{"id":87776,"date":"2000-09-12T00:00:00","date_gmt":"2000-09-12T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/herramientas-bioinformaticas-aplicadas-al-estudio-de-la-variabilidad-genetica-y-de-la-genomica-comparativa\/"},"modified":"2000-09-12T00:00:00","modified_gmt":"2000-09-12T00:00:00","slug":"herramientas-bioinformaticas-aplicadas-al-estudio-de-la-variabilidad-genetica-y-de-la-genomica-comparativa","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/herramientas-bioinformaticas-aplicadas-al-estudio-de-la-variabilidad-genetica-y-de-la-genomica-comparativa\/","title":{"rendered":"Herramientas bioinform\u00e1ticas aplicadas al estudio de la variabilidad gen\u00e9tica y de la gen\u00f3mica comparativa"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong>  Mart\u00edn Fern\u00e1ndez M. Jes\u00fas <\/strong><\/h2>\n<p>En esta tesis hemos desarrollado herramientas bioinform\u00e1ticas para estudiar diversos aspectos relacionados  con la variabilidad de los organismos aportando soluciones para datos con diversos grados de complejidad, desde secuencias individuales hasta genomas.  1,- una herramienta para detectar la regi\u00f3n de tama\u00f1o m\u00ednimo cuyo contenido informativo pueda ser suficiente para una reconstrucci\u00f3n filogen\u00e9tica correcta. el m\u00e9todo est\u00e1 basado en la comparaci\u00f3n de distancias gen\u00e9ticas entre pares de secuencias, obtenidas a partir de un grupo de referencia, con aquellas obtenidas para diferentes ventanas de tama\u00f1o y posici\u00f3n variable mediante un \u00edndice sencillo. Adem\u00e1s, hemos presentado dos procedimientos estad\u00edsticos para comprobar si el contenido informativo de las regiones seleccionadas con esta herramienta es significativamente distinta del contenido correspondiente mostrado por las regiones gen\u00f3micas utilizadas como referencia. Con esta herramienta hemos identificado regiones cuyo contenido informativo no es significativamente distinto del mostrado por las secuencias completas en las prote\u00ednas vp1 y p1 del virus de la fiebre aftosa y en prote\u00ednas del virus del sida.  2,- una herramienta para detectar selecci\u00f3n positiva en prote\u00ednas de genomas virales altamente variables. El m\u00e9todo est\u00e1 basado en el c\u00e1lculo de la tasa media de mutaicones no sin\u00f3micas frente a las sin\u00f3nimas (ns\/s), y en su representaci\u00f3n en funci\u00f3n de las distancias gen\u00e9ticas entre las secuencias comparadas. Con esta herramienta, hemos obtenido superficies en las que se pueden identificar regiones con selecci\u00f3n positiva en zonas antig\u00e9nicas de la prote\u00edna vp1 del virus  de la fiebre aftosa.  3,- una herramienta para representar perfiles de conservaci\u00f3n de genes entre genomas completos. Estos perfiles permiten visualizar, en genomas secuenciados completamente, diferentes caracter\u00edsticas del organismo estudiado y, al mismo tiempo, revelar caracte<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Herramientas bioinform\u00e1ticas aplicadas al estudio de la variabilidad gen\u00e9tica y de la gen\u00f3mica comparativa<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Herramientas bioinform\u00e1ticas aplicadas al estudio de la variabilidad gen\u00e9tica y de la gen\u00f3mica comparativa <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0  Mart\u00edn Fern\u00e1ndez M. Jes\u00fas <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Aut\u00f3noma de Madrid<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 09\/12\/2000<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Joaquin Dopazo Bl\u00e1zquez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: jose Fernandez piqueras <\/li>\n<li>Antonio Mar\u00edn rodr\u00edguez (vocal)<\/li>\n<li>Francisco Sobrino castello (vocal)<\/li>\n<li>cecilio L\u00f3pez gal\u00edndez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Mart\u00edn Fern\u00e1ndez M. 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