{"id":107985,"date":"2018-03-11T10:32:38","date_gmt":"2018-03-11T10:32:38","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/study-of-the-m3-muscarinic-acetylcholine-receptor-by-molecular-dynamics-simulations-and-site-directed-mutagenesis\/"},"modified":"2018-03-11T10:32:38","modified_gmt":"2018-03-11T10:32:38","slug":"study-of-the-m3-muscarinic-acetylcholine-receptor-by-molecular-dynamics-simulations-and-site-directed-mutagenesis","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/bioquimica-molecular\/study-of-the-m3-muscarinic-acetylcholine-receptor-by-molecular-dynamics-simulations-and-site-directed-mutagenesis\/","title":{"rendered":"Study of the m3 muscarinic acetylcholine receptor by molecular dynamics simulations and site-directed mutagenesis"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Marlet Themis Mart\u00ednez Archundia <\/strong><\/h2>\n<p>Los receptors muscar\u00ednicos de acetilcolina juegan un paperl vital en la regulaci\u00f3n  de muchos procesos fisiol\u00f3gicos. Cinco diferentes subtipos han sido identificados m1-m5.  En esta tesis nos enfocamos en el receptor m3, involucrado en la modulacion de la liberaci\u00f3n de neurotransmisor, home\u00f3stasis de la temperatura, inducci\u00f3n de la contracci\u00f3n del m\u00fasculo liso, secresi\u00f3n glandular, relajaci\u00f3n indirecta del m\u00fasculo vascular liso y en la meiosis del sistema nervioso perif\u00e9rico. nuestro modelo del receptor muscar\u00ednico m3 ha sido constru\u00eddo por homolog\u00eda basado en la estructura cristalina de alta resoluci\u00f3n de la rodopsina bovina. El modelo es  compatible con la informaci\u00f3n experimental disponible (mutag\u00e9nesis dirigida) y representa la forma inactiva del receptor. Dicho modelo fue refinado a trav\u00e9s de simulaciones de din\u00e1mica molecular para analizar el efecto del ligando dentro de la cavidad de uni\u00f3n del receptor, adem\u00e1s del efecto de la composici\u00f3n de la membrana lip\u00eddica sobre la estructura de la prote\u00edna. Por consiguiente, cuatro trajectorias de 50ns han sido realizadas para obtener informaci\u00f3n conformacional del receptor. En el an\u00e1lisis estructural del receptor muscar\u00ednico m3 pudimos percatarnos de que la bicapa lip\u00eddica popc\/pops proporciona m\u00e1s estabilidad a la estructura del mismo, especialmente en el caso del tercer b\u00facle intracelular, donde las cargas positivas localizadas en \u00e9sta \u00e1rea interact\u00faan con los ox\u00edgenos de las mol\u00e9culas de los l\u00edpidos pops. en relaci\u00f3n a los resultados de las interacciones entre residuos de distinta cadenas laterales de la prote\u00edna, parece que ciertos residuos localizados en las terminaciones de la tercera y sexta h\u00e9lice citopl\u00e1smica respectivamente (posiciones: 3.49, 3.50, 3.51, 6.30 y 6.34 en la familia de gpcrs) juegan un papel relevante en el mecanismo de activaci\u00f3n del receptor muscar\u00ednico. En lo que se refiere a nuestros resultados de interacciones l\u00edpido-prote\u00edna y a algunos otros realizados previamente en modelos de rodopsina, sugerimos que existen residuos espec\u00edficos en la familia de gpcrs  (posiciones: 1.30, 1.64, 2.63, 3.51 y 4.41) que son responsables de \u00c2\u00bfanclar\u00c2\u00bf  la prote\u00edna de membrana en la bicapa lip\u00eddica (ejemplo rodopsina y receptor muscar\u00ednico m3).   as\u00ed mismo, tambi\u00e9n encontramos, de acuerdo con estudios de modelizaci\u00f3n molecular y mutag\u00e9nesis para receptores muscar\u00ednicos, que el segundo b\u00facle extracelular muestra cierta flexibilidad a pesar de la presencia del puente disulfuro, el cual se encuentra entre este loop y la tercera h\u00e9lice transmembranal. Este hecho fue claramente observado en los c\u00e1lculos de \u00e1ngulos dihedros, donde este b\u00facle mostr\u00f3 m\u00e1s flexibilidad en comparaci\u00f3n a los otros b\u00facles extracelulares (b\u00facles extracelulares 1 y 3). siendo el receptor m2, el subtipo m\u00e1s propenso a la modulaci\u00f3n alost\u00e9rica (ejem. Galamina y alcuronio), y particularmente su segundo b\u00facle extracelular, el cual cuando es transferido al receptor m3 aumenta sustancialmente la afinidad por este tipo de compuestos, decidimos mutar algunos de los residuos localizados en \u00e9ste bucle extracelular  por los correspondientes del subtipo  m2 (y209f, k213v y e228n)  para as\u00ed poder definir su papel potencial en la uni\u00f3n de moduladores alost\u00e9ricos (galamina o estrichnina). Dichos mutantes fueron analizados por ensayos de uni\u00f3n radioactivos \u00c2\u00bfradioligand binding assays\u00c2\u00bf, sin embargo no se encontraron  cambios significativos en ninguno de estos, en comparaci\u00f3n con el del receptor m3, por lo cual podemos decir que dichos residuos no est\u00e1n implicados cr\u00edticamente en la uni\u00f3n de galamia o estrichnina.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Study of the m3 muscarinic acetylcholine receptor by molecular dynamics simulations and site-directed mutagenesis<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Study of the m3 muscarinic acetylcholine receptor by molecular dynamics simulations and site-directed mutagenesis <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Marlet Themis Mart\u00ednez Archundia <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Polit\u00e9cnica de catalunya<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 14\/04\/2011<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Pere Garriga Sol\u00e9<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: leonardo Pardo carrasco <\/li>\n<li>ib\u00f3n Alkorta osoro (vocal)<\/li>\n<li>francesc Sepulcre s\u00e1nchez (vocal)<\/li>\n<li>n\u00e9stor G\u00f3mez trias (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Marlet Themis Mart\u00ednez Archundia Los receptors muscar\u00ednicos de acetilcolina juegan un paperl vital en la regulaci\u00f3n de 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