{"id":109842,"date":"2011-04-07T00:00:00","date_gmt":"2011-04-07T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/analisis-genomico-comparativo-en-triticineas-generacion-y-aplicacion-de-herramientas-para-la-mejora-genetica-vegetal-e-inferencias-filogeneticas\/"},"modified":"2011-04-07T00:00:00","modified_gmt":"2011-04-07T00:00:00","slug":"analisis-genomico-comparativo-en-triticineas-generacion-y-aplicacion-de-herramientas-para-la-mejora-genetica-vegetal-e-inferencias-filogeneticas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/genetica-vegetal\/analisis-genomico-comparativo-en-triticineas-generacion-y-aplicacion-de-herramientas-para-la-mejora-genetica-vegetal-e-inferencias-filogeneticas\/","title":{"rendered":"An\u00e1lisis gen\u00f3mico comparativo en triticineas: generaci\u00f3n y aplicaci\u00f3n de herramientas para la mejora gen\u00e9tica vegetal e inferencias filogen\u00e9ticas"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Almudena Castillo Lopez <\/strong><\/h2>\n<p>Hordeum chilense (roem. Et schulz.) Es una cebada silvestre diploide (2n = 2x = 14), originaria del sur de am\u00e9rica que muestra gran variaci\u00f3n gen\u00e9tica, tanto a nivel bioqu\u00edmico como morfol\u00f3gico. Crece en ambientes muy diversos y tiene caracter\u00edsticas muy interesantes para la mejora gen\u00e9tica de los cereales: se han conseguido h\u00edbridos f\u00e9rtiles con otros miembros de la tribu triticeae, permitiendo la posibilidad de transferir caracter\u00edsticas importantes a especies cultivadas. Entre ellas se encuentran resistencia a estreses bi\u00f3ticos y abi\u00f3ticos, alta variabilidad en caracteres de calidad, tales como prote\u00ednas de almacenamiento o contenido en carotenoides. Los trit\u00f3rdeos son anfiploides obtenidos despu\u00e9s de la duplicaci\u00f3n cromos\u00f3mica de los h\u00edbridos entre triticum y h. Chilense. Se trata de especies puente que facilitan la transferencia de caracter\u00edsticas agron\u00f3micas importantes de h. Chilense a trigo. Las especies silvestres constituyen una fuente de variabilidad gen\u00e9tica para las especies cultivadas; as\u00ed, la hibridaci\u00f3n y la introgresi\u00f3n permiten introducir variabilidad de especies silvestres en las plantas cultivadas. Por ello, la caracterizaci\u00f3n de esta variabilidad y el desarrollo de herramientas para su introducci\u00f3n en plantas cultivadas son metas importantes en la mejora gen\u00e9tica vegetal. Debido a la escasa informaci\u00f3n de una especie silvestre como h. Chilense y de su poco inter\u00e9s agron\u00f3mico directo, se hace inviable el desarrollo directo de herramientas gen\u00f3micas en la misma, dado el elevado coste que esto supone. Gracias a la existencia de sintenia entre los cereales y dada la homeolog\u00eda de esta especie con otras de gran inter\u00e9s como trigo y cebada, es posible el desarrollo de herramientas moleculares en h. Chilense. As\u00ed, mediante aproximaci\u00f3n gen\u00f3mica comparativa se ha podido llevar a cabo la transferencia de marcadores microsat\u00e9lites tanto gen\u00f3micos (gssr) como g\u00e9nicos; es decir, localizados en zonas g\u00e9nicas expresadas (est-ssr) de especies cultivadas a h. Chilense de una manera m\u00e1s r\u00e1pida y econ\u00f3mica. Con este trabajo se ha incrementado el n\u00famero de gssr, obteni\u00e9ndose 39 nuevos gssr polim\u00f3rficos \u00fatiles para el an\u00e1lisis h. Chilense. Adem\u00e1s, los marcadores desarrollados son de alta calidad y reproducibles, ya que fueron validados bajo dos condiciones diferentes laboratorios, usando distintos equipos de secuenciaci\u00f3n. Tambi\u00e9n se aportan 41 nuevos est-ssr de alta calidad, espec\u00edficos de cromosomas de h. Chilense, y por tanto disponibles para su uso en esta especie y colineales con los genomas de cebada o de trigo. Adem\u00e1s, la disponibilidad de recursos citogen\u00e9ticos, como las l\u00edneas de adici\u00f3n de h. Chilense en trigo, permiti\u00f3 la asignaci\u00f3n cromos\u00f3mica de estos marcadores polim\u00f3rficos, obteni\u00e9ndose marcadores espec\u00edficos para todos los cromosomas de h. Chilense. Los estudios de variabilidad realizados permitieron determinar la estructura gen\u00e9tica de las l\u00edneas estudiadas. Ello permite establecer asociaciones de la variabilidad de la especie con datos geogr\u00e1ficos y ambientales, caracteres morfol\u00f3gicos y datos de inter\u00e9s agron\u00f3mico. Por otro lado, se llev\u00f3 a cabo el an\u00e1lisis del genoma del cloroplasto en h. Chilense, mediante el uso de cebadores universales y detecci\u00f3n mediante cromatograf\u00eda l\u00edquida de alto rendimiento (dhplc), permitiendo detectar diferentes haplotipos usados para el estudio de variabilidad de la especie. Asimismo, se compararon los resultados obtenidos con marcadores nucleares y citoplasm\u00e1ticos, a nivel intra- e inter-espec\u00edfico. El an\u00e1lisis de las secuencias de la regi\u00f3n its1-5\u00c2\u00bf8s-its2 del adnr en la colecci\u00f3n de h. Chilense permiti\u00f3 el estudio de variabilidad en la especie as\u00ed como su estudio filogen\u00e9tico. En el presente trabajo se ha llevado a cabo un estudio de la variabilidad gen\u00e9tica en una colecci\u00f3n representativa de h. Chilense, mediante el uso de los marcadores moleculares desarrollados para determinar la variabilidad natural de la especie y llevar a cabo un an\u00e1lisis filogen\u00e9tico a nivel intraespec\u00edfico. Adem\u00e1s, se realiz\u00f3 un an\u00e1lisis filogen\u00e9tico a nivel interespec\u00edfico e intergen\u00e9rico con estos marcadores polim\u00f3rficos desarrollados, utilizando para ello especies relacionadas. De esta forma se avanza en el conocimiento del genoma de h. Chilense y se determina el grado de similitud con otros genomas, como trigo y cebada. En conclusi\u00f3n, los resultados de este trabajo indican que el conjunto de marcadores desarrollados es potencialmente \u00fatil, no s\u00f3lo para el estudio de la estructura gen\u00e9tica y evoluci\u00f3n en cebada silvestre, sino tambi\u00e9n para identificar rasgos agron\u00f3micos de inter\u00e9s, para estudios de introgresi\u00f3n, y en general, para programas de mejora gen\u00e9tica en cereales.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>An\u00e1lisis gen\u00f3mico comparativo en triticineas: generaci\u00f3n y aplicaci\u00f3n de herramientas para la mejora gen\u00e9tica vegetal e inferencias filogen\u00e9ticas<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 An\u00e1lisis gen\u00f3mico comparativo en triticineas: generaci\u00f3n y aplicaci\u00f3n de herramientas para la mejora gen\u00e9tica vegetal e inferencias filogen\u00e9ticas <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Almudena Castillo Lopez <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 C\u00f3rdoba<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 04\/07\/2011<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Gabriel Dorado Perez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: angeles Alonso moraga <\/li>\n<li>Santiago Moreno vazquez (vocal)<\/li>\n<li>guenter Kahl . (vocal)<\/li>\n<li>pedro Azor ortiz (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Almudena Castillo Lopez Hordeum chilense (roem. Et schulz.) Es una cebada silvestre diploide (2n = 2x = [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[37372,973,534,38670],"tags":[219537,73846,25214,219538,141964,88618],"class_list":["post-109842","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-biologia-molecular-de-plantas","category-cordoba","category-genetica-vegetal","category-plantas-ornamentales","tag-almudena-castillo-lopez","tag-angeles-alonso-moraga","tag-gabriel-dorado-perez","tag-guenter-kahl","tag-pedro-azor-ortiz","tag-santiago-moreno-vazquez"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/109842","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=109842"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/109842\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=109842"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=109842"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=109842"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}