{"id":101358,"date":"2010-04-06T00:00:00","date_gmt":"2010-04-06T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/interacciones-entre-activadores-y-represores-en-el-inicio-de-la-transcripcion-en-saccharomyces-cerevisiae\/"},"modified":"2010-04-06T00:00:00","modified_gmt":"2010-04-06T00:00:00","slug":"interacciones-entre-activadores-y-represores-en-el-inicio-de-la-transcripcion-en-saccharomyces-cerevisiae","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/bioquimica\/interacciones-entre-activadores-y-represores-en-el-inicio-de-la-transcripcion-en-saccharomyces-cerevisiae\/","title":{"rendered":"Interacciones entre activadores y represores en el inicio de la transcripci\u00f3n en saccharomyces cerevisiae."},"content":{"rendered":"

Tesis doctoral de Lorena Peir\u00f3 Chova <\/strong><\/h2>\n

Esta tesis doctoral se centra en el estudio de las interacciones entre activadores y represores en el inicio de la transcripci\u00f3n en saccharomyces cerevisiae. el inicio de este trabajo fue el intento de encontrar las causas moleculares de la interacci\u00f3n gen\u00e9tica entre bur6-1 (componente del represor transcripcional nc2) y dbp5-2 (factor de exportaci\u00f3n) (estruch y cole, 2003). Para ello se llev\u00f3 a cabo un rastreo gen\u00f3mico en busca de supresores multicopia de la letalidad sint\u00e9tica entre estas dos mutaciones, con lo que se identific\u00f3 una versi\u00f3n truncada de la subunidad de la rna pol ii, rpb2p (rpb2t). La sobre-expresi\u00f3n de rpb2t tambi\u00e9n es capaz de suprimir la letalidad sint\u00e9tica entre mot1-301 (otro represor transcripcional) y dbp5-2, as\u00ed como las deficiencias en el crecimiento del mutante sencillo dbp5-2 a temperatura semi-restrictiva de 34\u00c2\u00bac y los defectos en el crecimiento de los mutantes en los componentes de nc2. con la finalidad de conseguir comprender mejor la funci\u00f3n de nc2, se llev\u00f3 a cabo un rastreo gen\u00f3mico en busca de mutaciones supresoras del requerimiento de nc2 para el crecimiento celular. La mayor\u00eda de los supresores, a los que llamamos supresores snd (suppressors of nc2 depletion), se encontraron en genes que codifican componentes bien conocidos de la maquinaria b\u00e1sica de transcripci\u00f3n: 5 mutaciones en iwr1………………Interacting with rna pol ii 3 mutaciones en ymr185w………..Funci\u00f3n desconocida (no ha sido objeto de estudio de esta tesis doctoral) 8 mutaciones en nut2\/med10….Componente mediador 1 mutaciones en tfb1……………….Componente de tfiih 1 mutaciones en rpb7……………….Subunidad rna pol ii 1 mutaciones en med7……………..Componente mediador 1 mutaciones en srb2……………….Componente mediador la naturaleza de la mayor\u00eda de los supresores identificados en este trabajo sugiere que la detenci\u00f3n del crecimiento de c\u00e9lulas con actividad nc2 reducida ser\u00eda consecuencia de un aumento del nivel de transcripci\u00f3n, y que los supresores funcionar\u00edan reduciendo dicho nivel. As\u00ed pues, la funci\u00f3n esencial de nc2 para el crecimiento resultar\u00eda de su papel como represor transcripcional. Se podr\u00eda postular que la reducci\u00f3n de nc2 podr\u00eda aumentar el acceso de la rna pol ii a los promotores, provocando un aumento en la transcripci\u00f3n que causar\u00eda la inviabilidad celular. Los supresores actuar\u00edan alterando la conformaci\u00f3n de un componente espec\u00edfico de la holoenzima (mediador, tfiih o la propia rna pol ii) de tal modo que provocar\u00edan una disminuci\u00f3n de la afinidad por otros componentes de la holoenzima, con la consiguiente disminuci\u00f3n del acceso de la rna pol ii a los promotores. Pero se han identificado mutaciones en componentes para los que se postula un efecto negativo en la transcripci\u00f3n (como el m\u00f3dulo srb8-11 del mediador) que son capaces de compensar parcialmente la reducci\u00f3n de nc2, al igual que se han identificado deleciones en factores con un efecto positivo en la transcripci\u00f3n (rpb9p, med2p, med3p y gal11p) que empeoran los defectos en el crecimiento causados por actividad reducida de nc2. Por tanto, se puede concluir que la relaci\u00f3n entre nc2 y componentes de la maquinaria de activaci\u00f3n transcripcional parece ser muy compleja y a\u00fan se desconocen los mecanismos funcionales que relacionan al uno con los otros (peir\u00f3-chova y estruch, 2007). la segunda parte de la tesis se centra en la identificaci\u00f3n, caracterizaci\u00f3n y estudio de iwr1, otro supresor del requerimiento de nc2 encontrado en nuestro rastreo gen\u00f3mico. Iwr1p ha sido recientemente identificada, mediante aproximaciones prote\u00f3micas globales, como un factor transcripcional evolutivamente conservado, que co-purifica con la pr\u00e1ctica totalidad de las subunidades de la rna pol ii, as\u00ed como con tfiif y con los factores de elongaci\u00f3n transcripcional spt4\/spt5 y dst1 (krogan et al., 2006). Tambi\u00e9n se han identificado interacciones gen\u00e9ticas y f\u00edsicas con componentes de la maquinaria b\u00e1sica de transcripci\u00f3n y con factores de exportaci\u00f3n de mrnas. el rasgo com\u00fan de los supresores de nc2 identificados en el rastreo gen\u00f3mico es que son componentes de la maquinaria b\u00e1sica de transcripci\u00f3n con un papel positivo en el inicio de la transcripci\u00f3n. En nuestro laboratorio se demostr\u00f3 el papel positivo de iwr1p en el inicio de la transcripci\u00f3n por la capacidad de esta prote\u00edna de activar la transcripci\u00f3n cuando se une artificialmente a un promotor de un gen reportero. Adem\u00e1s, hemos encontrado que la localizaci\u00f3n de iwr1p no es est\u00e1tica, sino que viaja entre el n\u00facleo y el citoplasma de manera dependiente de xpo1p. Aunque iwr1 no es un gen esencial, su deleci\u00f3n empeora ligeramente el crecimiento celular, hecho que puede estar relacionado con los defectos en la transcripci\u00f3n g\u00e9nica mostrada por el mutante iwr1. La deleci\u00f3n de iwr1 conduce a una expresi\u00f3n alterada de genes que codifican componentes de la fosforilaci\u00f3n oxidativa y de genes regulados por amino\u00e1cidos (arg1), por fuente de carbono (suc2 y gal10) o por deficiencia de fosfato (pho5 y pho84), pero el efecto en la expresi\u00f3n de estos genes es muy diferente. La deleci\u00f3n de iwr1 aumenta la expresi\u00f3n basal, pero no la inducida, de los genes atp16 y arg1, mientras que iwr1p est\u00e1 involucrada en la inducci\u00f3n de los genes suc2, gal1, pho5 y pho84, sugiri\u00e9ndose que la necesidad de iwr1p es espec\u00edfica de gen. En el caso de suc2, iwr1p altera espec\u00edficamente la inducci\u00f3n tard\u00eda de este gen, hecho que podr\u00eda ser consecuencia de su papel en la eliminaci\u00f3n de la represi\u00f3n ejercida por mig1p. La funci\u00f3n de iwr1p se requiere para la remodelaci\u00f3n normal de la cromatina en el promotor del gen pho5 que se produce en condiciones de baja concentraci\u00f3n de fosfato en el medio, y que es necesaria para el reclutamiento del factor transcripcional pho4p y la rna pol ii. A pesar de su papel en la expersi\u00f3n g\u00e9nica, no se detecta (mediante chrip) asociaci\u00f3n de iwr1p a la cromatina de sus genes diana. Por tanto, es posible que la asociaci\u00f3n de iwr1p con la rna pol ii tenga lugar cuando la enzima no est\u00e1 unida a dna. De esta manera, iwr1p participar\u00eda regulando el reclutamiento de la rna pol ii a promotores espec\u00edficos, pero abandonar\u00eda a la rna pol ii antes de la uni\u00f3n de \u00e9sta al dna (peir\u00f3-chova y estruch, 2009). a pesar de todos los resultados recopilados, se necesitar\u00edan aun m\u00e1s estudios para esclarecer el mecanismo molecular a trav\u00e9s del cual iwr1p participa en la regulaci\u00f3n transcripcional de sus genes diana. bibliograf\u00eda: 1.- Estruch, f. And cole, c.N. 2003. An early function during transcription for the yeast mrna export factor dbp5p\/rat8p suggested by its genetic and physical interactions with transcription factor iih components. Mol biol cell 14, 1664-1676. 2.- Krogan et al. 2006. Global landscape of protein complexes in the yeast saccharomyces cerevisiae. Nature 440, 637-643. 3.- Peir\u00f3-chova, l. And estruch, f., 2007. Specific defects in different transcription complexes compensate for the requirement of the negative cofactor 2 repressor in saccharomyces cerevisiae. Genetics 176, 125-138. 4.- Peir\u00f3-chova, l. And estruch, f., 2009. The yeast rna polymerase ii associated factor iwr1p is involved in the basal and regulated transcription of specific genes. J biol chem 284, 28958-28967.<\/p>\n

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Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00abInteracciones entre activadores y represores en el inicio de la transcripci\u00f3n en saccharomyces cerevisiae.<\/strong>\u00ab<\/h3>\n
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  • T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Interacciones entre activadores y represores en el inicio de la transcripci\u00f3n en saccharomyces cerevisiae. <\/li>\n
  • Autor:<\/strong>\u00a0 Lorena Peir\u00f3 Chova <\/li>\n
  • Universidad:<\/strong>\u00a0 Universitat de val\u00e9ncia (estudi general)<\/li>\n
  • Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 04\/06\/2010<\/li>\n<\/ul>\n

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    Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n
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    • Director de la tesis<\/strong>\n
        \n
      • Francisco Estruch Ros<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n
      • Tribunal<\/strong>\n
          \n
        • Presidente del tribunal: fernando Moreno sanz <\/li>\n
        • susana Rodr\u00edguez navarro (vocal)<\/li>\n
        • Francisco Navarro gomez (vocal)<\/li>\n
        • olga m. Calvo Garc\u00eda (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n

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