{"id":99710,"date":"2010-12-03T00:00:00","date_gmt":"2010-12-03T00:00:00","guid":{"rendered":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/sin-categoria\/diversity-dynamics-and-activity-of-mesophilic-archaea-in-stratified-freshwater-lakes-implications-in-biogeochemical-cycles\/"},"modified":"2010-12-03T00:00:00","modified_gmt":"2010-12-03T00:00:00","slug":"diversity-dynamics-and-activity-of-mesophilic-archaea-in-stratified-freshwater-lakes-implications-in-biogeochemical-cycles","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.deberes.net\/tesis\/microbiologia\/diversity-dynamics-and-activity-of-mesophilic-archaea-in-stratified-freshwater-lakes-implications-in-biogeochemical-cycles\/","title":{"rendered":"Diversity, dynamics and activity of mesophilic archaea in stratified freshwater lakes. implications in biogeochemical cycles."},"content":{"rendered":"

Tesis doctoral de Marc Llir\u00f3s Dupr\u00e9 <\/strong><\/h2>\n

La diversidad (riqueza y abundancia), la distribuci\u00f3n y la din\u00e1mica de las poblaciones de archaea planct\u00f3nicas presentes en distintos ambientes lacustres estratificados templados fue estudiada para aportar evidencias de su implicaci\u00f3n en los ciclos biogeoqu\u00edmicos imperantes de dichos ecosistemas. con el fin de estudiar la distribuci\u00f3n y la din\u00e1mica de la comunidad planct\u00f3nica de archaea presentes en la laguna del vilar se utiliz\u00f3 una aproximaci\u00f3n molecular basada en el gen 16s rrna durante un periodo de cinco a\u00f1os consecutivos (2001-2005). Los resultados pusieron de manifiesto que la laguna presentaba una comunidad de archaea poco abundante aunque muy rica, principalmente formada por los grupos mcg (miscellaneous crenarchaotic group) y dhve (deep hydrothermal vent euryarchaeota) recuperados principalmente en el hipolimnion an\u00f3xico de la laguna. Estos filotipos se mantuvieron a lo largo del periodo de estudio mientras que otros grupos menos habituales aparec\u00edan de forma ocasional. No se pudieron establecer correlaciones significativas entre la composici\u00f3n de la comunidad de archaea y las condiciones fisicoqu\u00edmicas imperantes en el periodo estudiado a pesar de las diferencias detectadas en relaci\u00f3n a la distribuci\u00f3n de la riqueza y la estacionalidad de los filotipos recuperados. A su vez, la comunidad planct\u00f3nica de archaea de una laguna hipereutr\u00f3fica de la misma regi\u00f3n mostr\u00f3 un claro predominio de los filotipos relacionados con el grupo mcg y methanosaeta. En dicha laguna, ambos grupos fueron mayormente recuperados en el hipolimnion an\u00f3xico y rico en sulfh\u00eddrico. A pesar de la inesperada gran riqueza de la comunidad planct\u00f3nica de archaea en ambas lagunas estratificadas, su baja abundancia indicar\u00eda que las condiciones presentes no serian las \u00f3ptimas para su crecimiento. As\u00ed pues, la comunidad de archaea constituir\u00eda un sumidero de filotipos (seed-bank) esperando unas condiciones m\u00e1s propicias para su desarrollo. En cambio, la imagen que se obtuvo del lago kivu, un lago africano oligotr\u00f3fico y merom\u00edctico de origen volc\u00e1nico situado entre rwanda y la rep\u00fablica democr\u00e1tica del congo, fue totalmente distinto. En este lago, la comunidad de archaea estaba formada principalmente por linajes de archaea oxidadoras de amonio (aoa; relacionados con las crenarchaeota marine group i.1a y soil group i.1b). A su vez, la estructura de la comunidad era claramente distinta por debajo de la redoxclina, con un predominio de los linajes mcg y metanogenos. con el fin de determinar la actividad potencial de las comunidades de archaea estudiadas, se aplicaron dos aproximaciones distintas. En primer lugar, nos centramos en la detecci\u00f3n de un gen clave en la nitrificaci\u00f3n realizada por archaea (el gen amoa de archaea, que codifica para la subunidad \u00c2\u00bf de la enzima amonio monooxigenasa). Esta aproximaci\u00f3n se realiz\u00f3 con \u00e9xito en muestras del lago kivu. La coincidencia de se\u00f1ales moleculares m\u00e1s intensas para este gen con m\u00e1ximos de nitrito y nitrato en la redoxclina evidenciaron que las aoa podr\u00edan estar activamente implicadas en los procesos de nitrificaci\u00f3n del lago. Adem\u00e1s, los resultados mostraron una segregaci\u00f3n de acuerdo con el ambiente de detecci\u00f3n del gen amoa de archaea y con el hecho de encontrar cantidades bajas o muy bajas de materia org\u00e1nica. En segundo lugar y con el fin de detectar aquellas archaea que incorporaban activamente bicarbonato como fuente de carbono, se utiliz\u00f3 una aproximaci\u00f3n a nivel de c\u00e9lula individual combinando el uso de un trazador radioactivo (nah14co3) con la hibridaci\u00f3n in situ fluorescente. Esta aproximaci\u00f3n se realiz\u00f3 en la laguna hipereutr\u00f3fica de coromina. Los experimentos de incubaci\u00f3n in situ utilizando nah14co3 mostraron un predominio de los procesos f\u00f3ticos en relaci\u00f3n a los af\u00f3ticos o quimiotr\u00f3ficos tanto en el epi- como en el metalimnion de la laguna donde los microorganismos fototr\u00f3ficos, tanto oxig\u00e9nicos como anoxig\u00e9nicos, dominaban la comunidad planct\u00f3nica. Adem\u00e1s, los resultados de los an\u00e1lisis de micro-card-fish revelaron una baja contribuci\u00f3n (entre un 2 y un 10%) de las archaea planct\u00f3nicas en los procesos de fijaci\u00f3n oscura de carbono. En este sentido, los resultados anteriores junto con la acumulaci\u00f3n de compuestos reducidos en la columna de agua de la laguna sugerir\u00edan que estas archaea realizar\u00edan un metabolismo hetero- o mixotr\u00f3fico. Por otro lado, los resultados de micro-card-fish revelaron tambi\u00e9n la presencia de c\u00e9lulas hibridadas con la sonda para el grupo cytophaga-flavobacteria-bacteroidetes, lo que supone ampliar las capacidades metab\u00f3licas descritas hasta la fecha para este amplio grupo bacteriano. finalmente, otro aspecto tratado en la presente tesis doctoral fue analizar los patrones globales de distribuci\u00f3n de las archaea mes\u00f3filas. En este sentido se realiz\u00f3 un an\u00e1lisis a nivel de linaje de la distribuci\u00f3n global de las archaea lacustres combinando secuencias del gen 16s rrna y distintas herramientas estad\u00edsticas y de ecolog\u00eda general. En este sentido, se determin\u00f3 que el ox\u00edgeno y la salinidad eran las principales fuerzas ambientales que determinar\u00edan la distribuci\u00f3n global de las archaea mes\u00f3filas en ambientes lacustres. Por otro lado, el grupo mcg se mostr\u00f3 como el grupo indicador para los ambientes lacustres estratificados de agua dulce con una sulfureta activa, como por ejemplo la laguna del vilar y coromina. Por otro lado, el grupo marine crenarchaeota group i.1a fue definido como indicador para los ambientes lacustres oligotr\u00f3ficos, como el lago kivu.<\/p>\n

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Datos acad\u00e9micos de la tesis doctoral \u00abDiversity, dynamics and activity of mesophilic archaea in stratified freshwater lakes. implications in biogeochemical cycles.<\/strong>\u00ab<\/h3>\n
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  • T\u00edtulo de la tesis:<\/strong>\u00a0 Diversity, dynamics and activity of mesophilic archaea in stratified freshwater lakes. implications in biogeochemical cycles. <\/li>\n
  • Autor:<\/strong>\u00a0 Marc Llir\u00f3s Dupr\u00e9 <\/li>\n
  • Universidad:<\/strong>\u00a0 Girona<\/li>\n
  • Fecha de lectura de la tesis:<\/strong>\u00a0 12\/03\/2010<\/li>\n<\/ul>\n

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    Direcci\u00f3n y tribunal<\/h3>\n
      \n
    • Director de la tesis<\/strong>\n
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      • Carles Borrego More<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n
      • Tribunal<\/strong>\n
          \n
        • Presidente del tribunal: ricard Guerrero moreno <\/li>\n
        • Mar\u00eda ramos Martinez alonso (vocal)<\/li>\n
        • carles Pedr\u00f3s ali\u00f3 (vocal)<\/li>\n
        • Antonio Camacho gonz\u00e1lez (vocal)<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n

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