{"id":76214,"date":"2018-03-09T23:21:35","date_gmt":"2018-03-09T23:21:35","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/dinamica-evolutiva-de-los-retrotransposones-alu-en-el-genoma-humano\/"},"modified":"2018-03-09T23:21:35","modified_gmt":"2018-03-09T23:21:35","slug":"dinamica-evolutiva-de-los-retrotransposones-alu-en-el-genoma-humano","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/ciencias-de-la-vida\/dinamica-evolutiva-de-los-retrotransposones-alu-en-el-genoma-humano\/","title":{"rendered":"Din\u00e1mica evolutiva de los retrotransposones alu en el genoma humano"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Michael Hackenberg <\/strong><\/h2>\n<p>Los retrotransposones alu son los elementos transponibles m\u00e1s abundantes en el genoma humano. Desde su descubrimiento, se viene proponiendo que pueden haber jugado un papel relevante en la evoluci\u00f3n de los primates. Una caracter\u00edstica destacada a las alus es su distribuci\u00f3n diferencial a lo largo de los cromosomas en funci\u00f3n de su edad evolutiva: las alus m\u00e1s j\u00f3venes muestran una mayor densidad en regiones ricas en a+t, mientras que las m\u00e1s antiguas son m\u00e1s densas en regiones ricas en g+c. El objetivo principal de esta tesis es analizar la din\u00e1mica evolutivas las alus en el genoma humano e identificar los principales factores implicados en la generaci\u00f3n y mantenimiento de su distribuci\u00f3n espacial a lo largo de los cromosomas. para lograr este objetivo, se han implementado en primer lugar una serie de mejoras metodol\u00f3gicas:     1,- desarrollo de una colecci\u00f3n de programas en perl para procesar los datos primeros generados por repeatmasker e isofinder.     2,- correcci\u00f3n para sustituciones m\u00faltiples, aplicada aqu\u00ed por primera vez a los alineamientos de alus, con objeto de estimar con mayor precisi\u00f3n la edad evolutiva.     3,- desarrollo de una t\u00e9cnica de desfragmentaci\u00f3n de alus para eliminar la habitual sobreestimaci\u00f3n de estos elementos y aproximar mejor su n\u00famero real en el genoma.     4,- definici\u00f3n precisa, mediante t\u00e9cnicas in  silico, de los tr\u00edmeros de alus y de las alus solitarias, lo que ha permitido rastrear el genoma en busca de las huellas dejadas por la recombinaci\u00f3n.     5,- desarrollo de una nueva medida, independiente de la densidad, para el estudio de la clusterizaci\u00f3n de las alus.     a continuaci\u00f3n, comprando la densidad de elementos con diferente edad evolutiva en las distintas isocoras, se descartan algunos de los mecanismos propuestos para explicar el cambio de densidad: la interacci\u00f3n alu\/line1 (competencia por la retrotransposasa), el ajuste composicional, y la selecci\u00f3n positiva (acumulaci\u00f3n prefere<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Din\u00e1mica evolutiva de los retrotransposones alu en el genoma humano<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Din\u00e1mica evolutiva de los retrotransposones alu en el genoma humano <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Michael Hackenberg <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Granada<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 18\/09\/2005<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Jos\u00e9 Oliver Jim\u00e9nez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Jos\u00e9 Carlos Zapata babio <\/li>\n<li>joaqu\u00edn Dopazo bl\u00e1zquez (vocal)<\/li>\n<li>Antonio Mar\u00edn rodr\u00edguez (vocal)<\/li>\n<li>pedro j. Carpena s\u00e1nchez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Michael Hackenberg Los retrotransposones alu son los elementos transponibles m\u00e1s abundantes en el genoma humano. 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