u00f3 el desarrollo de una base de datos de ests, el dise\u00f1o de un oligo-microarray y su aplicaci\u00f3n para la identificaci\u00f3n de genes y funciones g\u00e9nicas reguladas a lo largo de una serie temporal en tres \u00f3rganos relacionados con el sistema inmune. a partir del arnm de h\u00edgado, ri\u00f1\u00f3n anterior y bazo de individuos infectados y controles se construyeron tres librer\u00edas de adnc que se utilizaron para la secuenciaci\u00f3n masiva de ests. De esta forma se ampliaron considerablemente los escasos recursos gen\u00f3micos existentes en el rodaballo. Estas secuencias fueron gestionadas mediante una base de datos desarrollada con herramientas bioinform\u00e1ticas propias y p\u00fablicas. De las 3.482 secuencias \u00fanicas de la base de datos, el 49,3% no mostraron similitud significativa con secuencias conocidas y el 23,4% pudieron anotarse y clasificarse usando los t\u00e9rminos go. M\u00e1s del 25% de los genes anotados en la base de datos aparecieron relacionados con la defensa o inmunidad. La base de datos de ests result\u00f3 tambi\u00e9n de gran utilidad para la identificaci\u00f3n y desarrollo de marcadores asociados a genes de inter\u00e9s, as\u00ed como para dise\u00f1ar por primera vez un oligo-microarray en rodaballo para el an\u00e1lisis de la respuesta inmune. El microarray se constituy\u00f3 finalmente con 2.716 oligos de las 3.482 secuencias \u00fanicas existentes en la base de datos. El an\u00e1lisis de las fuentes de error mediante un dise\u00f1o jerarquizado y aplicando un an\u00e1lisis de la varianza (anova) de efectos aleatorios permiti\u00f3 comprobar la elevada reproducibilidad de la se\u00f1al (r>0,99) y diseccionar la variabilidad asociada a los diferentes factores estudiados. El factor biol\u00f3gico represent\u00f3 la principal fuente de variaci\u00f3n. Los datos obtenidos sugieren que este oligo-microarray representa una herramienta robusta para analizar los perfiles de expresi\u00f3n g\u00e9nica y detectar genes diferencialmente expresados relacionados con la respuesta a pat\u00f3genos del rodaballo. el an\u00e1lisis de los perfiles de expresi\u00f3n g\u00e9nica permiti\u00f3 obtener un mapa de genes bloqueados por \u00f3rgano. Adem\u00e1s, se detectaron 536 genes diferencialmente expresados (de: 19,7% del total) a lo largo de los puntos temporales y \u00f3rganos analizados. La respuesta a la infecci\u00f3n con a. Salmonicida fue mucho m\u00e1s intensa que la detectada frente a p. Dicentrarchi. Los genes regulados fueron clasificados seg\u00fan los t\u00e9rminos go en tres grandes categor\u00edas relacionadas con el sistema inmune (56,1%), con el metabolismo (33,7%) y con los procesos celulares (10,2%). El h\u00edgado fue el m\u00e1s reactivo y espec\u00edfico (290 genes: 65,5% del total) de los \u00f3rganos estudiados, seguido del bazo (262: 44,3%) y el ri\u00f1\u00f3n anterior (185: 28,1%). La funci\u00f3n inmune result\u00f3 progresivamente m\u00e1s importante en h\u00edgado, bazo y ri\u00f1\u00f3n anterior, al rev\u00e9s de lo que se observ\u00f3 con el metabolismo y el transporte. Comparando los genes regulados entre los dos pat\u00f3genos, se observaron 315 genes espec\u00edficos de respuesta a a. Salmonicida y s\u00f3lo 65 a p. Dicentrarchi, comparti\u00e9ndose 156. Al agrupar los genes regulados por funciones, se observ\u00f3 una distribuci\u00f3n de funciones muy similar entre los tres \u00f3rganos. El an\u00e1lisis comparativo de los patrones de expresi\u00f3n de los genes regulados por \u00f3rganos permiti\u00f3 detectar 54 genes que mostraron diferencias significativas en respuesta a a. Salmonicida y 12 en respuesta a p. Dicentrarchi. Los genes inmunes regulados en respuesta a a. Salmonicida y p. Dicentrarchi comprendieron la respuesta inmune innata y la adaptativa. En el presente estudio se detect\u00f3 sobre-expresi\u00f3n de la \u00c2\u00bf-2 macroglobulina en respuesta a p. Dicentrarchi, pero infra-expresi\u00f3n en respuesta a a. Salmonicida. Todo el sistema del interfer\u00f3n, incluyendo los diferentes genes inducidos por su respuesta y la prote\u00edna mx, se mostr\u00f3 sobre-expresado en respuesta a aeromonas e infra-expresado en respuesta a philasterides. La presentaci\u00f3n de ant\u00edgenos por el mhc i tambi\u00e9n se detect\u00f3 sobre-expresada en respuesta a aeromonas. Se identificaron adem\u00e1s dos formas diferentes del complemento c3 sobre-expresadas, pero tambi\u00e9n otras del c9 sobre-expresadas. El componente c4 se mostr\u00f3 sobre-expresado s\u00f3lo en respuesta a aeromonas, mientras que en respuesta a philasterides s\u00f3lo se activ\u00f3 el c8. Los datos de expresi\u00f3n obtenidos con qrt-pcr mostraron una correlaci\u00f3n elevada y altamente significativa (0,952: p<0,001) con los obtenidos con el oligo-microarray. este estudio representa el an\u00e1lisis preliminar de los perfiles de expresi\u00f3n de los genes regulados en respuesta a las infecciones con a. Salmonicida y p. Dicentrarchi. Se han detectado numerosos genes regulados que proporcionan nuevas herramientas para la comprensi\u00f3n de los modelos de infecci\u00f3n en rodaballo, aunque tambi\u00e9n se identificaron otros muchos cuyas funciones est\u00e1n por definir. Los trabajos desarrollados a partir de esta aproximaci\u00f3n inicial deber\u00e1n profundizar en su conocimiento y en sus roles en la respuesta a las infecciones y en la inmunidad. Los datos obtenidos permitir\u00e1n avanzar en la mejora sanitaria del cultivo comercial del rodaballo mediante su aplicaci\u00f3n en planes de selecci\u00f3n para la consecuci\u00f3n de reproductores m\u00e1s resistentes a estas patolog\u00edas.\n\n\n\n \n\n\n

Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00abDesarrollo de un microarray para la identificaci\u00f3n de genes de resistencia a pat\u00f3genos de inter\u00e9s industrial en rodaballo (scophthalmus maximus)<\/strong>\u00ab<\/h3>\n
    \n
  • T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Desarrollo de un microarray para la identificaci\u00f3n de genes de resistencia a pat\u00f3genos de inter\u00e9s industrial en rodaballo (scophthalmus maximus) <\/li>\n
  • Autor:<\/strong>\u00a0 Adri\u00e1n Mill\u00e1n P\u00e9rez <\/li>\n
  • Universidad:<\/strong>\u00a0 Santiago de compostela<\/li>\n
  • Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 14\/05\/2010<\/li>\n<\/ul>\n

     <\/p>\n

    Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n
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    • Director de la tesis<\/strong>\n
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      • Paulino Mart\u00ednez Portela<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n
      • Tribunal<\/strong>\n
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        • Presidente del tribunal: laura S\u00e1nchez pi\u00f1\u00f3n <\/li>\n
        • Antonio Figueras huerta (vocal)<\/li>\n
        • pilar \u00e1lvarez pellitero (vocal)<\/li>\n
        • julio Coll morales (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n

           <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

          Tesis doctoral de Adri\u00e1n Mill\u00e1n P\u00e9rez El rodaballo (scophthalmus maximus; scophthalmidae; pleuronectiformes) es un pez plano de gran importancia para […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[39902,2119,1946,977],"tags":[205274,2547,3033,3204,21099,8585],"class_list":["post-100887","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-acuicultura-marina","category-genetica-animal","category-produccion-animal","category-santiago-de-compostela","tag-adrian-millan-perez","tag-antonio-figueras-huerta","tag-julio-coll-morales","tag-laura-sanchez-pinon","tag-paulino-Martinez-portela","tag-pilar-alvarez-pellitero"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/100887","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=100887"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/100887\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=100887"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=100887"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=100887"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}