{"id":105940,"date":"2018-03-11T10:29:38","date_gmt":"2018-03-11T10:29:38","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/estructura-y-diversidad-genetica-de-poblaciones-bacterianas-en-la-rizosfera-de-olivo-olea-europaea-l-subsp-europaea-en-andalucia\/"},"modified":"2018-03-11T10:29:38","modified_gmt":"2018-03-11T10:29:38","slug":"estructura-y-diversidad-genetica-de-poblaciones-bacterianas-en-la-rizosfera-de-olivo-olea-europaea-l-subsp-europaea-en-andalucia","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/cordoba\/estructura-y-diversidad-genetica-de-poblaciones-bacterianas-en-la-rizosfera-de-olivo-olea-europaea-l-subsp-europaea-en-andalucia\/","title":{"rendered":"Estructura y diversidad genetica de poblaciones bacterianas en la rizosfera de olivo (olea europaea l. subsp. europaea) en andalucia"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Sergio Aranda Ocampo <\/strong><\/h2>\n<p>El olivo (olea europaea l. Subsp. Europaea) ha sido culturalmente y econ\u00f3micamente el principal cultivo oleaginoso de la cuenca mediterr\u00e1nea. Espa\u00f1a es el mayor productor de aceite de oliva en el mundo, y andaluc\u00eda, la regi\u00f3n sur del pa\u00eds, es el principal \u00e1rea de cultivo con 62% de la superficie de olivar en espa\u00f1a, ocupando >1.5 millones ha, y un 17% de su superficie total en un monocultivo impresionante. En espa\u00f1a, el olivo se puede encontrar en dos formas, silvestre (olea europaea l. Subsp. Europaea var. Sylvestris) y cultivada (olea europaea l. Subsp. Europaea var. Europaea). Las interacciones planta-microorganismo en la rizosfera y endosfera ha sido objeto de considerables estudios, ya que las comunidades bacterianas desempe\u00f1an un importante papel en el balance, desarrollo y funcionamiento del ecosistema suelo en diferentes sistemas agr\u00edcolas en muchas especies de plantas cultivadas. Esta tesis doctoral, se ha centrado en el estudio de la estructura y diversidad gen\u00e9tica de las comunidades bacterianas de la rizosfera de olivos cultivados y silvestres en andaluc\u00eda, determinando el papel que los sistemas de manejo del suelo y los factores asociados a la planta pueden tener sobre \u00e9stas. en espa\u00f1a, recientemente se han introducido m\u00e9todos alternativos del manejo del suelo para reducir al m\u00ednimo la vulnerabilidad de los olivares a la erosi\u00f3n del suelo, uno de los principales problemas para la sostenibilidad del olivo en andaluc\u00eda, incluyendo el no-laboreo combinado con el control mec\u00e1nico de malas hierbas, laboreo reducido con y sin control de malas hierbas y siembra de cubiertas vegetales en el oto\u00f1o y eliminaci\u00f3n de malas hierbas con herbicidas en la primavera y\/o posterior desbroce o pastoreo. En este trabajo, se utiliz\u00f3 el an\u00e1lisis ft-rflp (an\u00e1lisis del polimorfismos de longitud del fragmento de restricci\u00f3n terminal fluorescente) de las secuencias amplificadas de la regi\u00f3n 16s del adnr para estudiar las diferencias en la estructura de las comunidades bacterianas en muestras de suelo de 46 plantaciones comerciales de olivo org\u00e1nico y 12 \u00e1reas naturales cercanas con diferentes tipos de suelo. Las fincas de olivar estudiadas han estado sometidas a los diferentes sistemas de manejo de suelo durante largo tiempo en dos de las zonas m\u00e1s representativas para el cultivo de olivar en andaluc\u00eda, y representan ejemplos de sistemas agroforestales y plantaciones tradicionales. Nuestros resultados demostraron que dentro de cada finca de olivar tanto el tipo de suelo como el manejo de \u00e9ste contribuyeron en este orden a modificar la estructura y diversidad de las comunidades bacterianas de acuerdo a los valores de los \u00edndices de riqueza y shannon weiner. Los suelos de olivar de sierra morena con laboreo ligero o pastoreo con ovejas durante todo el a\u00f1o, presentaron mayores valores de estos \u00edndices de diversidad comparados con todos los sistemas de manejo del suelo en campi\u00f1a (laboreo convencional y cobertura del suelo con desbroce). Mediante este an\u00e1lisis ft-rflp algunos fragmentos de restricci\u00f3n terminal han sido identificados y asociados significativamente a sistemas de manejo de suelo espec\u00edficos, los cuales podr\u00edan ser utilizados en el futuro como indicadores para evaluar el efecto de cambios en el manejo de suelo en la modificaci\u00f3n de las propiedades biol\u00f3gicas del suelo incluyendo la calidad biol\u00f3gica del mismo. entre los \u00e1rboles cultivados y silvestres, el olivo es una de las especies de mayor longevidad y riqueza en variabilidad gen\u00e9tica. En espa\u00f1a, m\u00e1s de 200 variedades son actualmente cultivadas. En andaluc\u00eda ocho cultivares de olivo (hojiblanca, lech\u00edn de sevilla, manzanilla de sevilla, nevadillo negro, picual, picudo, y verdial de hu\u00e9var) representan >90% del \u00e1rea total cultivada, y nuevos cultivares (arbequina y frantoio) est\u00e1n siendo actualmente introducidos. En esta tesis doctoral, utilizando un enfoque tanto cultivo-dependiente e independiente (ft-rflp de las secuencias amplificadas de la regi\u00f3n 16s adnr),  evaluamos la influencia espec\u00edfica del genotipo de olivo, vivero de origen de los plantones, y el tiempo de incubaci\u00f3n en la estructura de las comunidades bacterianas as\u00ed como en las comunidades bacterianas cultivables totales  (bct) y pseudomonas fluorescentes (ps) en la rizosfera y endosfera de seis cultivares (arbequina, frantoio, hojiblanca, manzanilla de sevilla, picual, y picudo). Nuestros resultados indicaron que en primer lugar el vivero de origen, y en segundo lugar el genotipo del olivo, tuvieron una influencia significativa en la estructura de las comunidades iniciales y densidad de poblaci\u00f3n de bacterias cultivables en la rizosfera y endosfera. En general, los cultivares arbequina y frantoio mostraron los mayores niveles de densidad de poblaci\u00f3n. Asimismo, la estructura de las comunidades bacterianas de la rizosfera de seis cultivares de olivo muestreados en distintos tiempos de crecimiento fueron diferenciados en primer lugar en funci\u00f3n del tiempo de muestreo y en segundo lugar en funci\u00f3n del genotipo del olivo, con densidad de poblaciones de bct y ps manteni\u00e9ndose estables o incrementando sus niveles de densidad de poblaci\u00f3n durante el tiempo de crecimiento. en esta tesis doctoral, nuestra hip\u00f3tesis fue que ambas formas de olivo, cultivada y silvestre, pueden ser una importante fuente de variabilidad gen\u00e9tica la cual puede contener comunidades bacterianas en la rizosfera con importantes aplicaciones en la medicina, veterinaria, agricultura o industria. Mediante un enfoque de an\u00e1lisis polif\u00e1sico, examinamos la estructura y diversidad de las comunidades bacterianas en la rizosfera de olivos silvestres en andaluc\u00eda. Primero, utilizando la t\u00e9cnica de an\u00e1lisis ft-rflp de la regi\u00f3n 16s adnr, encontramos una alta heterogeneidad en la composici\u00f3n de las comunidades bacterianas de la rizosfera, sugiriendo la existencia de comunidades espec\u00edficas en funci\u00f3n del genotipo de la planta y localizaci\u00f3n geogr\u00e1fica, siendo cada reducto de acebuche un reservorio \u00fanico de diversidad. Posteriormente, investigamos el potencial antagonista de esas poblaciones bacterianas cultivables asociadas a la ra\u00edz. De un total de 675 aislados bacterianos de la rizosfera y endosfera de olivos silvestres, 94 (14%) mostraron una fuerte actividad antagonista in vitro contra v. Dahliae patotipo defoliante, el cual es considerado uno de los m\u00e1s importantes pat\u00f3genos que afectan al cultivo del olivo en el mundo. La proporci\u00f3n m\u00e1s alta de antagonistas se obtuvo de la rizosfera (59,6%) en comparaci\u00f3n con la endosfera (40,4%). En total, la mayor\u00eda de los antagonistas (entre un 58,5 a 78,3%), mostraron actividad proteol\u00edtica, lipol\u00edtica, quitinol\u00edtica, produjeron \u00e1cido indol-ac\u00e9tico y sider\u00f3foros. Mediante la secuenciaci\u00f3n del gen 16s del adnr, los antagonistas se identificaron indicando que la mayor\u00eda de las bacterias pertenecen al g\u00e9nero bacillus (56,4%), pseudomonas (27,7%) y paenibacillus (7,4%). Asimismo, varios de los aislados bacterianos que se identificaron no hab\u00edan sido citados previamente en olivo incluyendo acinetobacter sp. (3,2%), chryseobacterium vyrstaatense (2,1%), rhodococcus wratislaviensis (1,1%), y rahnella sp. (1,1%). En general, varias de estas bacterias mostraron un alto y gran n\u00famero de mecanismos de antagonismo, por lo que deben ser consideradas para futuros an\u00e1lisis como potenciales agentes de biocontrol contra v. Dahliae en olivo. finalmente, realizamos un intenso estudio centrado en nuevas bacterias pertenecientes a duganella spp. Con pigmentaci\u00f3n morada productoras de violace\u00edna con inter\u00e9s biotecnol\u00f3gico habitando la rizosfera de olivos silvestres y cultivados en el sur de espa\u00f1a. Mediante una caracterizaci\u00f3n fisiol\u00f3gica y bioqu\u00edmica, an\u00e1lisis filogen\u00e9tico de diferentes genes incluyendo 16s adnr, gyrb y vioa (implicado en la s\u00edntesis de violace\u00edna), aislamos e identificamos por primera vez duganella spp. Asociadas con la rizosfera de plantas le\u00f1osas en medio ambientes de clima mediterr\u00e1neos que son capaces de producir violace\u00edna, un metabolito secundario de color azul-morado con importantes aplicaciones biol\u00f3gicas, m\u00e9dicas e industriales de alto inter\u00e9s biotecnol\u00f3gico. Las siete cepas de duganella spp. Estudiadas pudieron ser identificadas como dos potenciales especies nuevas y fueron diferenciadas de acuerdo a su hu\u00e9sped de origen (duganella baetica en olivos silvestres versus duganella olivae en olivos cultivados). Todas las cepas de duganella spp. Produjeron violace\u00edna in vitro, con niveles de producci\u00f3n natural m\u00e1s altos (hasta x65) que los citados en la literatura para cepas de otras especies bacterianas productoras de violace\u00edna. Este alto rendimiento, hacen de estas bacterias buenas candidatas para su explotaci\u00f3n biotecnol\u00f3gica, ya que los bajos rendimientos en la producci\u00f3n de violace\u00edna se consideran una de las principales limitaciones de las cepas silvestres para su producci\u00f3n masiva y explotaci\u00f3n comercial. Aunque no se demostr\u00f3 actividad inhibidora in vitro frente a bacterias gram-negativas y hongos fitopat\u00f3genos, el filtrado crudo de violace\u00edna si demostr\u00f3 actividad inhibidora contra bacterias gram positivas. Tambi\u00e9n observamos que las cepas de duganella spp. De olivos silvestres y cultivados mostraron actividad proteol\u00edtica y lipol\u00edtica y una d\u00e9bil producci\u00f3n de sider\u00f3foros lo cual merece una investigaci\u00f3n m\u00e1s extensa como potenciales inoculantes de plantones de olivo para mejorar su crecimiento y el establecimiento y supresi\u00f3n de pat\u00f3genos del suelo.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Estructura y diversidad genetica de poblaciones bacterianas en la rizosfera de olivo (olea europaea l. subsp. europaea) en andalucia<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Estructura y diversidad genetica de poblaciones bacterianas en la rizosfera de olivo (olea europaea l. subsp. europaea) en andalucia <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Sergio Aranda Ocampo <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 C\u00f3rdoba<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 17\/12\/2010<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Blanca Beatriz Landa Del Castillo<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Rafael manuel Jimenez diaz <\/li>\n<li>jordi Cabrefiga olamendi (vocal)<\/li>\n<li>Francisco m. Cazorla lopez (vocal)<\/li>\n<li>Juan  a. Navas cortes (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Sergio Aranda Ocampo El olivo (olea europaea l. Subsp. 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