{"id":96605,"date":"2018-03-11T10:16:52","date_gmt":"2018-03-11T10:16:52","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/implementation-and-development-of-methods-of-labeling-for-the-analysis-of-rna-and-dna-based-on-microarray-technology\/"},"modified":"2018-03-11T10:16:52","modified_gmt":"2018-03-11T10:16:52","slug":"implementation-and-development-of-methods-of-labeling-for-the-analysis-of-rna-and-dna-based-on-microarray-technology","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/barcelona\/implementation-and-development-of-methods-of-labeling-for-the-analysis-of-rna-and-dna-based-on-microarray-technology\/","title":{"rendered":"Implementation and development of methods of labeling for the analysis of rna and dna based on microarray technology"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Elena Aibar Duran <\/strong><\/h2>\n<p>A mediados de los a\u00f1os 90 cient\u00edficos entre ellos stephen fodor, y michael pirrung desarrollaron una revolucionaria tecnolog\u00eda para la determinaci\u00f3n y cuantificaci\u00f3n de adn en una muestra. Esta tecnolog\u00eda desembocar\u00eda posteriormente en la primera plataforma de microarrays de adn, denominada entonces genechip de affymetrix. el desarrollo de la tecnolog\u00eda de microarrays de dna, tambi\u00e9n llamados chips o microchips de dna permite fijar covalentemente a un soporte s\u00f3lido (vidrio, nitrocelulosa, nylon etc.) Desde centenares hasta decenas de miles de sondas moleculares (fragmentos de dna, prote\u00ednas, etc), en un espacio muy reducido.  la principal ventaja de esta novedosa tecnolog\u00eda frente a los m\u00e9todos tradicionales (northern, southern, etc) reside en la alta densidad de integraci\u00f3n (cantidad) de material biol\u00f3gico que se consigue inmovilizar, es decir la posibilidad de analizar simult\u00e1neamente miles de genes. Con el avance de la t\u00e9cnica de inmovilizaci\u00f3n de muestras, se han desarrollado diversos tipos de microarrays: cadenas de oligonucle\u00f3tidos, cdna, prote\u00ednas y tejidos. Esto supone un gran avance tanto en escalado como en sensibilidad de detecci\u00f3n, ya que los vol\u00famenes de trabajo son muy peque\u00f1os, lo que supone a su vez mayores concentraciones de reactivos y cin\u00e9ticas de hibridaci\u00f3n m\u00e1s r\u00e1pidas. la  primera aplicaci\u00f3n de los microarrays de adn fue el an\u00e1lisis gen\u00e9tico, pero en los \u00faltimos a\u00f1os su aplicabilidad ha ido en aumento, ampliando el abanico de \u00edtems a interrogar tales como el an\u00e1lisis de mutaciones  y detecci\u00f3n de polimorfismos (snp), identificaci\u00f3n de copias g\u00e9nicas en un genoma (acgh), an\u00e1lisis de alternative splicing , an\u00e1lisis del patr\u00f3n de metilaci\u00f3n de islas cpg (mso), secuenciaci\u00f3n, an\u00e1lisis de interacciones de prote\u00ednas con el dna in vivo (chip-on-chip), estudio de los microarns y su funci\u00f3n en la regulaci\u00f3n de genes, etc. debido a la necesidad de manejo de gran cantidad de datos tanto de bases de datos con informaci\u00f3n gen\u00f3mica para el dise\u00f1o de sondas (probes), como de los datos resultantes de la experimental del microarray, requiere el uso de potentes herramientas inform\u00e1ticas para ello.    objetivos el objetivo de esta tesis es aportar m\u00e9todos de marcaje para distintas aplicaciones de la tecnolog\u00eda de microarrays. para cada aplicaci\u00f3n se ha desarrollado e implementado un proceso de marcaje espec\u00edfico y un dise\u00f1o de oligonucle\u00f3tidos que componen el microarray tambi\u00e9n espec\u00edfico, de manera que dise\u00f1o de microarray y metodolog\u00eda de marcaje est\u00e1n estrechamente ligados.  Todos los procedimientos experimentales de esta tesis atienden a un marcaje global del conjunto de la muestra.   las cuatro cap\u00edtulos desarrollados en este trabajo se enfocan en : el estudio de cambios de expresi\u00f3n g\u00e9nica (gene expression), estudio de cambio de presencia de isoformas (alternative splicing), el estudio de cambios de dosis g\u00e9nicas (acgh) y por \u00faltimo el estudio de cambios en el patr\u00f3n de metilaci\u00f3n de islas cpg (mso) entre dos muestras a comparar.  para el dise\u00f1o de microarrays, evaluaci\u00f3n y an\u00e1lisis de datos tambi\u00e9n se recoge en este trabajo una descripci\u00f3n e interpretaci\u00f3n de softwares inform\u00e1ticos, bien desarrollados en la empresa oryzon genomics o bien comerciales.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Implementation and development of methods of labeling for the analysis of rna and dna based on microarray technology<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Implementation and development of methods of labeling for the analysis of rna and dna based on microarray technology <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Elena Aibar Duran <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Barcelona<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 16\/10\/2009<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Tamara Maes<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Luis Montuenga badia <\/li>\n<li>lauro Sumoy (vocal)<\/li>\n<li>  (vocal)<\/li>\n<li>  (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Elena Aibar Duran A mediados de los a\u00f1os 90 cient\u00edficos entre ellos stephen fodor, y michael pirrung [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-sidebar-layout":"default","site-content-layout":"","ast-site-content-layout":"","site-content-style":"default","site-sidebar-style":"default","ast-global-header-display":"","ast-banner-title-visibility":"","ast-main-header-display":"","ast-hfb-above-header-display":"","ast-hfb-below-header-display":"","ast-hfb-mobile-header-display":"","site-post-title":"","ast-breadcrumbs-content":"","ast-featured-img":"","footer-sml-layout":"","theme-transparent-header-meta":"","adv-header-id-meta":"","stick-header-meta":"","header-above-stick-meta":"","header-main-stick-meta":"","header-below-stick-meta":"","astra-migrate-meta-layouts":"default","ast-page-background-enabled":"default","ast-page-background-meta":{"desktop":{"background-color":"var(--ast-global-color-4)","background-image":"","background-repeat":"repeat","background-position":"center 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