{"id":97935,"date":"2009-11-12T00:00:00","date_gmt":"2009-11-12T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/genomica-y-proteomica-de-la-infeccion-por-circovirus-porcino-tipo-2-pcv2\/"},"modified":"2009-11-12T00:00:00","modified_gmt":"2009-11-12T00:00:00","slug":"genomica-y-proteomica-de-la-infeccion-por-circovirus-porcino-tipo-2-pcv2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/cordoba\/genomica-y-proteomica-de-la-infeccion-por-circovirus-porcino-tipo-2-pcv2\/","title":{"rendered":"Genomica y proteomica de la infeccion por circovirus porcino tipo 2 (pcv2)"},"content":{"rendered":"<h2>Tesis doctoral de <strong> Mar\u00eda Ramirez Boo <\/strong><\/h2>\n<p>El circovirus porcino tipo 2  ha sido identificado como el agente causal de llamado s\u00edndrome del destete porcino (pmws), que afecta a lechones y causa importantes p\u00e9rdidas econ\u00f3micas en todo el mundo. Se sabe que el sistema inmune del cerdo esta implicado en la enfermedad y que los cerdos afectados sufren una profunda alteraci\u00f3n en su inmunorespuesta. No obstante, hasta la fecha poco se sabe del mecanismo subyacente a la patog\u00e9nesis de pmws y de la interacci\u00f3n del virus con el sistema inmune del hospedador. En este trabajo, presentamos un estudio gen\u00f3mico y prote\u00f3mico en n\u00f3dulos linf\u00e1ticos de lechones previamente inoculados con pcv2, con el objetivo de aportar informaci\u00f3n sobre la patog\u00e9nesis de la enfermedad de una forma global y determinar que rutas pueden estar afectadas despu\u00e9s de la infecci\u00f3n.   con respecto a la tecnolog\u00eda de microarrays, se utiliz\u00f3 el chip porcino de affimetrix (genechip\u00c2\u00ae porcine genome array). Despu\u00e9s del an\u00e1lisis estad\u00edstico, 71 genes fueron encontrados sobrexpresados y 86 subregulados. Estos resultados fueron validados por qrt-pcr y el an\u00e1lisis de estos genes con herramientas bioinform\u00e1ticas (array unlock y ingenuity pathway an\u00e1lisis) revel\u00f3 la alteraci\u00f3n de distintas funciones y rutas tras la infecci\u00f3n. Entre las m\u00e1s destacadas se encuentran ciclo celular, transporte molecular y metabolismo lip\u00eddico. En lo que respecta a la respuesta inmune al pcv2, la se\u00f1alizaci\u00f3n mediada por quimioquinas, tlrs o por el factor de activaci\u00f3n de la c\u00e9lulas b resultaron afectadas as\u00ed como diferentes prote\u00ednas (nf\u00c2\u00bfb, ifn\u00c2\u00bf, il12 and p38 mapk) con un importante papel reconocido en la modulaci\u00f3n de la respuesta inmune.   con respecto a la aproximaci\u00f3n prote\u00f3mica, se utilizaron dos estrat\u00e9gias: 2-de y electroforesis monodimensional seguida de digesti\u00f3n en gel, marcaje isot\u00f3pico de p\u00e9ptidos con 16o\/18o e identificaci\u00f3n y cuantificaci\u00f3n de p\u00e9ptidos por trampa i\u00f3nica lineal. El uso combinado de ambas estrategias ha permitido identificar prote\u00ednas de membrana, prote\u00ednas de tama\u00f1o o punto isoel\u00e9ctrico extremo as\u00ed como isoformas o modificaciones postraducionales. Los resultados obtenidos por las dos aproximaciones fueron concordantes y complementarios, siendo el marcaje isot\u00f3pico una alternativa mas robusta para llevar a cabo estudios de cuantificaci\u00f3n. En total, 1493 prote\u00ednas fueron identificadas, 794 cuantificadas y se encontraron m\u00e1s de 100 diferencialmente reguladas. El an\u00e1lisis de estas prote\u00ednas con las herramientas bioinform\u00e1ticas citadas revelo que son tres las rutas can\u00f3nicas m\u00e1s alteradas, respuesta en fase aguda, estr\u00e9s oxidativo mediado por nrf-2 y endocitosis caveolar, indicando su posible implicaci\u00f3n en la respuesta del cerdo a la infecci\u00f3n por el circovirus. Adem\u00e1s, la tetraspanina cd81 result\u00f3 estar sobrexpresada, sugiriendo su posible papel en la internalizaci\u00f3n del virus. Por tanto, se ha comprobado que el uso combinado de t\u00e9cnicas de microarrays y prote\u00f3mica junto con el uso de herramientas bioinform\u00e1ticas abre un nuevo e importante camino para conseguir un conocimiento m\u00e1s exhaustivo y sistem\u00e1tico de las interacciones virus-pat\u00f3geno.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00ab<strong>Genomica y proteomica de la infeccion por circovirus porcino tipo 2 (pcv2)<\/strong>\u00ab<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Genomica y proteomica de la infeccion por circovirus porcino tipo 2 (pcv2) <\/li>\n<li><strong>Autor:<\/strong>\u00a0 Mar\u00eda Ramirez Boo <\/li>\n<li><strong>Universidad:<\/strong>\u00a0 C\u00f3rdoba<\/li>\n<li><strong>Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 11\/12\/2009<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h3>Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n<ul>\n<li><strong>Director de la tesis<\/strong>\n<ul>\n<li>Angela Moreno Lopez<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<li><strong>Tribunal<\/strong>\n<ul>\n<li>Presidente del tribunal: diego Llanes  ruiz <\/li>\n<li>Manuel gonzalo Claros diaz (vocal)<\/li>\n<li>angel Luis Lopez  carrascosa (vocal)<\/li>\n<li>Jes\u00fas Vazquez cobos (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Tesis doctoral de Mar\u00eda Ramirez Boo El circovirus porcino tipo 2 ha sido identificado como el agente causal de llamado 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