{"id":97145,"date":"2009-11-11T00:00:00","date_gmt":"2009-11-11T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/analisis-genomico-y-funcional-de-la-interaccion-planta-pseudomonas-putida-kt2440-en-la-rizosfera-colonizacion-y-resistencia-sistemica\/"},"modified":"2009-11-11T00:00:00","modified_gmt":"2009-11-11T00:00:00","slug":"analisis-genomico-y-funcional-de-la-interaccion-planta-pseudomonas-putida-kt2440-en-la-rizosfera-colonizacion-y-resistencia-sistemica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/bioquimica-molecular\/analisis-genomico-y-funcional-de-la-interaccion-planta-pseudomonas-putida-kt2440-en-la-rizosfera-colonizacion-y-resistencia-sistemica\/","title":{"rendered":"An\u00e1lisis gen\u00f3mico y funcional de la interacci\u00f3n planta-pseudomonas putida kt2440 en la rizosfera: colonizaci\u00f3n y resistencia sist\u00e9mica"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Miguel \u00e1ngel Matilla V\u00e1zquez <\/strong><\/h2>\n<p>El entorno de la ra\u00edz y la regi\u00f3n del suelo que la rodea constituyen la rizosfera, un h\u00e1bitat de elevada actividad microbiol\u00f3gica. Al inicio de este trabajo sab\u00edamos que la bacteria pseudomonas putida kt2440 es una eficiente colonizadora de la rizosfera y la espermosfera de plantas con relevancia agron\u00f3mica (ej. Zea mays). En esta tesis doctoral se presenta el primer an\u00e1lisis gen\u00f3mico con microarrays llevado a cabo con una bacteria en la rizosfera. Este estudio tiene la originalidad de considerar el estilo de vida s\u00e9sil y ha desvelado que el microorganismo ajusta su expresi\u00f3n g\u00e9nica a este particular estilo de vida. Entre los 90 genes rup (rhizosphere up-regulated) con inducci\u00f3n preferencial identificados, resultaron de especial inter\u00e9s rup2560, perteneciente al sistema de secreci\u00f3n de una hemoperoxidasa extracelular codificada por el locus pp2561, y rup4959, que codifica un regulador de respuesta con dominios ggdef\/eal. Estos dominios enzim\u00e1ticos est\u00e1n implicados en la s\u00edntesis y degradaci\u00f3n, respectivamente, del segundo mensajero intracelular diguanilato c\u00edclico (di-gmpc), del que es conocido su papel en la transici\u00f3n de sesilidad a motilidad. Evaluando la eficiencia competitiva de algunos mutantes en genes rup se han identificado nuevas funciones bacterianas relevantes en colonizaci\u00f3n tales como el metabolismo de compuestos arom\u00e1ticos y la resistencia a estr\u00e9s oxidativo.  aunque se hab\u00edan descrito ciertas propiedades de kt2440 en la promoci\u00f3n del crecimiento, no se hab\u00eda explorado su potencial en biocontrol. Un aspecto importante de este trabajo ha sido evidenciar la capacidad de kt2440 para proteger a la planta modelo arabidopsis thaliana de la infecci\u00f3n por el fitopat\u00f3geno p. Syringae mediante resistencia sist\u00e9mica inducida (isr). Excepcionalmente, la manifestaci\u00f3n de resistencia sist\u00e9mica en presencia de kt2440 requiere las v\u00edas de se\u00f1alizaci\u00f3n de salic\u00edlico y de jasm\u00f3nico\/etileno intactas. Adem\u00e1s, la utilizaci\u00f3n de un mutante pp2561 nos ha permitido establecer una relaci\u00f3n entre colonizaci\u00f3n, isr y composici\u00f3n de los exudados radiculares. un aspecto clave en colonizaci\u00f3n es la motilidad bacteriana. Hemos explorado la importancia de la motilidad en superficie en este contexto. La motilidad tipo swarming tiene lugar a temperatura inferior a 30\u00c2\u00bac, es dependiente de pili de tipo iv, de lipopolisac\u00e1ridos y de la disponibilidad intracelular de hierro a trav\u00e9s del sider\u00f3foro pioverdina. La sobreexpresi\u00f3n del gen rup4959 inhibe completamente el swarming y tiene un efecto negativo sobre la colonizaci\u00f3n del \u00e1pice radicular. La transcripci\u00f3n de este gen depende de \u00c2\u00bf38 y se activa en presencia de exudados radiculares y en microaerobiosis. Nuestras evidencias bioqu\u00edmicas indican que rup4959 presenta actividad diguanilato ciclasa. En la rizosfera, esta prote\u00edna es responsable directa o indirectamente de cambios en la transcripci\u00f3n de varios genes. Adem\u00e1s del efecto sobre la motilidad, la sobreexpresi\u00f3n de este gen provoca la aparici\u00f3n de un fenotipo pleiotr\u00f3pico consistente en, (i) la sobreproducci\u00f3n de exopolisac\u00e1ridos, (ii) la mayor formaci\u00f3n de biopel\u00edculas, tanto en superficies abi\u00f3ticas como en la interfase aire-l\u00edquido, y (iii) la aparici\u00f3n de una morfolog\u00eda de colonia rugosa. En la formaci\u00f3n de biofilm es esencial la adhesina lapa, aunque un mutante en esta prote\u00edna todav\u00eda manifestaba alteraci\u00f3n en los otros dos caracteres fenot\u00edpicos. Sin embargo un exopolisac\u00e1rido espec\u00edfico de kt2440, a\u00fan sin caracterizar, y los lipopolisac\u00e1ridos fueron esenciales para la implantaci\u00f3n del fenotipo pleiotr\u00f3pico causado por un incremento en los niveles de di-gmpc.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>An\u00e1lisis gen\u00f3mico y funcional de la interacci\u00f3n planta-pseudomonas putida kt2440 en la rizosfera: colonizaci\u00f3n y resistencia sist\u00e9mica<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 An\u00e1lisis gen\u00f3mico y funcional de la interacci\u00f3n planta-pseudomonas putida kt2440 en la rizosfera: colonizaci\u00f3n y resistencia sist\u00e9mica <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Miguel \u00e1ngel Matilla V\u00e1zquez <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 Granada<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 11\/11\/2009<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Juan  Luis Ramos Martin<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: Marta Mart\u00edn basanta <\/li>\n<li>Jes\u00fas Mercado blanco (vocal)<\/li>\n<li>pieter Van dillewijn (vocal)<\/li>\n<li>cayo Juan Ramos rodriguez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Miguel \u00e1ngel Matilla V\u00e1zquez El entorno de la ra\u00edz y la regi\u00f3n del suelo que la rodea 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