{"id":11573,"date":"2018-03-09T08:57:00","date_gmt":"2018-03-09T08:57:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/comparacion-computacional-de-estructuras-de-proteinas-aplicacion-al-estudio-de-un-inhibidor-de-carboxipeptidasa-como-agente-antitumoral\/"},"modified":"2018-03-09T08:57:00","modified_gmt":"2018-03-09T08:57:00","slug":"comparacion-computacional-de-estructuras-de-proteinas-aplicacion-al-estudio-de-un-inhibidor-de-carboxipeptidasa-como-agente-antitumoral","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/bioquimica-molecular\/comparacion-computacional-de-estructuras-de-proteinas-aplicacion-al-estudio-de-un-inhibidor-de-carboxipeptidasa-como-agente-antitumoral\/","title":{"rendered":"Comparacion computacional de estructuras de proteinas. aplicacion al estudio de un inhibidor de carboxipeptidasa como agente antitumoral"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Jos\u00e9 Manuel Mas Benavente <\/strong><\/h2>\n<p>El objetivo general de esta tesis se enmarca en un proyecto m\u00e1s amplio de ingenier\u00eda que trata de analizar y redise\u00f1ar la estructura, camino de plegamiento, funci\u00f3n natural y aplicaciones biotecnol\u00f3gicas de una prote\u00edna, el pci (potato carboxypeptidase inhibidor). Las caracter\u00edsticas estructurales de esta prote\u00edna, esencialmente sus puentes de azufre, nos invitaron a realizar un estudio general en prote\u00ednas ricas en puentes de azufre. Para realizar este an\u00e1lisis se desarrollaron los siguientes puntos:  1.\tSe abord\u00f3 el dise\u00f1o y creaci\u00f3n de un programa para el an\u00e1lisis estructural de topolog\u00edas disulfuro en prote\u00ednas ricas en puentes de azufre(knot-match). Este programa lleva implementado un algoritmo que permite la comparaci\u00f3n espacial de los puentes de azufre de las prote\u00ednas. 2.\tSe complet\u00f3 el anterior programa con los algoritmos necesarios para obtener una clasificaci\u00f3n autom\u00e1tica de prote\u00ednas ricas en puentes de azufre, es decir, se implementaron los algoritmos de agrupaci\u00f3n de prote\u00ednas. 3.\tFinalmente, se introdujeron las herramientas necesarias para obtener superposiciones de prote\u00ednas basadas en la topolog\u00eda de sus puentes de azufre a fin de permitir an\u00e1lisis estructurales m\u00e1s completos.  el programa knot-match(http:\/\/luz.Uab.Es) nos permiti\u00f3 extraer las siguientes conclusiones:  1.\tSe establecieron m\u00e9todos algoritmos matem\u00e1ticos para superponer estructuralmente prote\u00ednas ricas en puentes de azufre. 2.\tSe determin\u00f3 que la topolog\u00eda de puentes de azufre de una prote\u00edna muestra ciertas regularidades entre prote\u00ednas aparentemente no relacionadas. Esto nos permiti\u00f3 relacionar estructuralmente prote\u00ednas que por los m\u00e9todos cl\u00e1sicos no hubiera sido posible. 3.\tSe ha establecido una clasificaci\u00f3n preliminar de prote\u00ednas basada en la topolog\u00eda de sus puentes de azufre. Se ha propuesto la redefinici\u00f3n del grupo de prote\u00ednas conocido como t-knot agrupando las definiciones dadas por diversos autores. 4.\tSe han predicho los determinantes estructurales que permiten explicar el efecto antagonista del pci al egf (factor de crecimiento epid\u00e9rmico) al unirse a los receptores egfr y se han realizado los an\u00e1lisis previos a la construcci\u00f3n de una quimera pci-egf:  posteriormente a este an\u00e1lisis hemos desarrollado un programa fol.-Scope que permite la comparaci\u00f3n de esqueletos polipept\u00eddicos de prote\u00ednas utilizando m\u00e9todos de visi\u00f3n por computaci\u00f3n. Estos algoritmos permiten eliminar errores cl\u00e1sicos de las metodolog\u00edas utilizadas parala superposici\u00f3n de estructuras, aumentar la eficiencia de c\u00e1lculo para este cometido y disponer de un algoritmo eficiente para comparar elementos subestructurales y esqueletos polipept\u00eddicos de prote\u00ednas.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Comparacion computacional de estructuras de proteinas. aplicacion al estudio de un inhibidor de carboxipeptidasa como agente antitumoral<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Comparacion computacional de estructuras de proteinas. aplicacion al estudio de un inhibidor de carboxipeptidasa como agente antitumoral <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Jos\u00e9 Manuel Mas Benavente <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Aut\u00f3noma de barcelona<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 22\/06\/2001<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Francesc Xavier Avil\u00e9s Puigvert<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: esteve Padr\u00f3s morell <\/li>\n<li>baldomero Oliva Miguel (vocal)<\/li>\n<li>Rafael De llorens duran (vocal)<\/li>\n<li>angel Mozo villarias (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Jos\u00e9 Manuel Mas Benavente El objetivo general de esta tesis se enmarca en un proyecto m\u00e1s amplio 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