{"id":11828,"date":"2018-03-09T08:57:24","date_gmt":"2018-03-09T08:57:24","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/identificacion-por-tecnicas-de-modelizacion-molecular-de-interacciones-mediadas-por-agua-en-complejos-hla-dr1-aplicacion-al-estudio-del-modo-de-union-de-peptidos-2-6-11\/"},"modified":"2018-03-09T08:57:24","modified_gmt":"2018-03-09T08:57:24","slug":"identificacion-por-tecnicas-de-modelizacion-molecular-de-interacciones-mediadas-por-agua-en-complejos-hla-dr1-aplicacion-al-estudio-del-modo-de-union-de-peptidos-2-6-11","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/quimica\/identificacion-por-tecnicas-de-modelizacion-molecular-de-interacciones-mediadas-por-agua-en-complejos-hla-dr1-aplicacion-al-estudio-del-modo-de-union-de-peptidos-2-6-11\/","title":{"rendered":"Identificaci\u00f3n por t\u00e9cnicas de modelizaci\u00f3n molecular de interacciones mediadas por agua en complejos hla-dr1. aplicaci\u00f3n al estudio del modo de uni\u00f3n de p\u00e9ptidos \u00ab2-6-11\u00bb."},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Luis Gracia Val\u00e9n <\/strong><\/h2>\n<p>La uni\u00f3n de p\u00e9ptidos antig\u00e9nicos a las mol\u00e9culas del complejo mayor de histocompatibilidad de clase ii est\u00e1 mediada, en parte, por un conjunto conservado en enlaces de hidr\u00f3geno intermoleculares. Varias mol\u00e9culas de agua estructural han sido identificadas con anterioridad en complejos cristalogr\u00e1ficos de estructuras de hla-ii dr1 y p\u00e9ptido. Estas pueden participar en redes de enlaces de hidr\u00f3geno entre el hla y elp\u00e9ptido.  en la primera parte de este trabajo se han estudiado las implicaciones de este tipo de mol\u00e9culas de agua mediante el potencial de interacci\u00f3n molecular con una sonda de agua. Se han propuesto nueve zonas potenciales de agua en el interior de los complejos. Este tipo de aguas puede ser incoporado en el dise\u00f1o racional de nuevos compuestos peptidomim\u00e9ticos capaces de unirse a mol\u00e9culas hla-dr1. Especialmente cabe destacar el papel que pueden desempe\u00f1ar en este sentido hasta dos mol\u00e9culas de agua en el bolsillo p1, permitiendo, as\u00ed, la redefinici\u00f3n de las preferncias de uni\u00f3n de residuos en el mismo.  en un segundo estudio se ha propuesto el modo de uni\u00f3n de un conjunto de p\u00e9ptidos con un motivo com\u00fan, denominado \u00ab2-6-11\u00bb, que se unen al hla de clase ii, cuyas secuencias se ha encontrado en prote\u00ednas relacionada con numerosas enfermedades autoinmunes.  con el objetivo de probar estas hip\u00f3tesis hemos realizado varias simulaciones de din\u00e1mica molecular del hla-dr1 con dos p\u00e9ptidos. El primero se encuenta en la base de datos pdb, con trp en posici\u00f3n (+1). El segundo, un p\u00e9ptido \u00ab2-6-11\u00bb con lys en esta posici\u00f3n, se construyo por t\u00e9cnicas de modelizaci\u00f3n molecular. Se analiz\u00f3 especialmente el movimiento de las aguas. Para el p\u00e9ptido con trp solo una de las mol\u00e9culas de agua permaneci\u00f3 estable en el bolsillo p1, mientras que para el p\u00e9ptido con lys, las dos mol\u00e9culas de agua permanecen estables en el mismo y parecen importantes para la uni\u00f3n de este p\u00e9ptido.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Identificaci\u00f3n por t\u00e9cnicas de modelizaci\u00f3n molecular de interacciones mediadas por agua en complejos hla-dr1. aplicaci\u00f3n al estudio del modo de uni\u00f3n de p\u00e9ptidos \u00ab2-6-11\u00bb.<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Identificaci\u00f3n por t\u00e9cnicas de modelizaci\u00f3n molecular de interacciones mediadas por agua en complejos hla-dr1. aplicaci\u00f3n al estudio del modo de uni\u00f3n de p\u00e9ptidos \u00ab2-6-11\u00bb. <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Luis Gracia Val\u00e9n <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Navarra<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 29\/06\/2001<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Mar\u00eda Font Arellano<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: esteban Santiago calvo <\/li>\n<li>Carlos G\u00f3mez-moreno calera (vocal)<\/li>\n<li>natalia Mar\u00eda Lopez moratalia (vocal)<\/li>\n<li>ferran Sanz carreras (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Luis Gracia Val\u00e9n La uni\u00f3n de p\u00e9ptidos antig\u00e9nicos a las mol\u00e9culas del complejo mayor de histocompatibilidad de [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[160,561,17749,17,457,966],"tags":[15142,17968,2515,38798,18203,13081],"class_list":["post-11828","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-bioquimica","category-farmacologia-molecular","category-navarra","category-quimica","category-quimica-farmaceutica","category-quimica-macromolecular","tag-carlos-gomez-moreno-calera","tag-esteban-santiago-calvo","tag-ferran-sanz-carreras","tag-luis-gracia-valen","tag-maria-font-arellano","tag-natalia-maria-lopez-moratalia"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11828","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11828"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11828\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11828"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11828"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11828"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}