{"id":93505,"date":"2018-03-11T10:12:53","date_gmt":"2018-03-11T10:12:53","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/herramientas-de-cribado-virtual-aplicadas-a-inhibidores-de-entrada-del-vih-diseno-de-nuevos-compuestos-anti-vih\/"},"modified":"2018-03-11T10:12:53","modified_gmt":"2018-03-11T10:12:53","slug":"herramientas-de-cribado-virtual-aplicadas-a-inhibidores-de-entrada-del-vih-diseno-de-nuevos-compuestos-anti-vih","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/diseno-sintesis-y-estudio-de-nuevos-farmacos\/herramientas-de-cribado-virtual-aplicadas-a-inhibidores-de-entrada-del-vih-diseno-de-nuevos-compuestos-anti-vih\/","title":{"rendered":"Herramientas de cribado virtual aplicadas a inhibidores de entrada del vih. dise\u00f1o de nuevos compuestos anti-vih"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Violeta Isabel P\u00e9rez Nueno <\/strong><\/h2>\n<p>Los inhibidores de entrada del vih han surgido recientemente como una nueva generaci\u00f3n de f\u00e1rmacos antiretrovirales, los cuales bloquean la uni\u00f3n del virus con los co-receptores de membrana cxcr4 y ccr5. Se han desarrollado diversas mol\u00e9culas peque\u00f1as antagonistas de estos co-receptores, algunas de las cuales est\u00e1n actualmente en fase de ensayo cl\u00ednico. Sin embargo, dado que no existen estructuras cristalogr\u00e1ficas para estos co-receptores proteicos, es necesario analizar los modos de uni\u00f3n de inhibidores conocidos a la cavidad de uni\u00f3n extracelular de los co-receptores mediante experimentos de mutag\u00e9nesis dirigida y estudios computacionales. En general, el objetivo de estas aproximaciones computacionales es cribar un gran n\u00famero de compuestos candidatos a f\u00e1rmacos r\u00e1pidamente. El cribado virtual se ha convertido recientemente en un complemento \u00fatil de los m\u00e9todos de cribado experimentales high-throughput screening para grandes librer\u00edas de compuestos. Por lo tanto, en esta tesis se ha llevado a cabo un protocolo de cribado virtual, mediante aproximaciones basadas en el receptor y en ligandos activos conocidos, con el fin de encontrar antagonistas de cxcr4 y ccr5 que puedan servir como potenciales inhibidores de entrada del vih. para el cribado virtual basado en el receptor, se han mejorado los modelos de los co-receptores cxcr4 y ccr5 construidos en la secci\u00f3n de dise\u00f1o molecular del iqs, y se han llevado a cabo ensayos preliminares de modo de uni\u00f3n utilizando estos modelos y ligandos conocidos de elevada afinidad. Asimismo, se ha analizado el comportamiento en el cribado virtual y en el post-procesado de resultados de docking de diferentes fingerprints de interacci\u00f3n en comparaci\u00f3n con los resultados obtenidos por un nuevo fingerprint de interacci\u00f3n (apif) desarrollado en la secci\u00f3n de dise\u00f1o molecular del iqs. para el cribado virtual basado en ligandos, se han comparado modelos farmacof\u00f3ricos y diversas aproximaciones basadas en la forma y propiedades moleculares utilizando ligandos de elevada afinidad como mol\u00e9culas de referencia. Adem\u00e1s, se ha desarrollado una nueva aproximaci\u00f3n basada en la forma molecular, la cual se ha utilizado para estudiar en profundidad la hip\u00f3tesis de la multi-regi\u00f3n de uni\u00f3n de la cavidad de uni\u00f3n extracelular del co-receptor ccr5. todos los m\u00e9todos, ya sean basados en el receptor o en ligandos conocidos, se han aplicado en primer lugar de manera retrospectiva utilizando una extensa base de datos de inhibidores de cxcr4\/ccr5 y supuestos inactivos, similares en propiedades a los activos, recopilada en esta tesis. Para cada receptor, la quimioteca ha sido cribada utilizando inhibidores conocidos, se han analizado los factores de enriquecimiento y la diversidad en las listas finales de hits. Adem\u00e1s, se han llevado a cabo an\u00e1lisis roc para ambos inhibidores de cxcr4 y ccr5 con el fin de comparar la habilidad del nuevo algoritmo basado en la igualdad de formas de ligandos con el resto de aproximaciones de cribado utilizadas. una vez validadas las diferentes aproximaciones de cribado y seleccionados los mejores par\u00e1metros para cada una de ellas, se han aplicado las herramientas de cribado virtual de manera prospectiva sobre una quimioteca combinatoria dise\u00f1ada en la secci\u00f3n de dise\u00f1o molecular del iqs, as\u00ed como t\u00e9cnicas de dise\u00f1o de novo de ligandos para identificar nuevos bloqueadores de la entrada del vih a las c\u00e9lulas.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Herramientas de cribado virtual aplicadas a inhibidores de entrada del vih. dise\u00f1o de nuevos compuestos anti-vih<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Herramientas de cribado virtual aplicadas a inhibidores de entrada del vih. dise\u00f1o de nuevos compuestos anti-vih <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Violeta Isabel P\u00e9rez Nueno <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Ram\u00f3n llull<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 25\/05\/2009<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Jordi Teixid\u00f3 Closa<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: llu\u00eds Comellas riera <\/li>\n<li>bernard Maigret (vocal)<\/li>\n<li>jordi Mestres lopez (vocal)<\/li>\n<li>Elena Escubedo rafa (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Violeta Isabel P\u00e9rez Nueno Los inhibidores de entrada del vih han surgido recientemente como una nueva generaci\u00f3n 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