{"id":61771,"date":"2007-05-12T00:00:00","date_gmt":"2007-05-12T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/microdiversidad-de-especies-bacterianas-un-estudio-basado-en-multilocus-sequence-typing-mlst\/"},"modified":"2007-05-12T00:00:00","modified_gmt":"2007-05-12T00:00:00","slug":"microdiversidad-de-especies-bacterianas-un-estudio-basado-en-multilocus-sequence-typing-mlst","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/ciencias-de-la-vida\/microdiversidad-de-especies-bacterianas-un-estudio-basado-en-multilocus-sequence-typing-mlst\/","title":{"rendered":"Microdiversidad de especies bacterianas. un estudio basado en multilocus sequence typing mlst"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Sergio Galan Bartual <\/strong><\/h2>\n<p>El objetivo final del trabajo es el desarrollo de herramientas adecuadas para la caracterizaci\u00f3n y estudio de la distribuci\u00f3n espacial de taxones procari\u00f3tieos basadas en el an\u00e1lisis de los polimorfismos nucleot\u00eddicos.  desarrollo de un esquema de tipado por secuenciaci\u00f3n multilocica (mlst) para la caracterizaci\u00f3n de aislados cl\u00ednicos de acinetobacter baumannii. Se ha desarrollado y evaluado un esquema de tipado por mlst para a. Baumannii, empleando 40 aislados cl\u00ednicos obtenidos durante brotes epid\u00e9micos en hospitales de espa\u00f1a y alemania entre 1990 y 2001, as\u00ed como otros aislados europeos y cepas de referencia de la dsmz. Como controles se han utilizado dos aislados cl\u00ednicos de acinetobacter   13tu, dos aislados cl\u00ednicos de acinetobacter calcoaceticus y cepas de a.Calcoaceticus obtenidas de la dsmz pertenecientes todas ellas al complejo a.Calcoaceticus-abaumannii (acb). Los cebadores de pcr fueron dise\u00f1ados contra regiones conservadas de genes housekeeping: citrato sintasa (gtla), subunidad \u00edY de la dna girasa (gyrb), deshidrogenasa de glucosa g (gdhb), factor de recombinaci\u00f3n homologo (reca), chaperonina de 60-kda (cpnd60), glucosa 6-fosfato deshidrogenasa (gpi) y factores de la polimerasa de arn (rpod). Se identificaron un total de 20 perfiles al\u00e9licos distintos para las cepas de a. Baumannii estudiadas. Los datos obtenidos por mlst concordaron con los datos epidemiol\u00f3gicos generados por campo pulsado y   la t\u00e9cnica de amplificaci\u00f3n de fragmentos variables polim\u00f3rficos (aflp), lo que demuestra que el esquema de mlst desarrollado proporciona un elevado grado de resoluci\u00f3n y es una excelente herramienta para el estudio de la estructura de la poblaci\u00f3n y la epidemiolog\u00eda de a. Baumannii.    el an\u00e1lisis gen\u00e9tico de genes housekeeping revela un ecotipo de profundidad de alteromonas macleodii en el mar mediterr\u00e1neo. Se ha analizado la diversidad gen\u00e9tica de 19 aislados de alteromonas macleodii procedentes de diversas \u00e1reas geogr\u00e1ficas (oc\u00e9anos pac\u00edfico e \u00edndico, y diferentes partes del mar mediterr\u00e1neo) y aisladas a diferentes profundidades (desde la superficie hasta 3500m). Para ello se han secuenciado en cada uno de los aislados fragmentos del gen 16s rrna, el espaciador interno (its) entre los genes 16s y 23s rrna y fragmentos de los genes codificantes:   girasa b (gyrb) y subunidad beta de la rna polimerasa (rpob). Adem\u00e1s, se ha utilizado la t\u00e9cnica de aflp para caracterizar la similitud de las distintas cepas a nivel gen\u00f3mico. La mayor parte de esta similitud se ha visto reflejada en la existencia de un cl\u00faster de aislados procedentes de las profundidades del mediterr\u00e1neo y dos aislados del mar negro. En particular,  los aislados de las zonas de profundidad muestran una serie de diferencias consistentes respecto del resto de aislados, indicando la presencia de un ecotipo espec\u00edfico adaptado a vivir a esas profundidades. La amplificaci\u00f3n del gen gyrb y del its a partir de dna total recuperado de aguas del mediterr\u00e1neo profundo y una muestra del atl\u00e1ntico, revelaron la presencia del ecotipo de profundidad. Por otro lado, los aislados procedentes de aguas tropicales superficiales mostraron un remarcado nivel de semejanza con el primer aislado de a. Macleodii obtenido en hawai en 1972. Estos resultados muestran la existencia de dos linajes de distribuci\u00f3n global y la presencia de ecotipos adaptados a condiciones espec\u00edficas.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Microdiversidad de especies bacterianas. un estudio basado en multilocus sequence typing mlst<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Microdiversidad de especies bacterianas. un estudio basado en multilocus sequence typing mlst <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Sergio Galan Bartual <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Miguel hern\u00e1ndez de elche<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 05\/12\/2007<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Francisco Rodriguez Varela<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Antonio Ventosa ucero <\/li>\n<li>Juan  Carlos Rodriguez diaz (vocal)<\/li>\n<li>silvia Gonzalez acinas (vocal)<\/li>\n<li>david Ruiz arahal (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Sergio Galan Bartual El objetivo final del trabajo es el desarrollo de herramientas adecuadas para la caracterizaci\u00f3n 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