{"id":117554,"date":"2015-02-06T00:00:00","date_gmt":"2015-02-06T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/gestion-de-la-diversidad-genetica-en-programas-de-conservacion-utilizando-datos-de-genotipado-masivo\/"},"modified":"2015-02-06T00:00:00","modified_gmt":"2015-02-06T00:00:00","slug":"gestion-de-la-diversidad-genetica-en-programas-de-conservacion-utilizando-datos-de-genotipado-masivo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/genetica\/gestion-de-la-diversidad-genetica-en-programas-de-conservacion-utilizando-datos-de-genotipado-masivo\/","title":{"rendered":"Gestion de la diversidad gen\u00e9tica en programas de conservaci\u00f3n  utilizando datos de genotipado masivo."},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Fernando Gomez Romano <\/strong><\/h2>\n<p>El mantenimiento de la diversidad gen\u00e9tica existente en una poblaci\u00f3n y, a m\u00e1s   corto plazo, el control de la tasa a la cual aumenta la consanguinidad son los principales   objetivos de los programas de conservaci\u00f3n, tanto de especies salvajes como de especies   dom\u00e9sticas.  el m\u00e9todo de contribuciones \u00f3ptimas (oc, del ingl\u00e9s \u00c2\u00bfoptimal contributions\u00c2\u00bf)   es reconocido como el m\u00e1s eficiente para controlar la p\u00e9rdida de variabilidad gen\u00e9tica y   el aumento de la consanguinidad en una poblaci\u00f3n. Este m\u00e9todo optimiza las   contribuciones (n\u00famero de hijos) de los reproductores potenciales a la siguiente   generaci\u00f3n para minimizar el parentesco promedio. El parentesco puede obtenerse tanto a   partir de registros geneal\u00f3gicos como de marcadores moleculares. Estudios previos han   demostrado que cuando la densidad de marcadores es relativamente baja (ej.,   microsat\u00e9lites), el parentesco molecular mantiene menos diversidad que el parentesco   geneal\u00f3gico. El genotipado masivo de polimorfismos de un solo nucle\u00f3tido (snps)   desarrollado en los \u00faltimos a\u00f1os ha permitido crear paneles mucho m\u00e1s densos que los   usados previamente, lo que hace necesaria la revaluaci\u00f3n del beneficio de utilizar   marcadores gen\u00e9ticos en la gesti\u00f3n de poblaciones.  en esta tesis se ha evaluado el uso de informaci\u00f3n gen\u00f3mica para la gesti\u00f3n de   diversidad gen\u00e9tica en programas de conservaci\u00f3n, empleando el m\u00e9todo oc para   minimizar el parentesco gen\u00f3mico en la descendencia.  la eficiencia del parentesco gen\u00f3mico para mantener diversidad gen\u00e9tica depende   del desequilibrio de ligamiento existente entre los marcadores y el resto de loci del   genoma. A su vez, el desequilibrio de ligamiento depende de la densidad de marcadores y   del censo efectivo de la poblaci\u00f3n (ne). En el cap\u00edtulo 1 se demuestra que una densidad   de 3ne snps\/morgan es suficiente para mantener la misma cantidad de diversidad   gen\u00e9tica utilizando el parentesco molecular que el geneal\u00f3gico. Tambi\u00e9n se demuestra   que el incremento en variabilidad mantenida que se obtiene al aumentar la densidad por   encima de alrededor de 500 snps\/morgan es muy peque\u00f1o.  otra ventaja del parentesco gen\u00f3mico es que permite mantener diversidad   gen\u00e9tica en regiones espec\u00edficas del genoma. En esta tesis se demuestra que su uso   combinado con el m\u00e9todo oc es muy eficiente tanto en el mantenimiento de diversidad   en una regi\u00f3n espec\u00edfica, como la restricci\u00f3n de la consiguiente p\u00e9rdida de diversidad en   el resto del genoma. Sin embargo, aunque los niveles de diversidad en el resto del   genoma son mayores cuando se incluye la restricci\u00f3n que cuando no se incluye, la tasa de   parentesco observada fue mayor que la restricci\u00f3n impuesta. Esto sugiere que es   necesario refinar la teor\u00eda de las contribuciones cuando se utilizan matrices gen\u00f3micas   para asegurar que las restricciones est\u00e1n debidamente consideradas en el modelo   (cap\u00edtulo 2).  en el cap\u00edtulo 3 se ha evaluado el uso de un parentesco calculado a partir de   segmentos ibd, que refleja la identidad en estado mejor que el parentesco gen\u00f3mico   empleado en los cap\u00edtulos 1 y 2, en el mantenimiento de diversidad gen\u00e9tica. El ne   calculado a partir de datos de tres poblaciones de vacuno austriacas fue de peque\u00f1a   magnitud, lo que destaca la importancia de la aplicaci\u00f3n de estrategias activas de gesti\u00f3n   para controlar el aumento de la consanguinidad y parentesco en razas de especies   ganaderas, incluso si los tama\u00f1os poblacionales son razonablemente grandes.  el principal problema que presenta el c\u00e1lculo del parentesco basado en segmentos   ibd es la necesidad de conocer las fases gam\u00e9ticas de los snps utilizados. En el cap\u00edtulo   3 se demuestra que la necesidad de estimar las fases gam\u00e9ticas en cada generaci\u00f3n para   llevar a cabo el manejo no lleva consigo una p\u00e9rdida en la diversidad mantenida. Esto es   cierto incluso cuando las poblaciones son muy peque\u00f1as, como suelen ser aquellas objeto   de un programa de conservaci\u00f3n.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Gestion de la diversidad gen\u00e9tica en programas de conservaci\u00f3n  utilizando datos de genotipado masivo.<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Gestion de la diversidad gen\u00e9tica en programas de conservaci\u00f3n  utilizando datos de genotipado masivo. <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Fernando Gomez Romano <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Complutense de Madrid<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 02\/06\/2015<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Beatriz Villanueva Gavi\u00f1a<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: aurora Garc\u00eda-dorado Garc\u00eda <\/li>\n<li>Miguel angel Toro iba\u00f1ez (vocal)<\/li>\n<li>Mar\u00eda Saura \u00e1lvarez (vocal)<\/li>\n<li>carmen Amador arranz (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Fernando Gomez Romano El mantenimiento de la diversidad gen\u00e9tica existente en una poblaci\u00f3n y, a m\u00e1s corto 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