{"id":64854,"date":"2018-03-09T22:52:55","date_gmt":"2018-03-09T22:52:55","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/la-conformacion-de-glicomimeticos-en-su-estado-libre-en-disolucion-y-asociados-a-sus-receptores-una-vision-3d-utilizando-rmn\/"},"modified":"2018-03-09T22:52:55","modified_gmt":"2018-03-09T22:52:55","slug":"la-conformacion-de-glicomimeticos-en-su-estado-libre-en-disolucion-y-asociados-a-sus-receptores-una-vision-3d-utilizando-rmn","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/quimica-organica\/la-conformacion-de-glicomimeticos-en-su-estado-libre-en-disolucion-y-asociados-a-sus-receptores-una-vision-3d-utilizando-rmn\/","title":{"rendered":"La conformaci\u00f3n de glicomim\u00e9ticos en su estado libre en disoluci\u00f3n y asociados a sus receptores. una visi\u00f3n 3d utilizando rmn"},"content":{"rendered":"

Tesis doctoral de Jos\u00e9 Juan Hern\u00e1ndez Gay <\/strong><\/h2>\n

Introducci\u00f3n%&\/las interacciones carbohidrato prote\u00edna se ven envueltas en un amplio rango de mecanismos biol\u00f3gicos, comenzando con la fertilizaci\u00f3n y extendi\u00e9ndose a diversas patolog\u00edas como el desarrollo tumoral. Tambi\u00e9n median en diversas actividades celulares, incluyendo el reconocimiento celular, el control del crecimiento y la apoptosis. Es obvio que un detallado conocimiento de de la estructura y din\u00e1mica de los carbohidratos, tanto libres como unidos a prote\u00ednas, es relevante.%&\/Para ello la rmn ha sido aplicada a este campo ya que puede proporcionar informaci\u00f3n conformacional y din\u00e1mica. Debido a las caracter\u00edsticas de los carbohidratos, especialmente a la flexibilidad, los par\u00e1metros de rmn deben complementarse con c\u00e1lculos computacionales, normalmente, de mec\u00e1nica o din\u00e1mica molecular, para poder definir las especies presentes en disoluci\u00f3n, sin ambig\u00ed\u00bcedades. %&\/Memoria %&\/el aprendizaje durante el periodo de disfrute de la ayuda ha estado principalmente orientado hacia la elucidaci\u00f3n de los equilibrios conformaciones de diferentes disac\u00e1ridos y trisac\u00e1ridos en disoluci\u00f3n en estado libre y al estudio de los complejos resultantes de algunos de estos compuestos con sus receptores. %&\/Concretamente, hacia la conformaci\u00f3n de acetales c\u00edclicos interglicos\u00eddicos en derivados c-glicos\u00eddicos, c-glic\u00f3sidos derivados de galactosa, s-glic\u00f3sidos derivados de la glucosa, otros an\u00e1logos de trehalosa (c-man-1,1-c-gal) con un grupo hidroxilo o \u00e1tomos de fl\u00faor en el puente, sobre un suf\u00e1tido natural y su c-an\u00e1logo correspondiente, el c-psc de mena y sobre el trisac\u00e1rido mannosyl quitobiosa libre y el glicopeptido manosil quitobiosa asparragina libre y asociado.%&\/Resultados y discusi\u00f3n%&\/en el estudio de los diferentes disac\u00e1ridos y trisac\u00e1ridos los c\u00e1lculos de mec\u00e1nica molecular y din\u00e1mica molecular se han realizado utilizando los campos de fuerzas mm3*, mm2* y amber*, implementados en macromodel 7.1 y maestro 7.5. %&\/Se han generando los mapas relajados de energ\u00eda de los diferentes compuestos en los que se han delimitado los conf\u00f3rmeros de menor energ\u00eda.%&\/En el caso de las simulaciones de din\u00e1mica molecular, varias geometr\u00edas correspondientes a los diferentes m\u00ednimos de energ\u00eda han sido utilizadas como estructura de partida.%&\/La asignaci\u00f3n de las se\u00f1ales de resonancia se ha realizado mediante la combinaci\u00f3n de experimentos cosy, tocsy, 1d y 2d-noesy\/roesy, hsqc y hsqc-tocsy.%&\/En un segundo paso se han llevado a cabo experimentos noesy y roesy para deducir la informaci\u00f3n conformacional y chequear las predicciones obtenidas mediante c\u00e1lculos computacionales y obtener as\u00ed la distribuci\u00f3n conformacional de cada uno de los compuestos en estudio. Para ello se ha utilizado un an\u00e1lisis cuantitativo de los efectos overhauser nucleares de estas mol\u00e9culas mediante la aproximaci\u00f3n de los espines aislados y la aproximaci\u00f3n de la matriz de relajaci\u00f3n completa.%&\/Siguiendo este protocolo se ha llevado a cabo, el an\u00e1lisis conformacional de todas las mol\u00e9culas comentadas. %&\/Los resultados obtenidos para acetales c\u00edclicos interglicos\u00eddicos derivados c-glicos\u00eddicos, asi como para los otros an\u00e1logos de trehalosa, indican que la geometr\u00eda de estas mol\u00e9culas depende fuertemente del tipo de sustituci\u00f3n qu\u00edmica y de su orientaci\u00f3n y que aunque se ha conseguido rigidificar en parte su estructrura ninguna de ellas parece capaz de mimetizar la conformaci\u00f3n bioactiva de slex.%&\/En el caso del sulf\u00e1tido y su c-an\u00e1logo correspondiente, los datos nos indican que el comportamiento conformacional en disoluci\u00f3n para estos compuestos es muy similar, pero el compuesto sint\u00e9tico presenta movimientos locales m\u00e1s r\u00e1pidos en la zona del enlace pseudo glicos\u00eddico lo que podria estar relacionado con su menor capacidad inmuno estimulante. %&\/Los resultados obtenidos del estudio conformacional y su interacci\u00f3n con el anticuerpo correspondiente del c-psc de mena nos indican que estamos ante una mol\u00e9cula muy flexible en disoluci\u00f3n, no pudi\u00e9ndose determinar en este caso una selecci\u00f3n conformacional del trisacarido por parte del anticuerpo en el complejo.%&\/Por \u00faltimo se han realizado estudios de interacci\u00f3n entre las cadenas n-glic\u00e1nicas de glicoprote\u00ednas y la heve\u00edna. Para ello se ha utilizado como ligando modelo el glicopeptido manosil quitobiosa asparragina. En un primer pasa se ha realizado el estudio conformacional del ligando libre tras el cual ha pasado al estudio del complejo carbohidrato proteina. El estudio de la interacci\u00f3n se monitoriz\u00f3 mediante una valoraci\u00f3n seguida mediante rmn que permiti\u00f3 obtener la constante de asociaci\u00f3n y los valores termodin\u00e1micos del proceso. Mediante la aplicaci\u00f3n de metodolog\u00eda y aplicaciones de m\u00e9todos modernos de modelizaci\u00f3n molecular de oligosac\u00e1ridos y compuestos relacionados se abord\u00f3 el estudio de la estructura tridimensional del complejo, concretamente c\u00e1lculos de \u00abdocking\u00bb y de din\u00e1mica molecular solvatada utilizando para ello los programas de c\u00e1lculo autodock 3.05 y amber 8. Los resultados obtenidos de esta modelizaci\u00f3n han sido confirmados, de momento de forma cualitativa, mediante la observaci\u00f3n de picos de cruce intermoleculares clave en el esprectro noesy del complejo.<\/p>\n

 <\/p>\n

Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00abLa conformaci\u00f3n de glicomim\u00e9ticos en su estado libre en disoluci\u00f3n y asociados a sus receptores. una visi\u00f3n 3d utilizando rmn<\/strong>\u00ab<\/h3>\n
    \n
  • T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 La conformaci\u00f3n de glicomim\u00e9ticos en su estado libre en disoluci\u00f3n y asociados a sus receptores. una visi\u00f3n 3d utilizando rmn <\/li>\n
  • Autor:<\/strong>\u00a0 Jos\u00e9 Juan Hern\u00e1ndez Gay <\/li>\n
  • Universidad:<\/strong>\u00a0 Aut\u00f3noma de Madrid<\/li>\n
  • Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 30\/05\/2008<\/li>\n<\/ul>\n

     <\/p>\n

    Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n
      \n
    • Director de la tesis<\/strong>\n
        \n
      • barbero Jim\u00e9nez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n
      • Tribunal<\/strong>\n
          \n
        • Presidente del tribunal: tom\u00e1s Torres cebada <\/li>\n
        • concepci\u00f3n Gonz\u00e1lez bello (vocal)<\/li>\n
        • beatriz De pascual-teresa fern\u00e1ndez (vocal)<\/li>\n
        • f. Javier Rojo marcos (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n

           <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

          Tesis doctoral de Jos\u00e9 Juan Hern\u00e1ndez Gay Introducci\u00f3n%&\/las interacciones carbohidrato prote\u00edna se ven envueltas en un amplio rango de mecanismos […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[416],"tags":[88022,132988,2801,143093,143092,6778],"class_list":["post-64854","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-quimica-organica","tag-barbero-jimenez","tag-beatriz-de-pascual-teresa-fernandez","tag-concepcion-gonzalez-bello","tag-f-javier-rojo-marcos","tag-jose-juan-hernandez-gay","tag-tomas-torres-cebada"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/64854","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=64854"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/64854\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=64854"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=64854"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=64854"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}