{"id":103995,"date":"2018-03-11T10:26:46","date_gmt":"2018-03-11T10:26:46","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/identificacion-de-nuevos-genes-diana-del-factor-inducible-por-hipoxia-hif-mediante-tecnicas-computacionales\/"},"modified":"2018-03-11T10:26:46","modified_gmt":"2018-03-11T10:26:46","slug":"identificacion-de-nuevos-genes-diana-del-factor-inducible-por-hipoxia-hif-mediante-tecnicas-computacionales","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/identificacion-de-nuevos-genes-diana-del-factor-inducible-por-hipoxia-hif-mediante-tecnicas-computacionales\/","title":{"rendered":"Identificacion de nuevos genes diana del factor inducible por hipoxia hif mediante tecnicas computacionales"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Amaya Ortiz Barahona <\/strong><\/h2>\n<p>La respuesta transcripcional mediada por el factor inducible por hipoxia hif es esencial para la adaptaci\u00f3n celular en condiciones de ox\u00edgeno limitantes. Por tanto, el conocimiento del conjunto completo de genes regulados por este factor es necesario para entender los mecanismos celulares que rigen la respuesta a hipoxia tanto en condiciones fisiol\u00f3gicas como patol\u00f3gicas. En este trabajo describimos una estrategia bioinform\u00e1tica, basada en la combinaci\u00f3n de la identificaci\u00f3n de sitios de uni\u00f3n de hif (hbss) y el meta\u00c2\u00bfan\u00e1lisis de perfiles de expresi\u00f3n g\u00e9nica provenientes de bases de datos p\u00fablicas, con la que obtenemos un listado de potenciales genes diana de hif. La comparaci\u00f3n de los candidatos obtenidos en este listado con los datos publicados de ensayos de chip\u00c2\u00bfchip para hif1\u00c2\u00bf indica un alto grado de sensibilidad (78%) y especificidad (97.7%) de la estrategia. Con el fin de validar esta estrategia llevamos a cabo ensayos de chip para hif1\u00c2\u00bf en un conjunto de potenciales genes diana. nuestros resultados confirmaron la fiabilidad de la estrategia a la hora de identificar sitios de uni\u00f3n de hif. Como resultado de este trabajo identificamos un conjunto de 216 potenciales dianas de hif de los que 152 no estaban previamente descritos. El an\u00e1lisis de ontolog\u00eda de este listado de estas 216 dianas revel\u00f3 una nueva funci\u00f3n biol\u00f3gica, hasta el momento no asociada a hif, como es la s\u00edntesis de gluc\u00f3geno. La validaci\u00f3n funcional de cuatro genes del listado implicados en la regulaci\u00f3n de esta v\u00eda, puso de manifiesto la importancia de esta nueva funci\u00f3n para la adaptaci\u00f3n celular a hipoxia mediada por hif. por otro lado, aprovechamos las predicciones de esta estrategia para identificar polimorfismos en los sitos hre predichos. Este estudio revel\u00f3 que estas variaciones pueden alterar la regulaci\u00f3n transcripcional mediada por hif. Como muestra de ello demostramos que el snp rs17004038, localizado en el hre funcional del gen que codifica para el factor inhibidor de la migraci\u00f3n de macr\u00f3fagos (mif), evita su inducci\u00f3n por hipoxia. en conjunto, nuestros resultados muestran que la estrategia propuesta en este trabajo es una poderosa herramienta para identificar dianas directas de hif, lo que permite incrementar nuestro conocimiento sobre la adaptaci\u00f3n celular a hipoxia. As\u00ed mismo, pone de manifiesto que pueden existir variaciones inter\u00c2\u00bfindividuales en esta respuesta.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Identificacion de nuevos genes diana del factor inducible por hipoxia hif mediante tecnicas computacionales<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Identificacion de nuevos genes diana del factor inducible por hipoxia hif mediante tecnicas computacionales <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Amaya Ortiz Barahona <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Aut\u00f3noma de Madrid<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 30\/09\/2010<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Luis Del Peso Ovalle<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: lLuis Montoliu jose <\/li>\n<li>Alberto Casc\u00f3n soriano (vocal)<\/li>\n<li>Mar\u00eda laura Garc\u00eda bermejo (vocal)<\/li>\n<li>Miguel Manzanares fourcade (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Amaya Ortiz Barahona La respuesta transcripcional mediada por el factor inducible por hipoxia hif es esencial para 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