{"id":104669,"date":"2010-04-11T00:00:00","date_gmt":"2010-04-11T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/estudios-en-fase-gas-de-biomoleculas-y-sus-microsolvatos\/"},"modified":"2010-04-11T00:00:00","modified_gmt":"2010-04-11T00:00:00","slug":"estudios-en-fase-gas-de-biomoleculas-y-sus-microsolvatos","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/valladolid\/estudios-en-fase-gas-de-biomoleculas-y-sus-microsolvatos\/","title":{"rendered":"Estudios en fase gas de biomol\u00e9culas y sus microsolvatos"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Vanesa Vaquero Vara <\/strong><\/h2>\n<p>El trabajo de investigaci\u00f3n presentado se centra en el estudio del espectro de rotaci\u00f3n de biomol\u00e9culas en fase gas.  la t\u00e9cnica experimental empleada es la espectroscop\u00eda de rotaci\u00f3n por transformaci\u00f3n de fourier en haces moleculares (mb-ftmw). Para el experimento se requiere que la muestra est\u00e9 en fase gas y, debido a los altos puntos de fusi\u00f3n de muchas de las mol\u00e9culas biol\u00f3gicas y a su inestabilidad t\u00e9rmica, se combina la ablaci\u00f3n l\u00e1ser posibilitando el estudio de este tipo de compuestos s\u00f3lidos. La combinaci\u00f3n de la ablaci\u00f3n l\u00e1ser (la) y la t\u00e9cnica mb-ftmw, para dar lugar a la t\u00e9cnica la-mb-ftmw, fue puesta a punto en el grupo de espectroscop\u00eda molecular de la universidad de valladolid y hasta el momento ha sido demostrada su aplicabilidad1-22.    los principales resultados obtenidos se resumen a continuaci\u00f3n.   \u00edY-alanina la \u00edY-alanina es el \u00edY-amino\u00e1cido m\u00e1s simple y el \u00fanico que existe en la naturaleza. Act\u00faa como neurotransmisor y adem\u00e1s tiene importancia a nivel astrof\u00edsico ya que se ha encontrado, en peque\u00f1as cantidades, en cierto tipo de meteoritos. La importancia de su estudio radica en su detecci\u00f3n en fase gas como mol\u00e9cula neutra y en la variedad de conf\u00f3rmeros que coexisten en fase gas. La investigaci\u00f3n de dicha mol\u00e9cula nos condujo a la observaci\u00f3n experimental de cuatro conf\u00f3rmeros, dos de ellos no vistos hasta el momento, gracias a la alta sensibilidad del espectr\u00f3metro. el art\u00edculo en el que se resumen los resultados obtenidos, fue aceptado en una revista de prestigio internacional:   \u00abthe shape of \u00edY-alanine\u00bb m. E. Sanz, a. Lesarri, m. I. Pe\u00f1a, v. Vaquero, v. Cortijo, j. C. L\u00f3pez and j. L. Alonso, j. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 3812-3817.  uracilo el uracilo es una base nitrogenada de tipo pirimid\u00ednico que forma parte de las cadenas de \u00e1cido ribonucleico o arn. El arn es el principal material gen\u00e9tico en los virus y desempe\u00f1a un papel esencial en la s\u00edntesis de prote\u00ednas. El objetivo del estudio ha sido la obtenci\u00f3n por primera vez de la estructura del uracilo en fase gas. La t\u00e9cnica experimental la-mb-ftmw ha permitido:     a\/ la resoluci\u00f3n y caracterizaci\u00f3n de la complicada estructura hiperfina del espectro de rotaci\u00f3n del uracilo, generada por la presencia de dos n\u00facleos con cuadrupolo.      b\/ la observaci\u00f3n de los espectros de rotaci\u00f3n de especies tautom\u00e9ricas de ox\u00edgeno, nitr\u00f3geno y carbono de escasa abundancia natural ( 0.2, 0.4 y 1.1%, respectivamente ). El an\u00e1lisis de estos espectros nos ha conducido a la obtenci\u00f3n de los par\u00e1metros estructurales de la mol\u00e9cula con una alta precisi\u00f3n. los resultados est\u00e1n en la actualidad publicados:  \u00abthe structure of uracil: a laser ablation rotational study\u00bb, v. Vaquero, m. E. Sanz, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, j. Phys. Chem. A., 2007, 111, 3443.  citosina la citosina es una base nitrogenada de tipo pirimid\u00ednico que se encuentra en los \u00e1cidos nucleicos, fundamentales para la persistencia de la vida. Nuestra investigaci\u00f3n nos ha conducido a los siguientes resultados y conclusiones:      a\/ se observaron cinco especies tautom\u00e9ricas en fase gas.     b\/ se resolvi\u00f3 por primera vez la estructura hiperfina originada por la presencia de tres \u00e1tomos de nitr\u00f3geno en cada una de estas especies observadas.     c\/  se determin\u00f3 el orden de estabilidades relativas entre ellos.   guanina se emprendi\u00f3 posteriormente el trabajo de investigaci\u00f3n de las bases nitrogenadas p\u00faricas. Para ello se eligi\u00f3 la guanina, y su estudio condujo a una publicaci\u00f3n en una revista de prestigio internacional22.   uracilo-agua el uracilo tiene una importancia biol\u00f3gica indiscutible. Es por esto que hemos querido ahondar m\u00e1s en el comportamiento de esta mol\u00e9cula, centr\u00e1ndonos ahora en uno de sus estados naturales en el medio biol\u00f3gico: el estado solvatado. se observ\u00f3 una de las posibles formas complejadas, de la que se han obtuvieron los valores espectrosc\u00f3picos necesarios para proponer su estructura.  los resultados est\u00e1n en la actualidad publicados23.  alanina-agua la mol\u00e9cula de la alanina aislada hab\u00eda sido previamente estudiada en nuestro laboratorio. Fue as\u00ed confirmada la presencia de dos de los conf\u00f3rmeros predichos. Con el conocimiento de su preferencia conformacional se emprendi\u00f3 el estudio de su microsolvataci\u00f3n. fueron observados el complejo 1:1 m\u00e1s estable de la alanina-agua, as\u00ed como el 1:2. El hito de tal experimento reside en la observaci\u00f3n por primera vez de un complejo de una biomol\u00e9cula con dos mol\u00e9culas de agua, teniendo en cuenta el uso de ablaci\u00f3n l\u00e1ser.  glicina-agua visto el \u00e9xito logrado en el estudio de la microsolvataci\u00f3n de la alanina (trabajo desarrollado el pasado a\u00f1o), se pas\u00f3 a experimentar de forma similar sobre la glicina. En este caso, el complejo 1:1 hab\u00eda sido ya observado y estudiado en nuestro laboratorio y publicado como portada de una revista de reconocido prestigio internacional12. El experimento nos condujo a la observaci\u00f3n del complejo 1:2 buscado similar al mismo encontrado para la alanina-agua.   \u00e1cidos \u00c2\u00bf-aminoisobut\u00edrico y 1-aminociclopropano-1-carbox\u00edlico se trata de dos an\u00e1logos del amino\u00e1cido natural alanina. Las disposiciones conformacionales en fase gas de cualquier mol\u00e9cula son consecuencia de la presencia de grupos funcionales entre los que se establecen interacciones intramolculares, as\u00ed como de las restricciones impuestas por los grupos laterales. Con objeto de explicar la preferencia estructural ya sabida de algunos amino\u00e1cidos naturales se ha pasado al estudio conformacional de sus especies an\u00e1logas. este estudio ha revelado la presencia en fase gas de las tres formas posibles de enlace de hidr\u00f3geno intramoleculares predichas para ambas mol\u00e9culas, de cada una de las cuales se han extra\u00eddo los datos espectrosc\u00f3picos relevantes. Para la alanina, al igual que para la gran mayor\u00eda de los amino\u00e1cidos estudiados, se ha demostrado la existencia de s\u00f3lo dos de estas interacciones intramoleculares en fase gas, aludiendo a la relajaci\u00f3n del tercero de ellos para explicar su carencia. \u00c2\u00bfpodemos entonces recurrir a la presencia de ciertos grupos laterales para evitar dichas relajaciones?. en la actualidad, el trabajo se considera concluido y a la espera de una versi\u00f3n escrita para su pronta publicaci\u00f3n.  prolina habi\u00e9ndose ya detectado dos conf\u00f3rmeros en el 2001, se decidi\u00f3 continuar el trabajo con objeto de encontrar dos especies m\u00e1s de energ\u00edas relativas inferiores a 1000 cm-1. Para ello fue incorporada alguna mejora instrumental logradas durante el \u00faltimo a\u00f1o, con la que se consigui\u00f3 mejorar la sensibilidad del instrumento.  una recopilaci\u00f3n de estos nuevos resultados ha sido ya aceptada en una revista internacional24.  1 a. Lesarri, s. Mata, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, rev. Sci. Instrum., 2003, 74, 4799. 2 a. Lesarri, s. Mata, e. J. Cocinero, s. Blanco, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, angew. Chem. Int. Ed., 2002, 41, 4673. 3 a. Lesarri, s. Mata, s. Blanco, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, j. Chem. Phys., 2004, 120, 6191. 4 s. Blanco, a. Lesarri, j. C. L\u00f3pez, j. L.Alonso, j. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11675. 5 a. Lesarri, e. J. Cocinero, j. C. L\u00f3pez, j. L.Alonso, angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 605.  6 a. Lesarri, r. S\u00e1nchez, e. J. Cocinero, j. C. L\u00f3pez, j. L.Alonso, j. Am. Chem. Soc.  2005, 127, 12952. 7 a. Lesarri, e. J. Cocinero, j. C. L\u00f3pez, j. L.Alonso, j. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2572. 8 a. Lesarri, e. J. Cocinero, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, chemphyschem, 2005, 6, 1559. 9 m. E. Sanz, v. Cortijo, w. Caminati, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, chem. Eur. J. 2006, 12, 2564.  0 m. E. Sanz, a. Lesarri, i. Pe\u00f1a, v. Vaquero, v. Cortijo, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, j. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 3812. 11 e. J. Cocinero, a. Lesarri, m. E. Sanz, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, chemphyschem. 2006, 7, 1481. 12 j. L. Alonso, e. J. Cocinero, a. Lesarri, m. E. Sanz, j. C. L\u00f3pez, angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 3471. 13 s. Blanco, j. C. L\u00f3pez, a. Lesarri, j. L. Alonso, j. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12111.  14 e. J. Cocinero, a. Lesarri, j.-U. Grabow, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, chemphyschem. 2007, 8, 599. 15 e. J. Cocinero, p. Villanueva, a. Lesarri, m. E. Sanz, s. Blanco, s. Mata, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, chem. Phys. Lett. 2007, 435, 336. 16 v. Vaquero, m. E. Sanz, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, j. Phys. Chem. A., 2007, 111, 3443. 17 j. C. L\u00f3pez , m. I. Pe\u00f1a, m. E. Sanz, j. L. Alonso, j. Chem. Phys., 2007, 126, 191103. 18 s. Blanco, m. E. Sanz, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, proc. Natl. Acad. Sci. Usa, 2007, 104, 20183. 19 m. E. Sanz, s. Blanco, s. Mata, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, contribution m7, isolated biomolecules and biomolecular interactions ibbi08, valladolid (spain), 13-18 april 2008. 20 m. E. Sanz, s. Blanco, j. C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, angew. Chem. Int. Ed., 2008, 120, 6312. 21 j. L. Alonso, c. P\u00e9rez, m. E. Sanz, j. C. L\u00f3pez, s. Blanco, phys.Chem. Chem. Phys., 2009, 11, 617. 22 j. L. Alonso, m. I. Pe\u00f1a, j. C. L\u00f3pez, v. Vaquero, angew. Chem. Int. Ed., Accepted. 23 j.C. L\u00f3pez, j. L. Alonso, i. Pe\u00f1a, v. Vaquero, phys. Chem. Chem. Phys., 2010, 12, 14128 24 s. Mata, v. Vaquero, c. Cabezas, m. I. Pe\u00f1a, c. P\u00e9rez, j. L. Alonso, j. C. L\u00f3pez, phys.Chem. Chem. Phys, 2009, 11, 4141.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Estudios en fase gas de biomol\u00e9culas y sus microsolvatos<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Estudios en fase gas de biomol\u00e9culas y sus microsolvatos <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Vanesa Vaquero Vara <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Valladolid<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 04\/11\/2010<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Juan  Carlos L\u00f3pez Alonso<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Jos\u00e9 Mar\u00eda Leal villalba <\/li>\n<li>Carlos Cativiela mar\u00edn (vocal)<\/li>\n<li>Ana isabel Jim\u00e9nez sanz (vocal)<\/li>\n<li>Jos\u00e9 Albaladejo p\u00e9rez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Vanesa Vaquero Vara El trabajo de investigaci\u00f3n presentado se centra en el estudio del espectro de rotaci\u00f3n 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