{"id":109494,"date":"2018-03-11T10:34:59","date_gmt":"2018-03-11T10:34:59","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/nuevas-herramientas-en-la-lucha-contra-las-virosis-del-pimiento\/"},"modified":"2018-03-11T10:34:59","modified_gmt":"2018-03-11T10:34:59","slug":"nuevas-herramientas-en-la-lucha-contra-las-virosis-del-pimiento","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/genetica-vegetal\/nuevas-herramientas-en-la-lucha-contra-las-virosis-del-pimiento\/","title":{"rendered":"Nuevas herramientas en la lucha contra las virosis del pimiento"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Vicente Pascual Ibiza Gimeno <\/strong><\/h2>\n<p>Las hortalizas en general, entre ellas los pimientos, se encuentran continuamente expuestas al ataque de pat\u00f3genos. No obstante, las enfermedades de etiolog\u00eda viral destacan por ser el principal factor limitante de estos cultivos. La estrategia m\u00e1s eficaz para el control de las virosis en plantas consiste en la identificaci\u00f3n de genes de resistencia y su posterior utilizaci\u00f3n para el desarrollo de variedades resistentes. Una importante parte de la variabilidad existente en el g\u00e9nero capsicum se encuentra conservada en bancos de germoplasma. Sin embargo, para poder manejarla y explotarla eficientemente es necesario cuantificar y analizar la variabilidad interespec\u00edfica e intraespec\u00edfica disponible. Adem\u00e1s, el disponer de una estrategia capaz de disminuir los costes asociados al proceso de fenotipado ser\u00e1 muy ventajoso.  el principal objetivo de esta tesis se centra en la caracterizaci\u00f3n y aprovechamiento de la variabilidad gen\u00e9tica de las especies cultivadas del g\u00e9nero capsicum (c. Annuum, c. Chinense, c. Frutescens, c. Baccatum y c. Pubescens). As\u00ed, en este trabajo se plantea tanto conocer y describir la distribuci\u00f3n de la variabilidad existente en estas especies, como desarrollar herramientas que permitan una exploraci\u00f3n y utilizaci\u00f3n eficiente de la variabilidad contenida en los bancos de germoplasma. Para ello, se ha puesto a punto una plataforma de ecotilling que permite un cribado eficiente de la colecci\u00f3n de entradas de capsicum del banco de germoplasma del comav. A modo de experiencia piloto se explor\u00f3 esta plataforma para la b\u00fasqueda de variantes al\u00e9licas de los genes eif4e y eif(iso)4e, implicados en la resistencia a virosis de gran importancia en el cultivo del pimiento y de otros cultivos. esta tesis doctoral es un ejemplo donde el ecotilling basado en el adnc resulta fruct\u00edfero, al trabajar con diferentes especies del g\u00e9nero capsicum y al ser los cambios nucleot\u00eddicos de las regiones codificantes los m\u00e1s interesantes. La utilizaci\u00f3n en la t\u00e9cnica ecotilling del adn complementario como material de partida, en vez del adn gen\u00f3mico, no se hab\u00eda descrito previamente. El adnc favorece la amplificaci\u00f3n de los genes candidatos en un conjunto de especies relacionadas. Adem\u00e1s, reduce el n\u00famero de amplificaciones y reacciones enzim\u00e1ticas por muestra. 36 snps se detectaron en las 21 secuencias identificadas del gen eif4e y 26 snps en las 17 secuencias del eif(iso)4e, confirm\u00e1ndose el elevado nivel de polimorfismo presente en esta colecci\u00f3n de entradas. Finalmente, se identificaron 19 variantes de la prote\u00edna eif4e y 10 de la eif(iso)4e. De estas, cinco prote\u00ednas eif4e y una eif(iso)4e hab\u00edan sido publicadas previamente. Es decir, la plataforma de ecotilling contiene una buena representaci\u00f3n de la variabilidad gen\u00e9tica del g\u00e9nero capsicum. una colecci\u00f3n de 31 entradas que representan distintas combinaciones de los alelos eif4e y eif(iso)4e se inocularon mec\u00e1nicamente con el potato virus y (pvy) y el tobacco etch virus (tev). Cinco nuevas variantes del gen eif4e (pvr210, pvr211, pvr212, pvr213, pvr214) est\u00e1n relacionadas con la respuesta de resistencia al pvy y al tev. Las plantas que contienen alguno de estos alelos no se infectan sistem\u00e1ticamente con el aislado pvy-f14k. Por otra parte, estos alelos no inhiben la replicaci\u00f3n del aislado tev-7da, al igual que sucede en las entradas con alelos publicados como resistentes al tev (pvr1 y pvr22). No obstante, las entradas que poseen estos alelos desarrollan una respuesta tolerante frente al tev-7da.  los nuevos alelos de resistencia poseen cambios aminoac\u00eddicos localizados en las regiones i (ex\u00f3n 1) y ii (ex\u00f3n 2) de la prote\u00edna eif4e. Estos parecen ser los responsables de las respuestas frente al pvy-f14k y el tev-7da. Las prote\u00ednas eif4e de los alelos pvr212, pvr213 y pvr214 de c. Baccatum y pvr211 de c. Chinense tienen el cambio n65d. Por otra parte, la combinaci\u00f3n de cambios aminoac\u00eddicos en la prote\u00edna eif4e del alelo pvr210 de c. Chinense podr\u00eda explicar las reacciones de este alelo.  la determinaci\u00f3n de las relaciones filogen\u00e9ticas, en el caso del g\u00e9nero capsicum, tiene una gran importancia agron\u00f3mica. Las distintas especies son potenciales fuentes de variabilidad para ser utilizadas en la mejora del cultivo del pimiento (c. Annuum). Diez microsat\u00e9lites y cuatro combinaciones de aflps se utilizaron para caracterizar 260 entradas del g\u00e9nero capsicum. El an\u00e1lisis molecular ha verificado la estrecha relaci\u00f3n entre las especies c. Chinense y c. Frutescens. En cuanto a las especies silvestres c. Cardenasii y c. Eximium son indistinguibles molecularmente, mientras c. Baccatum y c. Praetermissum son especies distintas que forman un grupo muy compacto. En base a nuestras observaciones y a diferencia de otros estudios, c. Chacoense es incluida en el complejo de c. Baccatum mientras c. Tovarii no pertenece a ning\u00fan complejo. adem\u00e1s del an\u00e1lisis general de la taxonom\u00eda se detect\u00f3 la existencia de cierta estructuraci\u00f3n intraespec\u00edfica. C. Baccatum y c. Pubescens muestran un par de grupos gen\u00e9ticos, por un lado est\u00e1n las entradas procedentes de bolivia y por el otro las entradas de ecuador y per\u00fa. Adem\u00e1s, las entradas de c. Chinense procedentes de per\u00fa pudieron ser diferenciadas del resto. Diferentes factores han podido favorecer esta diferenciaci\u00f3n gen\u00e9tica. En bolivia, ecuador y per\u00fa el uso de los frutos de pimiento para el autoconsumo est\u00e1 relacionado con aspectos culturales. Por otra parte c. Pubescens y c. Baccatum se cultivan en las regiones monta\u00f1osas de estos pa\u00edses. En \u00e9stas las comunicaciones son complicadas y por tanto el intercambio de semillas es m\u00e1s dif\u00edcil. As\u00ed, como resultado de la selecci\u00f3n continua y el aislamiento gen\u00e9tico se ha podido producir la diferenciaci\u00f3n gen\u00e9tica detectada. en este estudio las entradas de ecuador y per\u00fa han mostrado una diversidad elevada y similar a las de bolivia, el cual es un importante centro de diversidad del g\u00e9nero capsicum. Por tanto, las entradas procedentes de estos pa\u00edses podr\u00e1n constituir fuentes importantes de variaci\u00f3n para ser utilizadas en los programas de mejora del pimiento. Los datos de distribuci\u00f3n de la variabilidad aumentar\u00e1n la eficacia del manejo de las entradas, y permitir\u00e1n redise\u00f1ar la plataforma de capsicum para analizarla mediante ecotilling o con las nuevas metodolog\u00edas de detecci\u00f3n de mutaciones.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Nuevas herramientas en la lucha contra las virosis del pimiento<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Nuevas herramientas en la lucha contra las virosis del pimiento <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Vicente Pascual Ibiza Gimeno <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Polit\u00e9cnica de Valencia<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 24\/06\/2011<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Fernando Nuez Vi\u00f1als<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: marcelino P\u00e9rez de la vega <\/li>\n<li>Luis Rubio migu\u00e9lez (vocal)<\/li>\n<li>Mar\u00eda  Jos\u00e9 Diez niclos (vocal)<\/li>\n<li>Mar\u00eda  soledad Arnedo andres (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Vicente Pascual Ibiza Gimeno Las hortalizas en general, entre ellas los pimientos, se encuentran continuamente expuestas al 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