{"id":62426,"date":"2018-03-09T22:50:21","date_gmt":"2018-03-09T22:50:21","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/diseno-sa%c2%adntesis-y-estructura-de-dominios-helicoidales-influencia-de-la-introduccion-de-aminoacidos-d\/"},"modified":"2018-03-09T22:50:21","modified_gmt":"2018-03-09T22:50:21","slug":"diseno-sa%c2%adntesis-y-estructura-de-dominios-helicoidales-influencia-de-la-introduccion-de-aminoacidos-d","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/quimica-organica\/diseno-sa%c2%adntesis-y-estructura-de-dominios-helicoidales-influencia-de-la-introduccion-de-aminoacidos-d\/","title":{"rendered":"Dise\u00f1o, s\u00edntesis y estructura de dominios helicoidales. influencia de la introducci\u00f3n de amino\u00e1cidos d"},"content":{"rendered":"

Tesis doctoral de Carmen Giovana Granados Ram\u00edrez <\/strong><\/h2>\n

Dise\u00f1o, s\u00edntesis y caracterizaci\u00f3n de inhibidores de la fusi\u00f3n de vih-1 an\u00e1logos del p\u00e9ptido c34 de gp41 con d amino\u00e1cidos. en el proceso de fusi\u00f3n del virus del vih-1 a la c\u00e9lula diana intervienen las prote\u00ednas de la cubierta viral gp 120 y gp41. La gp120 al interaccionarcon el receptor cd4 y co-receptores sufre un cambio conformacional que enseguida causa cambios en la estructura de gp41. Esta prote\u00edna sufre una reorganizaci\u00f3n que conduce al acercamiento entre la regi\u00f3n n-terminal y la regi\u00f3n c-terminal de gp41 aproximando las membranas celular y viral entre s\u00ed. P\u00e9ptidos derivados de estas regiones, en especial de la regi\u00f3n c-termial, son inhibidores de la fusi\u00f3n del vih-1 a la c\u00e9lula blanco. Uno de estos p\u00e9ptidos denominado c34 tiene buenas propiedades como inhibidor de la fusi\u00f3n viral y forma complejos estables con el p\u00e9ptido n36 derivado de la regi\u00f3n n-terminal de gp41. En este cap\u00edtulo se describi\u00f3 el efecto de cambiar la quiralidad del p\u00e9ptido c34 total o parcialmente, para aumentar la estabilidad de este p\u00e9ptido frente a proteasas. Mientras los p\u00e9ptidos derivados de c34 con todo-d amino\u00e1cidos fueron incapaces de inhibir la fusi\u00f3n del vih-1; los p\u00e9ptidos heteroquirales, derivados de c34 con modificaciones puntuales por amino\u00e1cidos d en regi\u00f3n c y n-terminal, son capaces de formar complejos estables con un p\u00e9ptido de la regi\u00f3n n-terminal de g41 y pueden inhibir la fusi\u00f3n con un aumento de estabilidad frente a la degradaci\u00f3n por parte de la tripsina. identificaci\u00f3n de complejos heteroquirales entre p\u00e9ptidos todo-d y el fragmento n-terminal del dominio de b de la prote\u00edna a de staphyloccus aureus la prote\u00edna a es un factor patog\u00e9nico encontrado en la superficie del staphylococcus aureus. Esta prote\u00edna se ha usado extensivamente en t\u00e9cnicas inmunol\u00f3gicas debido a su habilidad para unirse al fragmento cristalizable de las inmunoglobulinas g1,2. Los responsables de este reconocimiento son 5 dominios anal\u00f3gicos denominados a, b, c, d y e. El dominio m\u00e1s estudiado de esta prote\u00edna es el dominio b, este dominio de 61 residuos se pliega en un tr\u00edmero de h\u00e9lices antiparalelas. P\u00e9ptidos derivados de la regi\u00f3n n-terminal de este dominio no tienen una estructura estable en soluci\u00f3n. Sin embargo, la presencia de la regi\u00f3n de p\u00e9ptidos correspondientes a la regi\u00f3n c-terminal del dominio forman complejos en soluci\u00f3n que aumentan el contenido helicoidal del sistema. En este cap\u00edtulo se dise\u00f1\u00f3 una quimioteca oboc (del ingl\u00e9s \u00abone bead one compound\u00bb) de 4096 p\u00e9ptidos con amino\u00e1cidos d. Derivados de la secuencia de la h\u00e9lice c-terminal el dominio b, con el objetivo de identificar p\u00e9ptidos todo-d capaces de interactuar con el fragmento n-terminal del dominio b. La quimioteca fue sintetizada sobre una resina de polietilenglicol (pega), compatible con medios acuosos, unida al espaciador bifuncional hmfs usando la estrategia de s\u00edntesis boc\/bzl. 21 p\u00e9ptidos de la quimioteca se encontraron afines al fragmento n-terminal del dominio b. El an\u00e1lisis de los p\u00e9ptidos mostr\u00f3 el motivo d-trp-d-lys en todas las secuencias. En un grupo de seis p\u00e9ptidos, posteriormente resintetizados, se encontr\u00f3 que conservaban la tendencia conformacional a h\u00e9lice alfa, de acuerdo a los espectros de dicro\u00edsmo circular. De acuerdo a lo encontrado por estudios realizados usando resonancia de plasmon superficial, los p\u00e9ptidos todo-d se un\u00edan con el fragmento n-terminal del dominio b formando complejos heteroquirales. s\u00edntesis, caracterizaci\u00f3n estructural y evaluaci\u00f3n de la interacci\u00f3n con inmunoglobulina g de nuevos an\u00e1logos del dominio b de la prote\u00edna a de staphylococcus aureus. los fragmentos correspondientes a la h\u00e9lice c-terminal y regi\u00f3n n-terminal del dominio b de la prote\u00edna a de s. Aureus forman complejos que aumentan la helicidad del sistema. En nuestro grupo se identificaron dos p\u00e9ptidos, que forman complejos con el fragmento n-terminal del dominio b, a partir del an\u00e1lisis de una quimioteca oboc de p\u00e9ptidos con solo amino\u00e1cidos l derivados de la h\u00e9lice c-terminal del dominio b. Estos an\u00e1logos se diferenciaban del p\u00e9ptido natural en los residuos ser 44 y leu 47. En este cap\u00edtulo se describe la caracterizaci\u00f3n estructural y evaluaci\u00f3n de la actividad de los complejos no covalentes formados entre estos p\u00e9ptidos y el fragmento n-terminal del dominio b. Despu\u00e9s de comprobar que el fragmento n-terminal interaccionaba con los an\u00e1logos no naturales de la h\u00e9lice c-terminal se sintetizaron los dos dominios b an\u00e1logos, de 61 residuos, con las modificaciones encontradas en la regi\u00f3n c-terminal (ser44phe leu47lys y ser44phe leu47val). El an\u00e1lisis de estructura por dicro\u00edsmo circular revel\u00f3 que los an\u00e1logos mostraban estructura helicoidal e incluso uno de ellos era t\u00e9rmicamente m\u00e1s estable. Por resonancia de plasmon superficial se encontr\u00f3 que los an\u00e1logos se un\u00edan a inmunoglobulina de conejo y al fragmento cristalizable de las inmunoglobulinas humano con una afinidad similar, aunque con cambios en las cin\u00e9ticas de asociaci\u00f3n y disociaci\u00f3n. La informaci\u00f3n estructural de cada residuo se analiz\u00f3 por medio de resonancia magn\u00e9tica nuclear. El c\u00e1lculo de la desviaci\u00f3n de los desplazamientos qu\u00edmicos y an\u00e1lisis de noes manifest\u00f3 que los dominios an\u00e1logos conservaron tres regiones helicoidales. Los experimentos de intercambio h\/d mostraron que el empaquetamiento de los an\u00e1logos difer\u00eda ligeramente del dominio b natural en las regiones que conectan las h\u00e9lices. Este an\u00e1lisis permiti\u00f3 evaluar la capacidad de la estrategia combinatoria oboc para dise\u00f1ar nuevas prote\u00ednas partiendo del reconocimiento entre fragmentos pept\u00eddicos. El dise\u00f1o de este tipo quimiotecas permitir\u00e1 introducir modificaciones no naturales en el dise\u00f1o de nuevas prote\u00ednas aumentando la diversidad de estructuras disponibles.<\/p>\n

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Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00abDise\u00f1o, s\u00edntesis y estructura de dominios helicoidales. influencia de la introducci\u00f3n de amino\u00e1cidos d<\/strong>\u00ab<\/h3>\n
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  • T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Dise\u00f1o, s\u00edntesis y estructura de dominios helicoidales. influencia de la introducci\u00f3n de amino\u00e1cidos d <\/li>\n
  • Autor:<\/strong>\u00a0 Carmen Giovana Granados Ram\u00edrez <\/li>\n
  • Universidad:<\/strong>\u00a0 Barcelona<\/li>\n
  • Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 16\/01\/2008<\/li>\n<\/ul>\n

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    Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n
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    • Director de la tesis<\/strong>\n
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      • Ernest Giralt Lledo<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n
      • Tribunal<\/strong>\n
          \n
        • Presidente del tribunal: david Andreu mart\u00ednez <\/li>\n
        • miriam Royo exp\u00f3sito (vocal)<\/li>\n
        • Marta Vilaseca casas (vocal)<\/li>\n
        • (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n

           <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

          Tesis doctoral de Carmen Giovana Granados Ram\u00edrez Dise\u00f1o, s\u00edntesis y caracterizaci\u00f3n de inhibidores de la fusi\u00f3n de vih-1 an\u00e1logos del […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[951,3178,416],"tags":[137856,5628,1100,137857,1098],"class_list":["post-62426","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-barcelona","category-proteinas","category-quimica-organica","tag-carmen-giovana-granados-ramirez","tag-david-andreu-Martinez","tag-ernest-giralt-lledo","tag-marta-vilaseca-casas","tag-miriam-royo-exposito"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/62426","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=62426"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/62426\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=62426"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=62426"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=62426"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}