{"id":111344,"date":"2011-10-10T00:00:00","date_gmt":"2011-10-10T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/estudio-de-las-poblaciones-de-pequenos-rnas-derivados-de-virus-de-plantas-y-su-posible-funcion-como-moleculas-reguladoras-en-la-interaccion-planta-virus\/"},"modified":"2011-10-10T00:00:00","modified_gmt":"2011-10-10T00:00:00","slug":"estudio-de-las-poblaciones-de-pequenos-rnas-derivados-de-virus-de-plantas-y-su-posible-funcion-como-moleculas-reguladoras-en-la-interaccion-planta-virus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/virologia\/estudio-de-las-poblaciones-de-pequenos-rnas-derivados-de-virus-de-plantas-y-su-posible-funcion-como-moleculas-reguladoras-en-la-interaccion-planta-virus\/","title":{"rendered":"Estudio de las poblaciones de peque\u00f1os rnas derivados de virus de plantas y su posible funci\u00f3n como mol\u00e9culas reguladoras en la interacci\u00f3n planta-virus"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Livia Donaire Segarra <\/strong><\/h2>\n<p>En los organismos eucariotas, el silenciamiento por rna es un mecanismo de regulaci\u00f3n que controla la expresi\u00f3n g\u00e9nica y la estabilidad gen\u00f3mica a trav\u00e9s de la s\u00edntesis de peque\u00f1os rnas (srnas) a partir de inductores de doble cadena de rna (dsrna). Estos srnas, de 20 a 25 nucle\u00f3tidos (nts), se unen a complejos multienzim\u00e1ticos y les confieren la facultad de reconocer y silenciar transcripcional o post-transcripcionalmente secuencias de dna o rna altamente complementarias. En el tejido vegetal infectado con virus, este proceso se activa de forma natural mediante la formaci\u00f3n de dsrnas de origen viral. Como resultado, la infecci\u00f3n est\u00e1 inexorablemente unida a la s\u00edntesis de srnas virales (vsrnas) cuyo potencial regulador se asocia no s\u00f3lo con la funci\u00f3n del silenciamiento por rna como mecanismo de defensa antiviral sino tambi\u00e9n con fen\u00f3menos como la patog\u00e9nesis o el rango de hospedador. En esta tesis doctoral hemos empleado distintas t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n e hibridaci\u00f3n molecular en el sistema modelo virus del cascabeleo del tabaco (tobacco rattle virus, trv)-arabidopsis thaliana y en otros sistemas planta-virus para inferir la composici\u00f3n y estructura de las poblaciones de vsrnas que se forman en el tejido infectado. Hemos investigado los componentes gen\u00e9ticos y los requerimientos estructurales de la maquinaria de silenciamiento de rna de la planta para producir vsrnas. Finalmente hemos analizado el papel del silenciamiento como componente antiviral en la planta y su potencial para reprogramar el transcriptoma de la c\u00e9lula infectada a trav\u00e9s de la interacci\u00f3n funcional entre vsrnas y rnas mensajeros (mrnas).  nuestros resultados revelan que los vsrnas forman poblaciones abundantes y diversas en su composici\u00f3n que comparten caracter\u00edsticas comunes en todos los sistemas planta-virus investigados. As\u00ed los vsrnas muestran un sesgo evidente en su tama\u00f1o (con mayor\u00eda de especies de 21 y 22 nts) y, con frecuencia, en su polaridad (predominio de secuencias positivas). Otra caracter\u00edstica com\u00fan es la ubicuidad de los vsrnas en su origen a partir del genoma viral. Los vsrnas se generan en cualquier posici\u00f3n a lo largo del rna viral aunque su distribuci\u00f3n es muy heterog\u00e9nea altern\u00e1ndose regiones gen\u00f3micas pobres en secuencias con otras m\u00e1s enriquecidas en vsrnas en forma de picos de acumulaci\u00f3n o de regiones m\u00e1s amplias con alta densidad de secuencias. nuestro trabajo demuestra que las rnasas tipo iii dicer-like, dcl4, dcl3 y dcl2, procesan, solas o combinadas unas con otras, las dsrnas virales para producir vsrnas de ambas polaridades a lo largo de todo el genoma de trv. No obstante, las tres enzimas dcl cortan sustratos virales de forma jer\u00e1rquica (dcl4>dcl2>dcl3) produciendo vsrnas de 21, 22 y 24 nts, respectivamente. Nuestros datos sugieren que estas enzimas act\u00faan sobre dsrnas inductores en forma de intermediarios replicativos o plegamientos imperfectos del rna viral para generar vsrnas primarios. Sin embargo, nuestros resultados confirman que la mayor\u00eda de los vsrnas en el tejido infectado son secundarios y resultan de la actividad de dcl sobre dsrnas que se originan por la actividad de prote\u00ednas rna polimerasas dependientes de rna de la planta (rdr). Estas enzimas amplificar\u00edan las respuestas iniciales de silenciamiento convirtiendo el rna viral en dsrnas.  el an\u00e1lisis de las colecciones secuenciadas sugiere que los vsrnas tienen afinidad por diversas prote\u00ednas argonauta (ago) que act\u00faan como efectoras de silenciamiento sobre mol\u00e9culas diana de rna o dna. Esto indica que los vsrna podr\u00edan mediar en distintas rutas reguladoras que controlasen la expresi\u00f3n de genes del virus y del hu\u00e9sped. Nuestros datos confirman el papel de distintos componentes de la maquinaria de silenciamiento en inmunidad antiviral puesto que la desactivaci\u00f3n gen\u00e9tica de dcl4 y dcl2 o de rdr1, rdr2 y rdr6 resulta en un fenotipo de h\u00edper-susceptibilidad a trv. Este fen\u00f3meno no se asocia al procesamiento de dsrnas virales por dcl sino muy probablemente a la actividad de los vsrnas generados a partir de las dsrnas. Empleando t\u00e9cnicas inform\u00e1ticas hemos identificado genes de arabidopsis con alto grado de complementariedad con vsrnas y que podr\u00edan servir como posibles dianas de regulaci\u00f3n negativa durante la infecci\u00f3n viral.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Estudio de las poblaciones de peque\u00f1os rnas derivados de virus de plantas y su posible funci\u00f3n como mol\u00e9culas reguladoras en la interacci\u00f3n planta-virus<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Estudio de las poblaciones de peque\u00f1os rnas derivados de virus de plantas y su posible funci\u00f3n como mol\u00e9culas reguladoras en la interacci\u00f3n planta-virus <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Livia Donaire Segarra <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Polit\u00e9cnica de Madrid<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 10\/10\/2011<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Cesar Llave Correas<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: fernando Garcia-arenal rodriguez <\/li>\n<li>Juan  Antonio Garcia alvarez (vocal)<\/li>\n<li>Javier Romero cano (vocal)<\/li>\n<li>vicente Pall\u00e1s benet (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Livia Donaire Segarra En los organismos eucariotas, el silenciamiento por rna es un mecanismo de regulaci\u00f3n que 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