{"id":65306,"date":"2018-03-09T22:53:25","date_gmt":"2018-03-09T22:53:25","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/implicaciones-funcionales-de-la-topoisomerasas-de-dna-en-s-cerevisiae-analisis-genomico-mediante-chips-de-dna\/"},"modified":"2018-03-09T22:53:25","modified_gmt":"2018-03-09T22:53:25","slug":"implicaciones-funcionales-de-la-topoisomerasas-de-dna-en-s-cerevisiae-analisis-genomico-mediante-chips-de-dna","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/barcelona\/implicaciones-funcionales-de-la-topoisomerasas-de-dna-en-s-cerevisiae-analisis-genomico-mediante-chips-de-dna\/","title":{"rendered":"Implicaciones funcionales de la topoisomerasas de dna en s. cerevisiae: analisis genomico mediante chips de dna"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Ignacio Bermudez Herrojo <\/strong><\/h2>\n<p>Los psoralenos son compuestos planos tric\u00edclicos que se pueden intercalar en el d\u00faplex de dna. La intercalaci\u00f3n ocurre preferentemente en regiones libres de prote\u00ednas y es muy sensible a la tensi\u00f3n helicoidal del dna. Mediante irradiaci\u00f3n uv, los complejos dna-psoraleno se convierten en enlaces covalentes entre las dos hebras del dna. Nuestro objetivo es obtener una serie de novedosos perfiles de la topolog\u00eda del dna mediante el mapeo de la distribuci\u00f3n de los sitios de foto-enlace dna -psoraleno a lo largo del genoma de s. Cerevisiae; a continuaci\u00f3n analizar c\u00f3mo estos perfiles cambian en diferentes mutantes en topoisomerasas y c\u00f3mo correlacionan con otros elementos funcionales o estructurales. Los cultivos de levadura se incubaron con psoraleno y se irradiaron para producir pocos foto-enlaces (1\/10 kb) en dna cromos\u00f3mico. Los fragmentos con foto-enlace dna-psoraleno se seleccionaron mediante una digesti\u00f3n secuencial con exonucleasas y marcados radiactivamente para su posterior hibridaci\u00f3n en chips de dna gen\u00f3mico. Como se esperaba, la distribuci\u00f3n gen\u00f3mica de foto-enlaces producida in vivo difer\u00eda notablemente con la obtenida en un dna sin tensi\u00f3n helicoidal ni uni\u00f3n de prote\u00ednas in vitro. Numerosas regiones cromos\u00f3micas presentan patrones de foto-enlace dna -psoraleno significativamente desviados de la distribuci\u00f3n global, que posiblemente reflejan dominios topol\u00f3gicos o estructurales de la cromatina. La inactivaci\u00f3n de la topoisomerasa ii en c\u00e9lulas dtop- top2-ts producen cambios dr\u00e1sticos en el foto-enlace dna-psoraleno en regiones muy particulares de los cromosomas iv y ix, los cuales est\u00e1n delimitados por elementos boundaries. Cuando se compararon los perfiles de foto-enlace con los generados mediante ensayos de genomic run on llevados a cabo en las mismas c\u00e9lulas, no se encontraron correlaciones sistem\u00e1ticas con la actividad transcripcional. Estos estudios de transcripci\u00f3n revelaron, sin embargo, que todos los genes reprimidos al inactivar la topoisomerasa ii comparten una arquitectura especial en sus promotores. Tienen un nucleosoma muy bien posicionado en la regi\u00f3n anterior al sitio de inicio de la transcripci\u00f3n. Los ensayos a escala gen\u00f3mica de la topolog\u00eda del dna y de la funci\u00f3n de las topoisomerasas proporcionan novedosas aportaciones para resolver los mecanismos de organizaci\u00f3n en ordenes superiores de la cromatina y de la regulaci\u00f3n de la expresi\u00f3n g\u00e9nica.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Implicaciones funcionales de la topoisomerasas de dna en s. cerevisiae: analisis genomico mediante chips de dna<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Implicaciones funcionales de la topoisomerasas de dna en s. cerevisiae: analisis genomico mediante chips de dna <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Ignacio Bermudez Herrojo <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Barcelona<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 17\/06\/2008<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Joaquim Roca  Bosch<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: benjam\u00ed Pi\u00f1a cap\u00f3 <\/li>\n<li>Jos\u00e9 Garcia (vocal)<\/li>\n<li>josep Portugal (vocal)<\/li>\n<li>christoforos Nikolaou (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Ignacio Bermudez Herrojo Los psoralenos son compuestos planos tric\u00edclicos que se pueden intercalar en el d\u00faplex de 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