{"id":106571,"date":"2018-03-11T10:30:33","date_gmt":"2018-03-11T10:30:33","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/filogenia-molecular-estructura-poblacional-y-trazabilidad-genetica-de-escombridos-pisces-scombridae\/"},"modified":"2018-03-11T10:30:33","modified_gmt":"2018-03-11T10:30:33","slug":"filogenia-molecular-estructura-poblacional-y-trazabilidad-genetica-de-escombridos-pisces-scombridae","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/acidos-nucleicos\/filogenia-molecular-estructura-poblacional-y-trazabilidad-genetica-de-escombridos-pisces-scombridae\/","title":{"rendered":"Filogenia molecular, estructura poblacional y trazabilidad gen\u00e9tica de esc\u00f3mbridos (pisces: scombridae)"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Javier Quinteiro V\u00e1zquez <\/strong><\/h2>\n<p>Los esc\u00f3mbridos son tele\u00f3steos marinos agrupados en la familia scombridae, la cual incluye, en la actualidad, a 15 g\u00e9neros y 50 especies de atunes, bonitos, caballas y carites. La especializaci\u00f3n de la familia scombridae para la vida pel\u00e1gica es m\u00e1xima. Ello les confiere un elevado inter\u00e9s fisiol\u00f3gico y evolutivo, centrado en la adaptaci\u00f3n maximizada para la vida pel\u00e1gica, incluyendo su impar capacidad endot\u00e9rmica.  Adem\u00e1s,  los esc\u00f3mbridos poseen gran inter\u00e9s comercial, sustentando en aguas de todo el mundo gran cantidad de pesquer\u00edas comerciales, artesanales y deportivas.  la diversidad de especies se encuentra distribuida en grupos taxon\u00f3micos de distinto nivel que han sido evaluados filogen\u00e9ticamente mediante el an\u00e1lisis de secuencias de la regi\u00f3n control del adn mitocondrial (adnmt). La monofil\u00e9tica familia scombridae incluye cuatro clados definidos como tribus scomberomorini, scombrini, sardini y thunnini. Las relaciones filogen\u00e9ticas entre estos divergentes grupos se ven oscurecidas por la saturaci\u00f3n de la se\u00f1al filogen\u00e9tica en las zonas m\u00e1s profundas de la filogenia (scomberomorini y scombrini) y por la simult\u00e1nea cladog\u00e9nesis de las tribus m\u00e1s recientes (sardini y thunnini). Las relaciones entre las especies del m\u00e1s derivado g\u00e9nero thunnus son bien resueltas, mostr\u00e1ndose un clado divergente que agrupa a t. Thynnus y t. Alalunga con una introgresi\u00f3n del adnmt, un clado incluyendo t. Orientalis y t. Maccoyii, un clado intermedio conteniendo a t. Obesus y un clado reciente con los atunes tropicales t. Albacares, t. Atlanticus y t. Tonggol. El subg\u00e9nero neothunnus, incluyendo los atunes considerados como m\u00e1s especializados y recientes, no constituye un clado, situ\u00e1ndose esas especies en la posici\u00f3n basal de la topolog\u00eda. la diversidad gen\u00e9tica de las especies analizadas no se ha mostrado, en general, estructurada geogr\u00e1ficamente. La capacidad natatoria y migratoria, la generalizada ausencia de barreras al flujo g\u00e9nico en el medio marino, los elevados tama\u00f1os poblacionales y la ausencia de un comportamiento filop\u00e1trida, son causas  comunes de falta de diferenciaci\u00f3n gen\u00e9tica entre sus poblaciones. El nivel de flujo g\u00e9nico estimado es suficiente para prevenir una diferenciaci\u00f3n inter-oce\u00e1nica en la mayor\u00eda de los casos. Sin embargo, se detecta una leve diferenciaci\u00f3n entre algunas poblaciones del atl\u00e1ntico y pac\u00edfico en el caso de t. Alalunga. El at\u00fan patudo, t. Obesus, ha mostrado una diferenciaci\u00f3n interoce\u00e1nica, pero probablemente debido a la distribuci\u00f3n asim\u00e9trica de sus divergentes clados intraespec\u00edficos. \u00fanicamente scomber japonicus, una caballa con distribuci\u00f3n global y costera, ha mostrado una significativa diferenciaci\u00f3n inter- e intraoce\u00e1nica.  la calibraci\u00f3n de la tasa de mutaci\u00f3n en la regi\u00f3n control mitocondrial se ha llevado a cabo teniendo en cuenta la dataci\u00f3n del evento vicariante de la elevaci\u00f3n del istmo de panam\u00e1 y datos del registro f\u00f3sil. La tasa de mutaci\u00f3n estimada para las especies ectot\u00e9rmicas es de 1,2% por mill\u00f3n de a\u00f1os (ma). Las especies endot\u00e9rmicas mostraron una significativa mayor tasa mutacional, en torno al 2% ma, siendo relacionada con el efecto de un elevado metabolismo. De forma similar, la tasa mutacional de s. Scombrus, careciendo de vejiga natatoria, fue significativamente mayor que la estimada para la especie hermana, s. Japonicus, con vejiga natatoria, una menor activad muscular y con un consiguiente metabolismo basal m\u00e1s reducido.  los datos mitocondriales y las relaciones filogen\u00e9ticas inferidas sobre las especies analizadas han permitido el dise\u00f1o y aplicaci\u00f3n de metodolog\u00edas de identificaci\u00f3n de especies en un marco de trazabilidad alimentaria. La fiabilidad de estas metodolog\u00edas se ha visto reforzada por el conocimiento acerca de la diversidad gen\u00e9tica de cada especie basado en el an\u00e1lisis de la variabilidad nucleot\u00eddica intraespec\u00edfica en las secuencias mitocondriales. a partir de muestras comerciales, tratadas t\u00e9rmicamente, se recupera adn utilizable como molde eficiente para la amplificaci\u00f3n (pcr) de peque\u00f1os fragmentos de adnmt (menor de 200 pb) conteniendo la informaci\u00f3n requerida para la identificaci\u00f3n de la especie presente en dichas muestras de tejido. Los fragmentos del conservado citocromo b (b126 y bdr) permiten asignar una muestra problema a la especie de t\u00fanido correspondiente, en la mayor\u00eda de los casos. Sin embargo, las hipervariables secuencias de la regi\u00f3n control proveen de la mayor resoluci\u00f3n para la diferenciaci\u00f3n entre las especies m\u00e1s cercanas del g\u00e9nero thunnus. Sobre los fragmentos del citocromo b han sido evaluadas metodolog\u00edas secundarias de pcr-rflp y pcr-sscp de utilidad para el cribado y an\u00e1lisis de muestras conteniendo mezclas de tejidos de varias especies.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Filogenia molecular, estructura poblacional y trazabilidad gen\u00e9tica de esc\u00f3mbridos (pisces: scombridae)<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Filogenia molecular, estructura poblacional y trazabilidad gen\u00e9tica de esc\u00f3mbridos (pisces: scombridae) <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Javier Quinteiro V\u00e1zquez <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Santiago de compostela<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 31\/01\/2011<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Manuel Rey M\u00e9ndez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: manuel Freire rama <\/li>\n<li>ricardo P\u00e9rez mart\u00edn (vocal)<\/li>\n<li>carmen Gonzalez sotelo (vocal)<\/li>\n<li>nieves Gonz\u00e1lez  henr\u00edquez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Javier Quinteiro V\u00e1zquez Los esc\u00f3mbridos son tele\u00f3steos marinos agrupados en la familia scombridae, la cual incluye, en 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