{"id":112531,"date":"2018-03-11T10:39:31","date_gmt":"2018-03-11T10:39:31","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/nuevos-metodos-para-el-ajuste-flexible-de-estructuras-macromoleculares-a-distintas-resoluciones-empleando-modos-normales-de-vibracion-en-coordenadas-internas\/"},"modified":"2018-03-11T10:39:31","modified_gmt":"2018-03-11T10:39:31","slug":"nuevos-metodos-para-el-ajuste-flexible-de-estructuras-macromoleculares-a-distintas-resoluciones-empleando-modos-normales-de-vibracion-en-coordenadas-internas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/quimica\/nuevos-metodos-para-el-ajuste-flexible-de-estructuras-macromoleculares-a-distintas-resoluciones-empleando-modos-normales-de-vibracion-en-coordenadas-internas\/","title":{"rendered":"Nuevos m\u00e9todos para el ajuste flexible de estructuras macromoleculares a distintas resoluciones empleando modos normales de vibraci\u00f3n en coordenadas internas."},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Jos\u00e9 Ramon Lopez Blanco <\/strong><\/h2>\n<p>Nuevos m\u00e9todos para el ajuste flexible de estructuras macromoleculares a distintas resoluciones empleando modos normales de vibraci\u00f3n en coordenadas internas.  para entender a nivel molecular los procesos fisiol\u00f3gicos que tienen lugar en el interior de los seres vivos, existen gran variedad de t\u00e9cnicas experimentales que proporcionan informaci\u00f3n estructural detallada de sus constituyentes principales, las macromol\u00e9culas (prote\u00ednas y \u00e1cidos nucleicos, fundamentalmente). A pesar de que con cristal ograf\u00eda de rayos x es posible conocer las posiciones de sus \u00e1tomos, las condiciones en las que esto es posible son bastante limitadas. En cambio, la microscop\u00eda electr\u00f3nica de transmisi\u00f3n y an\u00e1lisis de part\u00edculas individuales s\u00ed permite observarlas e n ambientes m\u00e1s parecidos a los fisiol\u00f3gicos, aunque con un nivel de detalle (o resoluci\u00f3n) menor. Para compensar estas limitaciones y completar e integrar la informaci\u00f3n estructural a distintas resoluciones que proporcionan estas t\u00e9cnicas es posible  ajustar una estructura at\u00f3mica cristalogr\u00e1fica en el interior de un mapa de microscop\u00eda empleando m\u00e9todos computacionales. Dado que las macromol\u00e9culas suelen ser estructuras flexibles que cambian de forma mientras llevan a cabo su funci\u00f3n biol\u00f3gica,  frecuentemente aparecen en conformaciones diferentes seg\u00fan la t\u00e9cnica y condiciones de observaci\u00f3n. Por este motivo, en la mayor\u00eda de los ajustes resulta imprescindible incluir eficientemente la flexibilidad a la hora de generar los modelos ajustado s, sobre todo cuando se trata de complejos macromoleculares de gran tama\u00f1o. en este contexto se enmarcan dos de los tres objetivos principales de esta tesis: el desarrollo de la metodolog\u00eda del an\u00e1lisis vibracional (nma) en coordenadas internas (ci) y su aplicaci\u00f3n al desarrollo de m\u00e9todos de ajuste flexible. A pesar de que ya existen m\u00e9todos de ajuste efectivos, la utilizaci\u00f3n de nma en ci constituye una novedad en este campo ya que presenta importantes ventajas respecto de las aproximaciones e n coordenadas cartesianas. En esencia, el nma en ci permite acelerar los c\u00e1lculos, reducir los recursos computacionales necesarios y mantener impl\u00edcitamente la estructura covalente de los modelos. Comparativamente, estas caracter\u00edsticas confieren a l a herramienta de ajuste flexible desarrollada (imodfit) la capacidad de obtener modelos at\u00f3micos ajustados mejores o equivalentes a los obtenidos con otros m\u00e9todos utilizando mapas experimentales a media o baja resoluci\u00f3n. Tambi\u00e9n se han dise\u00f1ado e i<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Nuevos m\u00e9todos para el ajuste flexible de estructuras macromoleculares a distintas resoluciones empleando modos normales de vibraci\u00f3n en coordenadas internas.<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Nuevos m\u00e9todos para el ajuste flexible de estructuras macromoleculares a distintas resoluciones empleando modos normales de vibraci\u00f3n en coordenadas internas. <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Jos\u00e9 Ramon Lopez Blanco <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Complutense de Madrid<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 20\/03\/2012<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Pablo Chacon Montes<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Francisco Montero carnerero <\/li>\n<li>carmen San mart\u00edn pastrana (vocal)<\/li>\n<li>Jos\u00e9 Mar\u00eda Carazo garcia (vocal)<\/li>\n<li>modesto Orozco l\u00f3pez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Jos\u00e9 Ramon Lopez Blanco Nuevos m\u00e9todos para el ajuste flexible de estructuras macromoleculares a distintas resoluciones empleando 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