{"id":102871,"date":"2018-03-11T10:25:11","date_gmt":"2018-03-11T10:25:11","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/metodos-y-aplicaciones-para-el-analisis-funcional-en-bioinformatica-functional-analysis-methods-and-applications-in-bioinformatics\/"},"modified":"2018-03-11T10:25:11","modified_gmt":"2018-03-11T10:25:11","slug":"metodos-y-aplicaciones-para-el-analisis-funcional-en-bioinformatica-functional-analysis-methods-and-applications-in-bioinformatics","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/metodos-y-aplicaciones-para-el-analisis-funcional-en-bioinformatica-functional-analysis-methods-and-applications-in-bioinformatics\/","title":{"rendered":"M\u00e9todos y aplicaciones para el an\u00e1lisis funcional en bioinform\u00e1tica. (functional analysis methods and applications in bioinformatics)"},"content":{"rendered":"

Tesis doctoral de Miguel V\u00e1zquez Garc\u00eda <\/strong><\/h2>\n

Esta tesis tiene como objetivo principal desarrollar m\u00e9todos para el an\u00e1lisis funcional de resultados de experimentos de alto rendimiento, y acompa\u00f1ar estos m\u00e9todos de aplicaciones \u00fatiles y f\u00e1ciles de usar por los investigadores. En concreto, se busc a desarrollar m\u00e9todos enmarcados dentro de las tres alternativas descritas en la secci\u00f3n anterior: enriquecimiento de anotaciones en bases de datos biol\u00f3gicas, miner\u00eda de texto de art\u00edculos de biomedicina, y meta-an\u00e1lisis usando repositorios de datos de microarrays de expresi\u00f3n g\u00e9nica. los objetivos planteados han sido alcanzados mediante el desarrollo de tres aplicaciones: * genecodis: una aplicaci\u00f3n para el an\u00e1lisis de enriquecimiento de co-anotaciones para diversas bases de datos. El an\u00e1 lisis no se basa solo en buscar anotaciones sobre-representadas, sino tambi\u00e9n en buscar combinaciones de estas. La aplicaci\u00f3n ofrece un rico interfaz web que presenta los datos en diversos formatos, incluyendo tablas y gr\u00e1ficos. * sent: una aplicaci \u00f3n de miner\u00eda de textos que, dada una lista de genes, los agrupa bas\u00e1ndose en la distribuci\u00f3n de las palabras que aparecen en el conjunto de art\u00edculos asociados a cada gen. Estos grupos, adem\u00e1s, vienen acompa\u00f1ados de una colecci\u00f3n de palabras que ind ican aquellas caracter\u00edsticas descritas en dichos art\u00edculos que justifican este agrupamiento. adicionalmente, incluye una herramienta para explorar los art\u00edculos ordenados de acuerdo a su relevancia respecto a estas caracter\u00edsticas. * marq: una apli caci\u00f3n de meta-an\u00e1lisis que ofrece una base de datos de firmas de expresi\u00f3n, es decir, descripciones someras de patrones de expresi\u00f3n diferencial, para un repositorio de datos de microarrays que contiene gran parte de los datasets de \u00abthe gene expre ssion omnibus’ para 5 organismos modelo. La herramienta permite recuperar aquellas firmas que son m\u00e1s parecidas a la firma especificada como query en la aplicaci\u00f3n, y, adicionalmente, ofrece funcionalidades de meta-an\u00e1lisis, tal y como se describ\u00eda en la secci\u00f3n de objetivos. para el desarrollo de la aplicaci\u00f3n sent se hace uso de la aplicaci\u00f3n bionmf, que ofrece la funcionalidad de an\u00e1lisis de factorizaci\u00f3n no negativa de matrices en un entorno de alto rendimiento, y que fue integrada tambi\u00e9 n en la infraestructura de servicios web. Tambi\u00e9n para la aplicaci\u00f3n sent se desarroll\u00f3 una suite de funcionalidades de miner\u00eda de textos, de la cual cabe destacar un sistema de reconocimiento de entidades nombradas con aplicaci\u00f3n espec\u00edfica para la<\/p>\n

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Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00abM\u00e9todos y aplicaciones para el an\u00e1lisis funcional en bioinform\u00e1tica. (functional analysis methods and applications in bioinformatics)<\/strong>\u00ab<\/h3>\n
    \n
  • T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 M\u00e9todos y aplicaciones para el an\u00e1lisis funcional en bioinform\u00e1tica. (functional analysis methods and applications in bioinformatics) <\/li>\n
  • Autor:<\/strong>\u00a0 Miguel V\u00e1zquez Garc\u00eda <\/li>\n
  • Universidad:<\/strong>\u00a0 Complutense de Madrid<\/li>\n
  • Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 14\/07\/2010<\/li>\n<\/ul>\n

     <\/p>\n

    Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n
      \n
    • Director de la tesis<\/strong>\n
        \n
      • Juan Pavon Mestras<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n
      • Tribunal<\/strong>\n
          \n
        • Presidente del tribunal: gonzalo Pajares martinsanz <\/li>\n
        • Carlos \u00f3scar S\u00e1nchez sorzano (vocal)<\/li>\n
        • pedro Larra\u00f1aga mugica (vocal)<\/li>\n
        • angel Rubio diaz cordoves (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n

           <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

          Tesis doctoral de Miguel V\u00e1zquez Garc\u00eda Esta tesis tiene como objetivo principal desarrollar m\u00e9todos para el an\u00e1lisis funcional de resultados […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[125900,54122,31564,38697,208507,45386],"class_list":["post-102871","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-sin-categoria","tag-angel-rubio-diaz-cordoves","tag-carlos-oscar-sanchez-sorzano","tag-gonzalo-pajares-martinsanz","tag-juan-pavon-mestras","tag-miguel-vazquez-garcia","tag-pedro-larranaga-mugica"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/102871","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=102871"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/102871\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=102871"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=102871"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=102871"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}