{"id":110303,"date":"2018-03-11T10:36:14","date_gmt":"2018-03-11T10:36:14","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/relacion-entre-el-silenciamiento-de-rna-y-la-patogenesis-inducida-por-un-viroide-con-replicacion-nuclear\/"},"modified":"2018-03-11T10:36:14","modified_gmt":"2018-03-11T10:36:14","slug":"relacion-entre-el-silenciamiento-de-rna-y-la-patogenesis-inducida-por-un-viroide-con-replicacion-nuclear","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/politecnica-de-valencia\/relacion-entre-el-silenciamiento-de-rna-y-la-patogenesis-inducida-por-un-viroide-con-replicacion-nuclear\/","title":{"rendered":"Relaci\u00f3n entre el silenciamiento de rna y la patog\u00e9nesis inducida por un viroide con replicaci\u00f3n nuclear"},"content":{"rendered":"

Tesis doctoral de Germ\u00e1n Eugenio Mart\u00ednez Arias <\/strong><\/h2>\n

Los viroides son los pat\u00f3genos de plantas conocidos con menor complejidad biol\u00f3gica. En los \u00faltimos a\u00f1os han sido descritos como agentes infecciosos de un gran numero de especies (tanto herb\u00e1ceas como le\u00f1osas) de inter\u00e9s agron\u00f3mico. Su estudio, aparte del inter\u00e9s agro-econ\u00f3mico que puede reportar, resulta atractivo por el hecho de que representa el modelo m\u00e1s simple para estudiar las interacciones entre pat\u00f3genos de rna y sus hu\u00e9spedes. Como estos organismos no poseen capacidad descrita para codificar prote\u00ednas, todas las fases de su ciclo vital, as\u00ed como la respuesta patog\u00e9nica inducida durante su infecci\u00f3n, son estrictamente dependientes de su interacci\u00f3n con factores del hu\u00e9sped. La visi\u00f3n cl\u00e1sica del proceso de patog\u00e9nesis viroidal asume que las alteraciones inducidas en la planta durante la infecci\u00f3n son consecuencia de la competencia hu\u00e9sped-pat\u00f3geno por factores celulares implicados en la transcripci\u00f3n, el movimiento c\u00e9lula a c\u00e9lula y\/o el movimiento sist\u00e9mico del viroide. Sin embargo, una serie de resultados obtenidos en estudios previos sugieren que posiblemente la respuesta de silenciamiento de rna del hu\u00e9sped frente a estos pat\u00f3genos sea la responsable del proceso de patog\u00e9nesis asociado con la infecci\u00f3n viroidal. En el presente trabajo se ha tratado de estudiar la relaci\u00f3n entre dicho mecanismo de silenciamiento de rna y la patog\u00e9nesis viroidal (en concreto de hsvd). el primer paso, reflejado en el cap\u00edtulo 1 de esta tesis, fue el caracterizar las alteraciones en el desarrollo inducidas por hsvd en plantas transg\u00e9nicas de n.Benthamiana. En regla general, el an\u00e1lisis de las alteraciones fenot\u00edpicas en plantas de n.Benthamiana que expresaban formas dim\u00e9ricas de hsvd confirm\u00f3 su similitud con los s\u00edntomas asociados a la infecci\u00f3n del viroide en sus hu\u00e9spedes naturales, justificando en consecuencia emplear el sistema hsvd\/nicotiana benthamiana como modelo para el estudio del proceso de patog\u00e9nesis inducido por los viroides nucleares. ante la serie de resultados contradictorios que exist\u00edan en la literatura sobre la implicaci\u00f3n del silenciamiento de rna en la patog\u00e9nesis viroidal, consideramos que era necesario aportar nuevas evidencias que permitieran arrojar luz sobre esta relaci\u00f3n de una manera directa, esto es, estudiando la interacci\u00f3n entre componentes fundamentales de la maquinaria de silenciamiento de rna y los viroides. Para realizar este an\u00e1lisis (cap\u00edtulo 2) estudiamos 2 variables que afectan al silenciamiento de rna: una bioqu\u00edmica, la actividad rdr6, y otra ambiental, la temperatura. Los resultados nos indican que en la interacci\u00f3n hsvd-n.Benthamiana la expresi\u00f3n de s\u00edntomas es unproceso ligado al silenciamiento de rna mediado por rdr6 e independiente de los niveles de acumulaci\u00f3n del pat\u00f3geno en la planta, aportando la primera evidencia experimental directa sobre la existencia de una estrecha relaci\u00f3n entre la patog\u00e9nesis viroidal y el silenciamiento de rna espec\u00edfico de viroides, que hab\u00eda sido previamente sugerida por diversos autores. con la finalidad de profundizar en la biog\u00e9nesis de los vd-srnas llevamos a cabo un experimento de secuenciaci\u00f3n masiva de vd-srnas en dos tejidos diferentes de cucumis sativus (hu\u00e9sped natural para hsvd), hoja y exudado floem\u00e1tico. Estos datos, expuestos en el cap\u00edtulo 3, indican que los vd-srnas se originan por la acci\u00f3n jerarquizada de diversas dcls sobre un dsrna complementario generado a partir de un precursor lineal y no de la mol\u00e9cula madura. Adem\u00e1s, los datos de la librer\u00eda generada a partir de srnas derivados de exudado floem\u00e1tico indican una distribuci\u00f3n diferencial de tama\u00f1o y secuencia en este tejido. pese a todos los reportes existentes acerca de c\u00f3mo diversos pat\u00f3genos afectan el balance de mirnas en la planta, no exist\u00edan estudios dedicados a analizar en profundidad como el proceso de infecci\u00f3n viroidal altera los niveles este tipo de reguladores en el hu\u00e9sped. Teniendo en cuenta que, adem\u00e1s, no hab\u00edan sido caracterizados en esta especie, nuestro primer objetivo fue realizar un inventario de los srnas end\u00f3genos de pepino as\u00ed como una caracterizaci\u00f3n de los mirnas encontrados y sus potenciales precursores (cap\u00edtulo 4). Con esta caracterizaci\u00f3n, dispon\u00edamos de un marco de referencia para poder analizar las alteraciones en este grupo de riboreguladores asociadas al proceso infeccioso inducido por hsvd (cap\u00edtulo 5). Los resultados obtenidos nos permitieron identificar 4 tipos diferentes de alteraciones inducidas por el hsvd durante la infecci\u00f3n: a) alteraci\u00f3n del perfil general de srnas, siendo la familia de 21 nts la de mayor acumulaci\u00f3n en planta infectada, b) represi\u00f3n y sobrexpresi\u00f3n de un grupo de mirnas, c) expresi\u00f3n diferencial en planta infectada de un grupo de mirnas espec\u00edficos de pepino, y d) alteraci\u00f3n en la eficiencia de procesamiento de los mirnas de planta enferma en general. Finalmente, concluimos con el an\u00e1lisis bioinform\u00e1tico de la capacidad de los vd-srnas de regular la expresi\u00f3n de genes end\u00f3genos de la planta. En su gran mayor\u00eda los potenciales targets coinciden con genes relacionados con procesos de desarrollo, metabolismo de prote\u00ednas, respuesta a estr\u00e9s, regulaci\u00f3n de la trascripci\u00f3n, biog\u00e9nesis celular, etc. Esto permite especular sobre la existencia de una relaci\u00f3n directa en la regulaci\u00f3n negativa de algunos de estos genes mediada por los vd-srnas y los s\u00edntomas com\u00fanmente observados en una planta infectada.<\/p>\n

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Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00abRelaci\u00f3n entre el silenciamiento de rna y la patog\u00e9nesis inducida por un viroide con replicaci\u00f3n nuclear<\/strong>\u00ab<\/h3>\n
    \n
  • T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Relaci\u00f3n entre el silenciamiento de rna y la patog\u00e9nesis inducida por un viroide con replicaci\u00f3n nuclear <\/li>\n
  • Autor:<\/strong>\u00a0 Germ\u00e1n Eugenio Mart\u00ednez Arias <\/li>\n
  • Universidad:<\/strong>\u00a0 Polit\u00e9cnica de Valencia<\/li>\n
  • Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 15\/07\/2011<\/li>\n<\/ul>\n

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    Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n
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    • Director de la tesis<\/strong>\n
        \n
      • Gustavo Germ\u00e1n G\u00f3mez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n
      • Tribunal<\/strong>\n
          \n
        • Presidente del tribunal: vicente Conejero tom\u00e1s <\/li>\n
        • Jes\u00fas Navas castillo (vocal)<\/li>\n
        • cesar Llave correas (vocal)<\/li>\n
        • eduardo Rodr\u00edguez bejarano (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n

           <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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