{"id":71631,"date":"2004-02-12T00:00:00","date_gmt":"2004-02-12T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/desarrollo-de-neuvas-herrameintas-metodologicas-para-el-diseno-de-farmacos-basado-en-la-estructura-del-receptor\/"},"modified":"2004-02-12T00:00:00","modified_gmt":"2004-02-12T00:00:00","slug":"desarrollo-de-neuvas-herrameintas-metodologicas-para-el-diseno-de-farmacos-basado-en-la-estructura-del-receptor","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/quimica-organica\/desarrollo-de-neuvas-herrameintas-metodologicas-para-el-diseno-de-farmacos-basado-en-la-estructura-del-receptor\/","title":{"rendered":"Desarrollo de neuvas herrameintas metodologicas para el dise\u00f1o de farmacos basado en la estructura del receptor"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Carlos Perez Martinez <\/strong><\/h2>\n<p>En el presente proyecto de investigaci\u00f3n se han abordado tanto el desarrollo metodol\u00f3gico en el campo del reconocimiento molecular, aplic\u00e1ndolo al dise\u00f1o de f\u00e1rmacos basados en la estructura del receptor, como la utilizaci\u00f3n de herramientas cl\u00e1sicas de modelado molecular para esclarecer el modo de interacci\u00f3n con su receptor de diferentes f\u00e1rmacos.  uno de los objetivos principales de esta tesis se centro en la validaci\u00f3n y mejora de un nuevo m\u00e9todo para la predicci\u00f3n de la afinidad de un f\u00e1rmaco por su receptor denominado combine. Por un lado, se trato de comprobar la utilidad de m\u00e9todo como herramienta e uso general para este prop\u00f3sito. Para ello se utilizaron sistemas bien diferenciados desde el punto de vista de las interacciones moleculares, as\u00ed como de la calidad de los datos disponibles. Por otro lado se introdujeron posibles mejoras de la funci\u00f3n de mec\u00e1nica molecular empleada en combine , las cuales consistieron en un tratamiento m\u00e1s riguroso de las interacciones electrost\u00e1ticas y en la inclusi\u00f3n de efectos de solvataci\u00f3n.  en el transcurso de este ejercicio se pudo comprobar la notable influencia del modo de uni\u00f3n ligando-receptor en la predicci\u00f3n de afinidad. Con la idea de utilizar combine en la predicci\u00f3n de afinidad de librer\u00edas de compuestos se plante\u00f3 la necesidad de contar con un m\u00e9todo de uni\u00f3n ligando-receptor suficientemente preciso. El desarrollo de un algoritmo para tal fin, basado en la b\u00fasqueda exhaustiva de los modos de uni\u00f3n, llevo a preguntarse que funci\u00f3n era capaz de dar modos de uni\u00f3n m\u00e1s precisos. Considerando los escasos precedentes en la literatura, se desarrollo una metodolog\u00eda para evaluar de manera cuantitativa la precisi\u00f3n de las funciones analizando la calidad de los modos de uni\u00f3n obtenidos. Posteriormente se aplico al estudio de una funci\u00f3n basada en mec\u00e1nica molecular y de un potencial estad\u00edstico, el cual se presentaba como alternativa a las funciones cl\u00e1sicas para la predicci\u00f3n de modos de uni\u00f3n ligando-receptor. Este estudio permiti\u00f3 tener una estimaci\u00f3n mas realista de la capacidad de dichas funciones para predecir modos de uni\u00f3n correctamente, as\u00ed como obtener ciertas directrices para mejorarlas.  el otro gran reto de esta tesis consisti\u00f3 en el aplicaci\u00f3n de t\u00e9cnicas de modelado molecular en diversos problemas relacionados con la predicci\u00f3n del modo de uni\u00f3n de cabezas de serie para su posterior optimi9zacion considerando las interacciones moleculares como el receptor. Por un lado se abordo el desarrollo del modelo de uni\u00f3n al receptor para un f\u00e1rmaco antiviral a partir de las estructuras cristalogr\u00e1ficas del receptor con otros f\u00e1rmacos antivirales similares. La utilidad del modelo obtenido se limito a justificar las relaciones estructura-actividad de ciertos derivados, pero no fue \u00fatil para dise\u00f1ar f\u00e1rmacos con mayor afinidad. Por otro lado se planteo entender las bases moleculares de la selectividad que presentaba un f\u00e1rmaco antiinflamatorio, para lo cual fue necesario construir  en este caso un modelo de receptor basado en la homolog\u00eda con estructuras conocidas. Si bien las t\u00e9cnicas utilizadas permitieron se\u00f1alar las interacciones moleculares responsables de la selectividad observada, no se consigui\u00f3 obtener un modelo \u00fanico de uni\u00f3n. Parte de la dificultades encontradas durante el desarrollo de estos trabajos est\u00e1n relacionadas con la relativa fiabilidad de las t\u00e9cnicas de predicci\u00f3n de la uni\u00f3n ligando-receptor. Esta problem\u00e1tica se aborda desde el punto de vista metodol\u00f3gico en esta tesis por esta raz\u00f3n, adem\u00e1s de por su capital importancia en la mejora de la metodolog\u00eda combine.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Desarrollo de neuvas herrameintas metodologicas para el dise\u00f1o de farmacos basado en la estructura del receptor<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Desarrollo de neuvas herrameintas metodologicas para el dise\u00f1o de farmacos basado en la estructura del receptor <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Carlos Perez Martinez <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Alcal\u00e1<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 02\/12\/2004<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Federico Gago Badenas<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: enrique Galvez <\/li>\n<li>beatriz De pascual-teresa fern\u00e1ndez (vocal)<\/li>\n<li>Javier Luque (vocal)<\/li>\n<li>sonsoles Velazquez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Carlos Perez Martinez En el presente proyecto de investigaci\u00f3n se han abordado tanto el desarrollo metodol\u00f3gico en [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"ast-content-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"tablet":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""},"mobile":{"background-color":"var(--ast-global-color-5)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center center","background-size":"auto","background-attachment":"scroll","background-type":"","background-media":"","overlay-type":"","overlay-color":"","overlay-gradient":""}},"footnotes":""},"categories":[17426,416],"tags":[132988,156023,115952,30211,156024,156025],"class_list":["post-71631","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-alcala","category-quimica-organica","tag-beatriz-de-pascual-teresa-fernandez","tag-carlos-perez-Martinez","tag-enrique-galvez","tag-federico-gago-badenas","tag-javier-luque","tag-sonsoles-velazquez"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/71631","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=71631"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/71631\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=71631"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=71631"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=71631"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}