{"id":115623,"date":"2014-11-05T00:00:00","date_gmt":"2014-11-05T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/identificacion-expresion-y-caracterizacion-de-peroxidasas-lignola%c2%adticas-de-interes-en-genomas-de-basidiomicetos\/"},"modified":"2014-11-05T00:00:00","modified_gmt":"2014-11-05T00:00:00","slug":"identificacion-expresion-y-caracterizacion-de-peroxidasas-lignola%c2%adticas-de-interes-en-genomas-de-basidiomicetos","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/toxicologia\/identificacion-expresion-y-caracterizacion-de-peroxidasas-lignola%c2%adticas-de-interes-en-genomas-de-basidiomicetos\/","title":{"rendered":"Identificaci\u00f3n, expresi\u00f3n y caracterizaci\u00f3n de peroxidasas            lignol\u00edticas de inter\u00e9s en genomas de basidiomicetos"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Elena Fernandez Fueyo <\/strong><\/h2>\n<p>La secuenciaci\u00f3n de los genomas de pleurotus ostreatus y ceriporiopsis subvermispora nos ha permitido investigar las propiedades bioqu\u00edmicas, estructurales y operacionales de las diferentes hemoperoxidasas ligninol\u00edticas presentes en dos hongos modelo de inter\u00e9s biotecnol\u00f3gico.La caracterizaci\u00f3n de las peroxidasas de clase ii  del genoma de p. Ostreatus revela un repertorio formado por tres peroxidasas vers\u00e1tiles vps y seis manganeso peroxidasas mnps. Los estudios estructurales funcionales de las seis mnps de p. Ostreatus revelan que \u00e9stas constituyen una nueva subfamilia, caracterizada por su actividad independiente de mn sobre algunos sustratos y por la presencia de una cola en el extremo c-terminal m\u00e1s corta que en las t\u00edpicas mnps largas. Se ha cristalizado el primer miembro de esta nueva subfamilia. Adem\u00e1s, usando d\u00edmeros modelo y lignina sint\u00e9tica marcados radioactivamente se ha mostrado por primera vez la capacidad de las vps para degradar la lignina, confirmando que la vp desempe\u00f1a en p. Ostreatus el papel desempe\u00f1ando por la lip en p. Chrysosporium.Las isoenzimas muestran grandes diferencias en su estabilidad a la temperatura y al ph. La isoenzima m\u00e1s estable al ph y la m\u00e1s estable a la temperatura se cristalizaron. Para investigar el significado biol\u00f3gico de la duplicaci\u00f3n de genes, se analizaron por rt qpcr las diferencias en su expresi\u00f3n cuando se modifican las condiciones de temperatura y ph en cultivos lignocelul\u00f3sicos, en combinaci\u00f3n con estudios prote\u00f3micos y medidas de actividad. Los genes de algunas de las enzimas m\u00e1s estables mostraron niveles de transcripci\u00f3n relativa mayores en las condiciones m\u00e1s extremas de ph y temperatura ensayadas. Estos resultados muestran una regulaci\u00f3n ambiental de la expresi\u00f3n de las isoenzimas.El genoma de c. Subvermispora mostr\u00f3 un n\u00famero inusualmente elevado de mnps, junto con genes implicados en la s\u00edntesis de \u00e1cidos grasos insaturados, sugiriendo su contribuci\u00f3n en la degradaci\u00f3n de la lignina a traves de los radicales derivados de la peroxidaci\u00f3n de los l\u00edpidos. Tambi\u00e9n se identificaron dos genes de una putativa lip y una putativa vp, estos genes se expresaron y las prote\u00ednas obtenidas se caracterizaron bioqu\u00edmicamente confirmando su capacidad de degradar directamente la lignina. Estos estudios confirman que los dos nuevos genes identificados corresponden a lips funcionales, que posiblemente representan formas de transici\u00f3n entre vp y lip. En los \u00faltimos estudios de los genomas de basidiomicetos se ha diferenciado una nueva subfamilia de mnps, denominada mnp extralargas. Los tres tipos est\u00e1n presentes en el genoma de c. Subvermispora y se han caracterizado bioqu\u00edmica y estructuralmente y se realizaron estudios de mutag\u00e9nesis dirigida en la cola c terminal. La eliminaci\u00f3n de la cola confiere a las mnps largas y extralargas la actividad independiente de mn que caracteriza a las mnps cortas. Estos estudios concluyen que las mnp de tipo corto constituyen una subfamilia verdadera, con diferentes propiedades catal\u00edticas y de estabilidad, mientras que las mnps llamadas largas y extralargas no muestran suficientes diferencias para considerarse dos subfamilias diferentes. Una mnp extralarga extremadamente estable al ph \u00e1cido fue cristalizada, siendo la primera peroxidasa de este tipo de la que se obtiene la estructura molecular. Esta mnp se us\u00f3 como una base robusta para, mediante la introducci\u00f3n de un tript\u00f3fano catal\u00edtico, construir una peroxidasa de inter\u00e9s biotecnol\u00f3gico capaz de actuar a ph extremadamente \u00e1cido.Los resultados obtenidos en la presente tesis han permitido establecer la existencia de enzimas de tipo lip en c. Subvermispora y su ausencia en p. Ostreatus, donde estar\u00edan sustituidas por vps. Adem\u00e1s se aporta la primera caracterizaci\u00f3n estructural-funcional de las mnp cortas, y muestran que las descritas como mnps largas y extralargas no presentan suficientes diferencias para establecer dos subfamilias.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Identificaci\u00f3n, expresi\u00f3n y caracterizaci\u00f3n de peroxidasas            lignol\u00edticas de inter\u00e9s en genomas de basidiomicetos<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Identificaci\u00f3n, expresi\u00f3n y caracterizaci\u00f3n de peroxidasas            lignol\u00edticas de inter\u00e9s en genomas de basidiomicetos <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Elena Fernandez Fueyo <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Complutense de Madrid<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 11\/05\/2014<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Angel Tomas Martinez Ferrer<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: concepcion Gil garcia <\/li>\n<li>eduardo Antonio Espeso fernandez (vocal)<\/li>\n<li>Miguel Alcalde galeote (vocal)<\/li>\n<li>Jos\u00e9 M\u00aa Barrasa gonz\u00e1lez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Elena Fernandez Fueyo La secuenciaci\u00f3n de los genomas de pleurotus ostreatus y ceriporiopsis subvermispora nos ha permitido [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[986,401],"tags":[10421,50945,149253,228636,228637,102458],"class_list":["post-115623","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-complutense-de-madrid","category-toxicologia","tag-angel-tomas-Martinez-ferrer","tag-concepcion-gil-garcia","tag-eduardo-antonio-espeso-fernandez","tag-elena-fernandez-fueyo","tag-jose-ma-barrasa-gonzalez","tag-miguel-alcalde-galeote"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/115623","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=115623"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/115623\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=115623"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=115623"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=115623"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}