{"id":61219,"date":"2007-06-11T00:00:00","date_gmt":"2007-06-11T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/analisis-genomico-global-de-plasmidos-de-pseudomonas-savastanoi-pv-savastanoi\/"},"modified":"2007-06-11T00:00:00","modified_gmt":"2007-06-11T00:00:00","slug":"analisis-genomico-global-de-plasmidos-de-pseudomonas-savastanoi-pv-savastanoi","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/malaga\/analisis-genomico-global-de-plasmidos-de-pseudomonas-savastanoi-pv-savastanoi\/","title":{"rendered":"Analisis genomico global de plasmidos de pseudomonas savastanoi pv. savastanoi"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Isabel Perez Martinez <\/strong><\/h2>\n<p>Durante los \u00faltimos a\u00f1os, se ha producido un progreso considerable en el conocimiento de las enfermedades de plantas herb\u00e1ceas causadas por pseudomonas fitopat\u00f3genas, sin embargo, los estudios dirigidos al an\u00e1lisis gen\u00f3mico funcional de bacterias fitopat\u00f3genas que afectan a \u00e1rboles frutales son escasos. Este tipo de an\u00e1lisis se encuentra limitado, sobre todo, por la carencia de cepas pat\u00f3genas modificables gen\u00e9ticamente. En este sentido, la tuberculosis del olivo, bacteriosis causada por pseudomonas savastanoi pv. Savastanoi (psv), no es una excepci\u00f3n. Para la selecci\u00f3n de cepas de psv modificables gen\u00e9ticamente, se determin\u00f3 la capacidad de una colecci\u00f3n de cepas de recibir adn ex\u00f3geno mediante t\u00e9cnicas de transferencia de genes (conjugaci\u00f3n, transformaci\u00f3n, transducci\u00f3n, etc). Adem\u00e1s, se comprob\u00f3 la validez de transposones derivados de mini-tn5 como herramientas moleculares en este pat\u00f3geno; cuatro cepas fueron seleccionadas por su accesibilidad a manipulaci\u00f3n gen\u00e9tica. La mayor\u00eda de las bacterias fitopat\u00f3genas pertenecientes al g\u00e9nero pseudomonas contienen pl\u00e1smidos nativos que codifican determinantes relacionados con la virulencia y supervivencia epif\u00edtica de estas cepas y que est\u00e1n englobados dentro de la familia del pl\u00e1smido ppt23a (pfp). Psv contiene este tipo de pl\u00e1smidos pero, sin embargo, la informaci\u00f3n codificada en ellos es pr\u00e1cticamente desconocida. Se plante\u00f3, por tanto, llevar a cabo un an\u00e1lisis gen\u00f3mico global de 32 pl\u00e1smidos aislados de diez cepas de este pat\u00f3geno. El n\u00famero de pfps por cepa vari\u00f3 entre uno y cuatro y, adem\u00e1s, la mayor\u00eda de las cepas conten\u00edan al menos un pl\u00e1smido no perteneciente a esta familia (n-pfp). El an\u00e1lisis de las hibridaciones con un macroarray de adn, compuesto por 135 genes pertenecientes a otros pfps secuenciados, revel\u00f3 la presencia en los pl\u00e1smidos de psv de genes relacionados con la bios\u00edntesis de fitohormonas, auxinas y citoquininas, mayoritariamente en pfps aunque tambi\u00e9n en n-pfp. La mayor\u00eda de estos pl\u00e1smidos de psv hibridaron tambi\u00e9n con genes codificadores del sistema de secreci\u00f3n tipo iv (t4ss) (tipo a y b), con al menos un gen codificador de un efector putativo del sistema de secreci\u00f3n tipo iii (ttss), con una gran variedad de otros genes de virulencia, y con uno o m\u00e1s genes codificadores de transposasas pertenecientes a secuencias de inserci\u00f3n. Estos resultados sugieren que los pl\u00e1smidos no pertenecientes a la familia pfp tambi\u00e9n podr\u00edan contribuir a la virulencia y adaptaci\u00f3n ecol\u00f3gica de psv. Para el estudio, m\u00e1s en profundidad, de la implicaci\u00f3n en virulencia de los pl\u00e1smidos de psv, se seleccion\u00f3 como cepa de referencia al aislado ncppb 3335 (psv48) por su virulencia en olivo y sus caracter\u00edsticas gen\u00e9ticas previamente estudiadas. Hibridaciones de estos pl\u00e1smidos con el macroarray de adn mencionado revel\u00f3 que ppsv48a y ppsv48b contienen al menos un gen codificador de un efector del ttss, genes implicados en la bios\u00edntesis del t4ss, y varias secuencias de inserci\u00f3n. El pl\u00e1smido ppsv48a contiene tambi\u00e9n ptz, involucrado en la bios\u00edntesis de citoquininas. Por el contrario, ppsv48c contiene pocos genes hom\u00f3logos a los descritos  en pfps de p. Syringae. La curaci\u00f3n en psv48 de uno de sus pl\u00e1smidos (ppsv48a) y de dos (ppsv48a y ppsv48b, tuvo como consecuencia en ambos casos una reducci\u00f3n de la virulencia en olivo. Dada la implicaci\u00f3n en virulencia del pl\u00e1smido ppsv48a, se decidi\u00f3 analizar m\u00e1s en profundidad su contenido gen\u00e9tico mediante secuenciaci\u00f3n. Se ha obtenido una secuencia de nucle\u00f3tidos que cubre aproximadamente el 69% del tama\u00f1o estimado para este pl\u00e1smido con un contenido gc del 57.7% muy similar al contenido medio de otros pl\u00e1smidos pfp de p. Syringae. La anotaci\u00f3n de la secuencia obtenida revel\u00f3 la existencia de al menos 41 marcos abiertos de lectura (orfs) en ppsv48a, estos pl\u00e1smidos, un 25% en conjugaci\u00f3n (sistema de secreci\u00f3n tipo iv), un 7% con la virulencia y ecolog\u00eda, un 7% con factores de transcripci\u00f3n, un 12% con secuencias de inserci\u00f3n, un 22% con funciones hipot\u00e9ticas y un 5% con funciones de otros tipos. Los resultados indican, adem\u00e1s, que ppsv48a se ha originado probablemente en varios pasos en los que han intervenido m\u00e1s de un pl\u00e1smido. Los resultados obtenidos en esta tesis constituyen las bases necesarias para llevar a cabo un an\u00e1lisis gen\u00f3mico funcional de un importante pat\u00f3geno del olivar.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Analisis genomico global de plasmidos de pseudomonas savastanoi pv. savastanoi<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Analisis genomico global de plasmidos de pseudomonas savastanoi pv. savastanoi <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Isabel Perez Martinez <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 M\u00e1laga<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 06\/11\/2007<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Cayo Juan Ramos Rodriguez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Jes\u00fas Murillo Martinez <\/li>\n<li>emilia Lopez solanilla (vocal)<\/li>\n<li>george w. Sundin (vocal)<\/li>\n<li>Mar\u00eda milagros L\u00f3pez gonz\u00e1lez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Isabel Perez Martinez Durante los \u00faltimos a\u00f1os, se ha producido un progreso considerable en el conocimiento de [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[38249,36606,7834],"tags":[121732,97332,135238,95171,38251,10466],"class_list":["post-61219","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-bacterias","category-biologia-molecular-de-microorganismos","category-malaga","tag-cayo-juan-ramos-rodriguez","tag-emilia-lopez-solanilla","tag-george-w-sundin","tag-isabel-perez-Martinez","tag-jesus-murillo-Martinez","tag-maria-milagros-lopez-gonzalez"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/61219","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=61219"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/61219\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=61219"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=61219"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=61219"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}